驗證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細(xì)胞中進(jìn)行co-IP，結(jié)果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結(jié)合，進(jìn)而影響自噬指標(biāo)的表達(dá)。
5. 在臨床樣本中檢測STBD1的表達(dá)
在*組織、*旁中檢測STBD1的表達(dá)水平，結(jié)果表明STBD1在*組織中***下調(diào)，與之前的預(yù)測結(jié)果一致。
6.細(xì)胞實驗研究STBD1的功能
在多種*細(xì)胞中進(jìn)行細(xì)胞功能實驗，STBD1抑制*細(xì)胞生長，突變W203C會部分回復(fù)STBD1的抑制作用。
7.動物實驗驗證STBD1的功能
裸鼠成瘤實驗表明，STBD1抑制**生長。
8.轉(zhuǎn)錄組、代謝組分析
在細(xì)胞中干擾STBD1，然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，分析表達(dá)水平***改變的基因，并進(jìn)行通路富集分析。分析發(fā)現(xiàn)，STBD1抑制**生長可能是通過改變基因轉(zhuǎn)錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進(jìn)一步驗證STBD1是否重塑代謝，進(jìn)行代謝組分析。結(jié)果表明，STBD1敲除后糖酵解增強(qiáng)。
9.構(gòu)建LIRCP調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)
將LAMs對應(yīng)蛋白、自噬相關(guān)基因按照生物學(xué)功能聚類，構(gòu)建調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，將自噬與**聯(lián)系起來。 動物建模模型實驗的整體服務(wù)。青海課題實驗外包
二、TBI破壞了NPC和Ran***1的分布，導(dǎo)致TBPH/NPC共聚集
使用鼻咽*標(biāo)記Mab414，它可以識別包括Nup62在內(nèi)的幾個Nups的FG結(jié)構(gòu)域，我們發(fā)現(xiàn)在非tbi控制的果蠅大腦中，核膜上有一個主要的同質(zhì)的環(huán)狀標(biāo)記。非腦外傷對照組的腹神經(jīng)索(VNC)鼻咽*染色呈均勻分布。相比之下，暴露于TBI的vnc核膜NPC染色不規(guī)則，顯示核形態(tài)紊亂。我們在腦外傷后觀察到核膜間隙和聚集(Mab414團(tuán)塊)的出現(xiàn)(圖2A)。TBI腦中Mab414染色異常的細(xì)胞百分比明顯高于非TBI對照(圖2B）。tbi暴露的vnc中Tbph和Mab414的核周和細(xì)胞質(zhì)共聚集，而對照大腦顯示很少或沒有共聚集(圖2C)。定量結(jié)果顯示，與對照組相比，tbi暴露的vnc中具有共聚集的Mab414 tbph陽性細(xì)胞百分比***升高(圖2D)。 青海課題實驗外包可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。
褪黑素可減少TBI誘發(fā)的小鼠腦行為缺陷和病變體積
為了利用褪黑素對TBI誘導(dǎo)的神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)果和病變體積的影響，進(jìn)行了行為分析以及HE染色。關(guān)于線握測試，與假手術(shù)組相比，TBI在第1-8天導(dǎo)致運(yùn)動表現(xiàn)顯著下降，但與TBI組相比，褪黑素和Lip-1的***改善了第2-6天的運(yùn)動表現(xiàn)。在MWM測試中觀察到，與假手術(shù)組相比，TBI在第10-15天導(dǎo)致潛伏期延長，但是褪黑素和Lip-1***的TBI小鼠均表現(xiàn)出比TBI小鼠明顯更短的逃避潛伏期。曠場試驗中，與假手術(shù)組相比，TBI組的動物的總距離、中心移動距離和花費時間明顯縮短。褪黑素***可顯著逆轉(zhuǎn)上述參。HE染色顯示，褪黑素和Lip-1***的TBI組在TBI后第16天的病變體積明顯小于TBI組。兩者合計，結(jié)果提供了褪黑素***小鼠中TBI后改善運(yùn)動，記憶和焦慮結(jié)局以及病變體積的證據(jù)。
2、miR-208b由結(jié)腸*細(xì)胞以外泌體的方式分泌
隨后，作者探究了miR-208b的存在方式是否由外泌體介導(dǎo)。分離鑒定了3株CRC細(xì)胞系的外泌體，并檢測了其中miR-208b的表達(dá)。外泌體中miR-208b的表達(dá)模式和在細(xì)胞中的模式一致，在SW480-OXA***高于SW480***高于NCM460。這些結(jié)果表明CRC中miR-208b的是以外泌體的模式分泌，這可能和順鉑化療敏感性有關(guān)。
3、SW480細(xì)胞分泌的外泌體miR-208b促進(jìn)Treg擴(kuò)增
前人研究表明順鉑會影響**免疫微環(huán)境。MiRNA可能通過促進(jìn)Treg擴(kuò)增誘導(dǎo)免疫侵襲。因此，作者探究了CRC分泌外泌體miR-208b對T細(xì)胞分化的影響。使用siRNA去除miR-208b，然后收集外泌體，將含有不同水平miR-208b的外泌體與原代CD4+T細(xì)胞共培養(yǎng)（圖4A-B）。6h后，受體CD4+T細(xì)胞中miR-208b***增加，尤其是SW480-OXA組，而外泌體miR-208b缺失組則沒有***改變，表明CD4+T細(xì)胞中miR-208b是由外泌體傳輸（圖4C-D）。此外，SW480和SW480-OXA來源外泌體處理組的CD4+CD25highFoxp3+Tregs細(xì)胞數(shù)***增加，而外泌體miR-208b缺失對其陽性細(xì)胞數(shù)則沒有明顯影響。表明外泌體miR-208b促進(jìn)Treg擴(kuò)增。 高通量分子實驗的后續(xù)標(biāo)書申請指導(dǎo)服務(wù)。
HOXBLINClncRNA在NPM1c+白血病中特異性上調(diào)
HOX基因，特別是HOXA和HOXB聚類基因的上調(diào)不僅是AML發(fā)病的特點，也是其主要機(jī)制。HoxBlinclncRNA已經(jīng)被證明是在發(fā)育過程中***前HoxB基因轉(zhuǎn)錄所必需的。為了確定HOXBLINC是否與HOXB基因一起在AML中異常表達(dá)，檢測了正常BMMNC細(xì)胞和CD34+陽性細(xì)胞，以及NPM1c+AML病人中HOXBLINClncRNA的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)HOXBLINClncRNA在NPM1c+AML病人中***高表達(dá)，在TCGA數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)一樣的結(jié)果（圖1A-B）。表明HOXBLINClncRNA在NPM1c+白血病中特異性上調(diào)。 ***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。四川課題服務(wù)價格
TRF測序課題整體服務(wù)。青海課題實驗外包
二、胎兒造血過程中分化軌跡的推斷
接下來，研究者使用力導(dǎo)向圖繪制算法推斷了人類胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的分化軌跡。結(jié)果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端，并且在HSCs/MPPs下游，研究者鑒定了三個高度增殖的寡能祖細(xì)胞群，即MEMPs（紅系細(xì)胞、MKs和肥大細(xì)胞）；GPs（粒細(xì)胞）；LMPs（淋巴樣細(xì)胞、單核細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞）(圖2A和2B）。并使用Scanpy的paga_path函數(shù)顯示了沿三條分化途徑（MEMPs、GPs和LMPs）的譜系特異性基因動態(tài)表達(dá)(圖2C）。MEMPs將hsc / mpp與MKs、紅細(xì)胞和肥大細(xì)胞連接起來。與此一致的是，HSC/MPP向MEMPs轉(zhuǎn)化的差異調(diào)控基因包括MK/紅系/肥大細(xì)胞譜系特異性基因，如GATA1、ITGA2B、PLEK、KLF1、HDC和MS4A3(圖2C)。 青海課題實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
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