tRFs和tiRNAs作為sncRNA執(zhí)行多種生物學(xué)功能 。它們能夠作為miRNA行使RNA干擾;替換與mRNA結(jié)合的翻譯起始因子eIF4G,直接抑制蛋白的翻譯過程4,5;結(jié)合某些蛋白因子,例如YBX1,影響mRNA的穩(wěn)定性 ;與細(xì)胞色素C相互作用,調(diào)控細(xì)胞凋亡6;在應(yīng)激條件下促進(jìn)應(yīng)激顆粒 (Stress Granules, SGs) 的組裝 ;敏化細(xì)胞氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的p53***以及p53依賴的細(xì)胞死亡7;作為父**觀遺傳因子,改變子代基因轉(zhuǎn)錄級(jí)聯(lián)過程8,9 。
tRFs具有許多microRNA的功能特性,例如,Dicer依賴的生物發(fā)生,與Argonaute蛋白形成RISC復(fù)合體以及RNA沉默。 據(jù)報(bào)道,tiRNA和tRF可以microRNA的方式參與RNA干擾,另外可結(jié)合諸如YBX1蛋白因子調(diào)控靶mRNA的穩(wěn)定性。綠地tiRNA動(dòng)物模型構(gòu)建
piRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù)
piRNA是一類長(zhǎng)度約26-32nt的小非編碼RNA分子,通過與Piwi蛋白家族成員作用發(fā)揮功能。與miRNA數(shù)目只有幾百種不同,piRNA在人、小鼠、大鼠中***表達(dá)。piRNA在長(zhǎng)度、表達(dá)類型、基因結(jié)構(gòu)和生成方式上均與miRNA截然不同。在功能上,piRNA在生殖發(fā)育和精子形成過程中保護(hù)精子基因組免受轉(zhuǎn)座子插入的危害,通過表觀遺傳調(diào)控基因表達(dá),蛋白翻譯和mRNA更新,以及維持染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和細(xì)胞周期進(jìn)程,并與**進(jìn)程有關(guān)。
tRF&tiRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù)
tRNA是非編碼小RNA分子的主要來源。tRNA來源的RN**段(tRF)和tRNA半分子(tiRNA)的生物發(fā)生是一個(gè)精確調(diào)控的過程,其含量有時(shí)甚至超過microRNA,具有獨(dú)特而多樣的功能??党缮锫氏韧瞥鰐RF&tiRNA高通量測(cè)序,使用Arraystar***授權(quán)的分析系統(tǒng),提供從樣品到數(shù)據(jù)分析的一站式技術(shù)服務(wù)。 代謝組學(xué)tiRNA中標(biāo)率高這些tRF&tiRNA分子的核苷酸組成、生物發(fā)生和功能上具有異質(zhì)性。
tRFs長(zhǎng)度約16-28nt,來源于成熟tRNA或前體tRNA,根據(jù)其在tRNA上的對(duì)應(yīng)位置可進(jìn)一步分為:(i) tRF-5,對(duì)應(yīng)成熟tRNA的5’端,切割發(fā)生在D-loop;(ii) tRF-3,對(duì)應(yīng)成熟tRNA的3’端,包含CCA部分,切割發(fā)生在T-loop;(iii) tRF-1,源自前體tRNA的3’尾部序列,3’末端含有多聚U序列;(iv) i-tRF,不屬于tRF-5,tRF-3或tRF-1,主要來自成熟tRNA的中間區(qū)域。tRF-1產(chǎn)生于前體tRNA的3’尾端序列。tRF-5,i-tRF和tRF-3分別起源自成熟tRNA的5’、內(nèi)部、和3’端。當(dāng)切割發(fā)生在成熟tRNA反密碼子環(huán),將產(chǎn)生兩個(gè)半分子,tiRNAs,包括5’-tRFs和3’-tRFs。
外泌體成分包含蛋白質(zhì)、miRNA.tRFRNA、LncRNA.circRNA,可調(diào)節(jié)多種生理或病理反應(yīng),包括**細(xì)胞侵襲與轉(zhuǎn)移、血管生長(zhǎng)、兔疫應(yīng)答等。同時(shí),miRNA也可以作為**診斷以及預(yù)后標(biāo)志物。其中的tRFRNA也是目前的研究熱點(diǎn),其在體內(nèi)參與多種生理及病理過程,包括病毒***、氧化應(yīng)激、**、神經(jīng)退行性疾病、選傳性代謝疾病等??蛻舭咐?與上海、重慶.沈陽等醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的老師合作就外泌體以及tRFRNA在**、神經(jīng)性疾病以及-些免疫代謝疾病方面取得了較大進(jìn)展,并且在影響因子較高的期刊雜志上發(fā)表了文章。提供服務(wù):根據(jù)客戶的研究方向與發(fā)表雜志要求,提供包括文獻(xiàn)搜索、查閱,分析實(shí)驗(yàn)思路的合理性,證明所需要的方法和檢測(cè)所需的指標(biāo)等。tRF&tiRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù)tRNA是非編碼小RNA分子的主要來源。
逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA
使用rtStar?First-StrandcDNASynthesisKit(3’and5’adaptor)(Cat#AS-FS-003,Arraystar)試劑盒進(jìn)行接頭連接和反轉(zhuǎn),合成cDNA***鏈。
實(shí)時(shí)定量PCR
以合成的cDNA作為模板進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增,梯度稀釋的標(biāo)準(zhǔn)同時(shí)進(jìn)行實(shí)時(shí)定量PCR擴(kuò)增,根據(jù)Ct值制備標(biāo)準(zhǔn)曲線。以同樣的方法測(cè)定每個(gè)樣品中的內(nèi)參,校正上樣誤差。6分析結(jié)果、提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告
分析實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果,根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線定量樣品中的目的tRF&tiRNA。提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告,包括詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)方法,實(shí)時(shí)定量PCR實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和圖表。 5'tiRNA和3'tiRNA的大小在29-50nt左右。綜合tiRNA實(shí)驗(yàn)外包
tRFs是來源于成熟tRNA或前體tRNA的小片段,可進(jìn)一步分為tRF-5,tRF-3,tRF-1和i-tRF等,長(zhǎng)度約為15-30nt。綠地tiRNA動(dòng)物模型構(gòu)建
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是在普通PCR反應(yīng)體系中加入熒光試劑,利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)PCR進(jìn)程,***通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR能夠?qū)R?、靈敏、快速、高重復(fù)性地精確定量起始模板濃度。tRF & tiRNA是由tRNA切割產(chǎn)生,長(zhǎng)度約15-45個(gè)核苷酸的小RNA。由于tRF & tiRNA長(zhǎng)度太短,且與tRNA序列完全重疊,不能通過傳統(tǒng)的實(shí)時(shí)定量PCR進(jìn)行檢測(cè)。本公司通過在tRF & tiRNA兩端引入人工合成序列(adaptor),設(shè)計(jì)特殊的跨連接位點(diǎn)的定量PCR引物,可以精確檢測(cè)微量樣品中tRF & tiRNA表達(dá)水平。綠地tiRNA動(dòng)物模型構(gòu)建
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)