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UCP1激動劑CL316243也得到了類似的結(jié)果。這些結(jié)果表明,UCP1參與了AKI中脂質(zhì)積累的調(diào)節(jié)。為了進(jìn)一步驗證這一調(diào)控關(guān)系,提高證據(jù)的可靠性,我們采用腎多點注射UCP1特異性過表達(dá)腺病毒的方法建立AKI過表達(dá)UCP1的動物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示,過表達(dá)UCP1可***緩解AKI動物模型中的脂質(zhì)積累(圖3E)。***,使用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中誘導(dǎo)UCP1過表達(dá),也觀察到了相同的結(jié)果(圖3F-H)。因此,所有證據(jù)表明,隨著UCP1表達(dá)的增加,AKI模型中的脂質(zhì)含量降低。提供整體課題外包實驗構(gòu)思。NF-kB課題協(xié)同創(chuàng)作
接下來,我們合成了野生型HuR蛋白(WT)和HuR蛋白的截短突變體(即分別為單獨HuR的RNA識別基序(RRM)1的突變體B1、單獨HuR RRM2的突變體B2和單獨HuR RRM3的突變體B3)(圖4 C)。同時,我們設(shè)計并合成了生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,分別特異性靶向lnc-PMIF的中心-莖環(huán)和生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,特異性靶向之前報道的與HuR蛋白相互作用的β-actin mRNA的序列。RNA電泳遷移率變動分析(EMSA)發(fā)現(xiàn)只有當(dāng)生物素標(biāo)記的lnc-PMIF探針與WT HuR或截短突變體B3共孵育時,才能檢測到lnc-PMIF-HuR復(fù)合物,這表明HuR的RRM3可介導(dǎo)HuR和lnc-PMIF之間的相互作用。lnc-PMIF與β-actin mRNA競爭與HuR相互作用。過表達(dá)HuR-RRM3后細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)下降***上調(diào),遷移活性增強(qiáng)。所有這些表明lnc-PMIF可與HuR的RRM3結(jié)合,中斷HuR-β-actin的相互作用,抑制β-actin的表達(dá),抑制OPC的遷移。RNA PULLdown課題產(chǎn)學(xué)研合作使用motif和CHIP-seq預(yù)測影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。
接著作者為了進(jìn)一步證明YTHDC2與LUAD的關(guān)系,與相鄰的*旁組織相比,在LUAD**中觀察到Y(jié)THDC2 mRNA和蛋白的***下調(diào)(圖1E-G),組織芯片檢測(TMA)評估cohort #1中YTHDC2的表達(dá),結(jié)果顯示51% (98/192) LUAD患者的YTHDC2表達(dá)下調(diào)(圖1H、I)。值得注意的是,YTHDC2表達(dá)下調(diào)與更大的**直徑和更晚期的分期相關(guān)(圖1J、K)。表明抑制YTHDC2可促進(jìn)LUAD的**進(jìn)展。
2.過表達(dá)YTHDC2抑制細(xì)胞活力和**發(fā)生
為了探索YTHDC2在體內(nèi)的m6A解讀器功能,作者構(gòu)建AAV5表達(dá)系統(tǒng)(KPYWT、KPYΔYTH和對照KPE)(圖2A)。與KPE小鼠***25周后的**相比,KPYWT和KPYΔYTH小鼠的**證實了YTHDC2持續(xù)上調(diào)(圖2B),這表明AAV5表達(dá)系統(tǒng)具有持久的效率。雖然YTHDC2不能阻止**的發(fā)生,但**發(fā)生時間延遲,**負(fù)荷明顯受到抑制,KPYWT小鼠的生存時間比KPE小鼠和KPYΔYTH小鼠更長(圖2C-F)。
5)上調(diào)UCP1緩解AKI期間的脂質(zhì)積累,***抑制疾病進(jìn)展
為了在體內(nèi)驗證脂質(zhì)對AKI功能的影響,我們通過在腎臟多點注射過表達(dá)UCP1腺病毒,構(gòu)建過表達(dá)UCP1動物模型,以消除脂質(zhì)在AKI中的堆積。在UCP1過表達(dá)動物模型中,腎損傷指標(biāo)NGAL明顯降低(圖5A)。HE和PAS染色顯示腎臟形態(tài)有很大改善,腎小管損傷評分顯示,在UCP1介導(dǎo)的脂質(zhì)消耗增加后,腎小管損傷程度明顯降低(圖5B-C)。順鉑刺激后腎小管呈空泡變性,細(xì)胞扁平,管腔擴(kuò)張,而UCP1過表達(dá)明顯改善了病理改變。血清肌酐(SCr)和尿素氮(BUN)這兩項腎臟損傷指標(biāo)也出現(xiàn)了類似的***下降(圖5D-E)。利用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中緩解脂堆積,進(jìn)一步驗證了上述結(jié)果。***后NGAL***降低(圖5F),腎臟形態(tài)、腎小管損傷評分、SCr、BUN均***改善(圖5G-J)。因此,在體內(nèi),上調(diào)UCP1以緩解AKI脂質(zhì)積累可以抑制AKI進(jìn)展。 動物建模模型實驗的整體服務(wù)。
5)上調(diào)UCP1緩解AKI期間的脂質(zhì)積累,***抑制疾病進(jìn)展
為了在體內(nèi)驗證脂質(zhì)對AKI功能的影響,我們通過在腎臟多點注射過表達(dá)UCP1腺病毒,構(gòu)建過表達(dá)UCP1動物模型,以消除脂質(zhì)在AKI中的堆積。在UCP1過表達(dá)動物模型中,腎損傷指標(biāo)NGAL明顯降低(圖5A)。HE和PAS染色顯示腎臟形態(tài)有很大改善,腎小管損傷評分顯示,在UCP1介導(dǎo)的脂質(zhì)消耗增加后,腎小管損傷程度明顯降低(圖5B-C)。順鉑刺激后腎小管呈空泡變性,細(xì)胞扁平,管腔擴(kuò)張,而UCP1過表達(dá)明顯改善了病理改變。血清肌酐(SCr)和尿素氮(BUN)這兩項腎臟損傷指標(biāo)也出現(xiàn)了類似的***下降(圖5D-E)。利用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中緩解脂堆積,進(jìn)一步驗證了上述結(jié)果。***后NGAL***降低(圖5F),腎臟形態(tài)、腎小管損傷評分、SCr、BUN均***改善(圖5G-J)。因此,在體內(nèi),上調(diào)UCP1以緩解AKI脂質(zhì)積累可以抑制AKI進(jìn)展。 高表達(dá)的外泌體CD44v6和C1QBP是預(yù)測PDAC患者預(yù)后和肝轉(zhuǎn)移的很有前途的生物標(biāo)志物。江蘇課題產(chǎn)學(xué)研合作
caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。NF-kB課題協(xié)同創(chuàng)作
五、YTHDF1以m6a依賴的方式調(diào)控FZD7的表達(dá)
在GC-803和胃*細(xì)胞株基礎(chǔ)上,進(jìn)行m6A-qPCR和YTHDF1 RIP qPCR的基因特異性分析。確實,在FZD7 mRNA中觀察到兩個m6A峰,并且在MGC-803和HGC-27細(xì)胞中證實了與YTHDF1的關(guān)聯(lián)(圖5A和B)。標(biāo)記YTHDF1突變體(YTHDF1- mut)具有兩個關(guān)鍵氨基酸突變(K395A, Y397A)以消除其m6binding口袋(44),將其轉(zhuǎn)染到MGC-803和HGC- 27細(xì)胞中(圖5C)。在YTHDF1野生型(YTHDF1- wt)轉(zhuǎn)染的胃*細(xì)胞中觀察到的FZD7表達(dá)上調(diào)在YTHDF1- mut中被消除,但在YTHDF1-WT和YTHDF1-MUT兩種細(xì)胞系中,F(xiàn)ZD7的mRNA水平相當(dāng)(圖5E)。RIP-qPCR分析顯示,F(xiàn)ZD7 mRNA與突變體YTHDF1的相互作用明顯受損(圖5F)。 NF-kB課題協(xié)同創(chuàng)作
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗