此外,為進(jìn)一步驗(yàn)證ELNAT1與hnRNPA1相互作用區(qū)域,使用ELNAT1不同序列缺失進(jìn)行RNA-pull down分析,以評(píng)估ELNAT1和hnRNPA1結(jié)合所需的區(qū)域。結(jié)果發(fā)現(xiàn),ELNAT1序列中600-750 nt位置是其與hnRNPA1交互作用區(qū)域(Figure 4 G, H)。并通過(guò)POSTAR2預(yù)測(cè)ELNAT1在610-680 nt區(qū)域的莖環(huán)結(jié)構(gòu)可能被hnRNPA1識(shí)別(Figure 4 I),而當(dāng)這一區(qū)域缺失時(shí),hnRNPA1減弱對(duì)ELNAT1的富集(Figure 4 J)。因此,這表明這些特定的序列(610-680 nt)對(duì)ELNAT1 hnRNPA1的相互作用至關(guān)重要。
2、CDK4/6i介導(dǎo)的CD8+T細(xì)胞記憶獲得是細(xì)胞固有的
為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細(xì)胞記憶是否由于CDK4/6在這些細(xì)胞內(nèi)的直接抑制,在體外將活化的小鼠CD8+T細(xì)胞暴露于CDK4/6i中,并監(jiān)測(cè)Tcm獲取和分裂數(shù)。***CDK4/6i暴露0、24、72h后,Tcm細(xì)胞平均分裂數(shù)減少,同時(shí)細(xì)胞比例增加,且呈劑量依賴性,*在24h內(nèi)發(fā)生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡(jiǎn)單地抑制分化,而是直接促進(jìn)記憶形成,表明細(xì)胞周期機(jī)制與分化之間存在方向性關(guān)系。通過(guò)3'RNA-seq進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在CDK4/6i處理后,記憶相關(guān)轉(zhuǎn)錄本增加,GSEA分析證實(shí)了記憶相關(guān)特征的富集,以及細(xì)胞周期相關(guān)特征的減少,包括E2F靶點(diǎn)(Fig.2B-E)。矛盾的是,CDK4/6抑制也誘導(dǎo)了效應(yīng)相關(guān)轉(zhuǎn)錄本,包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C),這與之前CDK4/6i促進(jìn)T細(xì)胞活化的報(bào)道一致。 安徽標(biāo)書(shū)實(shí)驗(yàn)可參觀血清代謝產(chǎn)物的豐度也發(fā)生了***變化.
MLL1的募集對(duì)于HoxBlinc過(guò)表達(dá)介導(dǎo)的靶基因表達(dá)和HSPC功能異常至關(guān)重要
由于HoxBlinc招募SETD1A和MLL1復(fù)合物在小鼠ECS衍生的原始紅細(xì)胞祖細(xì)胞的HoxB位點(diǎn)組織活性染色質(zhì)域。所以作者先證實(shí)了人類(lèi)HOXBLINC與MLL1和SETD1A的相互作用。然后體內(nèi)外研究SETD1A和MLL1在HoxBlinc過(guò)表達(dá)介導(dǎo)的HSPC功能異常和白血病發(fā)生中是否重要。然而,在HoxBlincTgLSK細(xì)胞中,敲除Mll1而非Setd1a能夠緩解HoxBlinc過(guò)表達(dá)介導(dǎo)的異常復(fù)制潛能(圖6a)。當(dāng)使用表達(dá)慢病毒對(duì)照或shMll1的HoxBlincTgLinc-Kit+細(xì)胞進(jìn)行移植時(shí),與表達(dá)HoxBlincTgLinc-Kit+細(xì)胞的shScramble相比,mll1KD***延長(zhǎng)了接受shMll1表達(dá)HoxBlincTgLinc-Kit+細(xì)胞的受體的存活時(shí)間(圖6b)。而mll1KD也能很大程度上恢復(fù)HoxBlincTg小鼠中CD117+/CD11b+未成熟髓系細(xì)胞和GMPs的異常擴(kuò)增以及貧血(圖6c,d)。這些數(shù)據(jù)表明Mll1KD能夠緩解HoxBlinc過(guò)表達(dá)誘導(dǎo)的AML發(fā)展。
4)circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成,促進(jìn)了RIC8A的降解
我們?cè)噲D鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是,MS結(jié)果顯示circPDE4B也結(jié)合了兩個(gè)E3連接酶,包括RNF2和MID1。然而,由于RNF2定位于細(xì)胞核內(nèi),我們選擇MID1進(jìn)行進(jìn)一步研究。實(shí)際上,通過(guò)免疫沉淀分析,MID1被發(fā)現(xiàn)與RIC8A結(jié)合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實(shí)了它們?cè)贖Cs***定位(圖4B)。IP結(jié)果表明,MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過(guò)表達(dá)的泛素化作用,增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實(shí)驗(yàn)也顯示,與對(duì)照組相比,circPDE4B敲低細(xì)胞中RIC8A和MID1的結(jié)合減少,而過(guò)表達(dá)circPDE4B則有相反的作用(圖4D)。 circSDHC通過(guò)充當(dāng)miR-127-3p的海綿促進(jìn)ccRCC的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移.
7)miR-155負(fù)調(diào)控SOCS6表達(dá),***NF-κB通路
為了進(jìn)一步探討外泌體miR-155誘導(dǎo)EndoMT和線粒體功能障礙的潛在機(jī)制,我們重點(diǎn)研究了miR-155的下游基因。首先,利用在線miRNA靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)了84個(gè)潛在靶基因。SOCS6是具有3’UTR的下游mRNA之一,可能與miR-155結(jié)合(圖7A)。結(jié)合GSE49329和GSE49330數(shù)據(jù)庫(kù),我們發(fā)現(xiàn)miR-155的表達(dá)與SOCS6的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(圖7B)。為了進(jìn)一步證實(shí)SOCS63’UTR是miR-155的直接靶標(biāo),我們根據(jù)預(yù)測(cè)的結(jié)合位點(diǎn)(圖7C)構(gòu)建了SOCS63’UTR野生型(WT)和突變型(MUT)序列。熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)顯示,與對(duì)照組相比,共轉(zhuǎn)染SOCS6的WT-3’UTR時(shí),miR-155過(guò)表達(dá)明顯降低了熒光素酶活性(圖7D)。qRT-PCR和westernblot進(jìn)一步顯示,miR-155過(guò)表達(dá)導(dǎo)致SOCS6表達(dá)降低,而miR-155敲低上調(diào)SOCS6mRNA和蛋白水平(圖7E和F)。GO分析顯示miR-155可以負(fù)向調(diào)控細(xì)胞-細(xì)胞粘附,參與調(diào)控成纖維細(xì)胞增殖(圖7G)。從GO分析可知,miR-155可能介導(dǎo)NF-κB信號(hào)通路(圖7G)。過(guò)表達(dá)miR-155可***提高細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中p65蛋白的水平,而敲低miR-155可起到相反的作用(圖7H)。 circNDUFB2可通過(guò)破壞CARDs與其解旋酶結(jié)構(gòu)域之間的分子內(nèi)相互作用。內(nèi)蒙古標(biāo)書(shū)技術(shù)指導(dǎo)
這些細(xì)胞表現(xiàn)出更強(qiáng)的攻擊性和增殖能力.甘肅標(biāo)書(shū)詢問(wèn)報(bào)價(jià)
褪黑素可減少TBI誘發(fā)的小鼠腦行為缺陷和病變體積
為了利用褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)果和病變體積的影響,進(jìn)行了行為分析以及HE染色。關(guān)于線握測(cè)試,與假手術(shù)組相比,TBI在第1-8天導(dǎo)致運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)顯著下降,但與TBI組相比,褪黑素和Lip-1的***改善了第2-6天的運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)。在MWM測(cè)試中觀察到,與假手術(shù)組相比,TBI在第10-15天導(dǎo)致潛伏期延長(zhǎng),但是褪黑素和Lip-1***的TBI小鼠均表現(xiàn)出比TBI小鼠明顯更短的逃避潛伏期。曠場(chǎng)試驗(yàn)中,與假手術(shù)組相比,TBI組的動(dòng)物的總距離、中心移動(dòng)距離和花費(fèi)時(shí)間明顯縮短。褪黑素***可顯著逆轉(zhuǎn)上述參。HE染色顯示,褪黑素和Lip-1***的TBI組在TBI后第16天的病變體積明顯小于TBI組。兩者合計(jì),結(jié)果提供了褪黑素***小鼠中TBI后改善運(yùn)動(dòng),記憶和焦慮結(jié)局以及病變體積的證據(jù)。 甘肅標(biāo)書(shū)詢問(wèn)報(bào)價(jià)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專(zhuān)題,外泌體研究專(zhuān)題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng):提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě),標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)