由于p65轉(zhuǎn)位到細(xì)胞核并促進(jìn)其靶向基因的轉(zhuǎn)錄，假設(shè)NFκB/p65信號(hào)通路的***可通過(guò)p65的轉(zhuǎn)錄活性上調(diào)miR-934表達(dá)。在p65和miR-934啟動(dòng)子之間發(fā)現(xiàn)了5個(gè)潛在的轉(zhuǎn)錄結(jié)合區(qū)域和2個(gè)特異性結(jié)合位點(diǎn)（Fig. 8d）。隨后，用miR-934啟動(dòng)子中含有p65結(jié)合區(qū)域的載體轉(zhuǎn)染SW480和RKO細(xì)胞；ChIP實(shí)驗(yàn)證明p65對(duì)miR-934的轉(zhuǎn)錄在-2002和-1500 bp（區(qū)域1）之間的區(qū)域內(nèi)***增高，在其他四個(gè)結(jié)合區(qū)域中未觀察到明顯變化（Fig. 8e）。這些數(shù)據(jù)表明，區(qū)域1可能在調(diào)節(jié)CRC細(xì)胞中p65介導(dǎo)的miR-934轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)中起關(guān)鍵作用。熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)證實(shí)p65對(duì)SW480和RKO細(xì)胞中miR-934啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄影響（Fig. 8f）。作者發(fā)現(xiàn)只有突變結(jié)合位點(diǎn)1可以下調(diào)p65的熒光素酶報(bào)告基因活性，抑制miR-934的轉(zhuǎn)錄表達(dá)，這證明p65可以通過(guò)結(jié)合位點(diǎn)1正向直接調(diào)節(jié)miR-934的表達(dá)(Fig. 8f)。此外，作者證明了SW480和RKO細(xì)胞中的突變結(jié)合位點(diǎn)1可以消除CXCL13的促進(jìn)作用和NFκB/p65信號(hào)對(duì)miR-934表達(dá)的抑制作用(Fig. 8g,h)。綜上所述，這些結(jié)果證明CXCL13/CXCR5/NFκB/p65信號(hào)通路促進(jìn)CRC細(xì)胞中miR-934的轉(zhuǎn)錄，形成一個(gè)正反饋回路，參與持續(xù)的M2巨噬細(xì)胞極化和CRC細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)課題協(xié)同創(chuàng)作
在s-flow條件下，KLF4的TF結(jié)合基元在E2中富集，而NRF1在E3和E4中富集(所有流條件下)(圖6B)。相比之下，暴露于d-flow條件下的E5 E8中，TEF、ETV3、RELA、FOS::JUN、TEAD1和STAT1的TF基序富集(圖6C)。對(duì)一些眾所周知的流量敏感tf的基模的鑒定，KLF4(與KLF2基模相同)，F(xiàn)OS:JUN (AP1)， RELA和TEAD1證實(shí)了我們分析的有效性。為了進(jìn)一步確定新發(fā)現(xiàn)的TF結(jié)合基序是否也與流量依賴反應(yīng)相關(guān)，我們檢測(cè)了phospho -STAT1水平是否對(duì)流量敏感，作為STAT1***的標(biāo)記。pcl術(shù)后2周，與RCA相比，CDH5+ LCA的ECs中phosphoSTAT1水平***升高(圖6D和6E)。機(jī)制研究課題潤(rùn)色服務(wù)soRNA測(cè)序的 整套服務(wù)。
自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進(jìn)行運(yùn)輸、溶解。研究表明，自噬異常會(huì)影響疾病進(jìn)程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發(fā)生會(huì)增強(qiáng)*細(xì)胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會(huì)造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發(fā)**。
1、Meta-GWAS分析
收集三組GWAS數(shù)據(jù)用于meta分析，確定了35個(gè)基因區(qū)域中36個(gè)**的基因突變（p<5×10?8）。接下來(lái)，分析SNP200kb內(nèi)與AD***相關(guān)(p<10-5)的突變，篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個(gè)基因，這6個(gè)基因都存在于AD發(fā)病***相關(guān)的突變。
2、多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分（PRS）
為了評(píng)估AD遺傳景觀的穩(wěn)健性和綜合效應(yīng)，基于39個(gè)遺傳變異（不包括APOE基因型）構(gòu)建了一個(gè)加權(quán)PRS。
接下來(lái)測(cè)試了RPS與臨床診斷的關(guān)聯(lián)。PRS與臨床診斷的AD病例的關(guān)聯(lián)與病理證實(shí)的AD的關(guān)聯(lián)相似；在伴隨的腦部病變（除AD之外）存在的情況下PRS與AD相關(guān)；在不同性別中，RPS與AD的相關(guān)性無(wú)差異，并且在早發(fā)型、晚發(fā)型中效果一致。
3、PRS有可能及早識(shí)別有風(fēng)險(xiǎn)的受試者
使用12,386例樣本分析RPS能否識(shí)別早發(fā)型AD（AAO），結(jié)果表明，PRS與APOE基因型相結(jié)合，可能對(duì)AAO進(jìn)行有效的預(yù)測(cè)。
腸道菌群與結(jié)直腸*(CRC)之間的關(guān)聯(lián)已被***研究。然而，用于多個(gè)人群的早期診斷標(biāo)記仍然難以捉摸。本研究對(duì)1056例糞便樣本進(jìn)行了綜合分析，以確定與CRC相關(guān)的微生物作為早期檢測(cè)CRC的標(biāo)志物。
對(duì)來(lái)自4項(xiàng)研究的16srRNA測(cè)序進(jìn)行分析，評(píng)估隨著CRC進(jìn)展（無(wú)疾病-腺瘤-結(jié)直腸*）腸道微生物的變化，并鑒定出針對(duì)腺瘤的為微生物標(biāo)志物。
2.構(gòu)建腺瘤微生物模型
除了使用差異ASV作為關(guān)鍵指標(biāo)，模型構(gòu)建中還包括α多樣性指數(shù)（Shannon指數(shù)，Simpson指數(shù)和ObservedASV）以及三個(gè)患者臨床指標(biāo)（年齡，性別和體重指數(shù)（BMI））。**終構(gòu)建了包括八個(gè)差異性ASV（作為生物標(biāo)記物）以及年齡，性別和BMI為**的模型，可區(qū)分對(duì)照對(duì)象與腺瘤患者（準(zhǔn)確度：0.73，敏感性：0.82，特異性：0.62，精度：0.73，F(xiàn)1得分：0.77）。其中，用ASV區(qū)分腺瘤和**的RF模型達(dá)到了0.89的AUC（精度：0.80，靈敏度：0.66，特異性：0.90，精度：0.83和F1得分：0.72）。 Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。
**調(diào)節(jié)因子通常作為蛋白質(zhì)復(fù)合物中的亞基存在，并以多種方式參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控，例如通過(guò)調(diào)節(jié)組蛋白修飾和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。哺乳動(dòng)物BRG1-或brm相關(guān)的染色質(zhì)重塑復(fù)合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細(xì)胞染色質(zhì)可及性景觀。該復(fù)合物是細(xì)胞周期和增殖的關(guān)鍵調(diào)控因子，也是前列腺*的驅(qū)動(dòng)因子，具有多種**特異性作用。此外，頻繁發(fā)生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復(fù)合物重新靶向于染色質(zhì)，促進(jìn)前列腺*的發(fā)生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復(fù)雜功能的關(guān)鍵組件。此外，AR與DNA序列特異性轉(zhuǎn)錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經(jīng)建立。TF FOXA1可以結(jié)合到封閉的染色質(zhì)區(qū)域，調(diào)節(jié)其染色質(zhì)可及性，從而促進(jìn)AR結(jié)合染色質(zhì)引發(fā)PCa。產(chǎn)生關(guān)于環(huán)境影響疾病的病因和分子機(jī)制的可測(cè)試的假設(shè)。焦亡活化課題一站式
caspase-3抗體是一種***用于檢測(cè)凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)課題協(xié)同創(chuàng)作
通過(guò)半定量分析，胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。Kaplan-Meier生存分析顯示，MAPK1-109aa表達(dá)水平較高的胃*患者總生存期明顯長(zhǎng)于MAPK1-109aa表達(dá)水平較低的胃*患者(圖4h)。一系列GC細(xì)胞系中MAPK1-109aa的含量也明顯低于正常胃粘膜細(xì)胞系GES-1。在內(nèi)源性circMAPK1水平較低且?guī)缀鯖](méi)有MAPK1-109aa表達(dá)的MKN45細(xì)胞中，轉(zhuǎn)染circMAPK1和MAPK1-109aa質(zhì)粒均產(chǎn)生預(yù)測(cè)的MAPK1-109aa帶，而過(guò)表達(dá)circMAPK1IRES突變質(zhì)粒則沒(méi)有產(chǎn)生預(yù)測(cè)的MAPK1-109aa帶(圖4i)。相反，在內(nèi)源性circMAPK1和MAPK1-109aa更高表達(dá)的GES-1細(xì)胞中，發(fā)現(xiàn)兩種特異性靶向circMAPK1連接的shRNA***降低了MAPK1-109aa的表達(dá)(圖4j)。使用anti-flag抗體進(jìn)行免疫熒光檢測(cè)，證實(shí)MAPK1-109aa-Flag位于過(guò)表達(dá)MAPK1-109aa-Flag質(zhì)粒的MKN45細(xì)胞的胞質(zhì)中，如圖4k所示。醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)課題協(xié)同創(chuàng)作
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)