實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是在普通PCR反應(yīng)體系中加入熒光試劑,利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)PCR進(jìn)程,***通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR能夠?qū)R?、靈敏、快速、高重復(fù)性地精確定量起始模板濃度。tRF & tiRNA是由tRNA切割產(chǎn)生,長(zhǎng)度約15-45個(gè)核苷酸的小RNA。由于tRF & tiRNA長(zhǎng)度太短,且與tRNA序列完全重疊,不能通過(guò)傳統(tǒng)的實(shí)時(shí)定量PCR進(jìn)行檢測(cè)。本公司通過(guò)在tRF & tiRNA兩端引入人工合成序列(adaptor), 設(shè)計(jì)特殊的跨連接位點(diǎn)的定量PCR引物,可以精確檢測(cè)微量樣品中tRF & tiRNA表達(dá)水平。當(dāng)tRNAs被切割為tRFs&tiRNAs時(shí),這些修飾(包括甲基化修飾、氨?;┒诵揎棧?huì)全部或部分的保留下來(lái)。浙江tiRNA贈(zèng)送提供技術(shù)路線
tRFs和tiRNAs作為sncRNA執(zhí)行多種生物學(xué)功能 。它們能夠作為miRNA行使RNA干擾;替換與mRNA結(jié)合的翻譯起始因子eIF4G,直接抑制蛋白的翻譯過(guò)程4,5;結(jié)合某些蛋白因子,例如YBX1,影響mRNA的穩(wěn)定性;與細(xì)胞色素C相互作用,調(diào)控細(xì)胞凋亡6;在應(yīng)激條件下促進(jìn)應(yīng)激顆粒 (Stress Granules, SGs) 的組裝 ;敏化細(xì)胞氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的p53***以及p53依賴的細(xì)胞死亡7;作為父**觀遺傳因子,改變子代基因轉(zhuǎn)錄級(jí)聯(lián)過(guò)程8,9。tRFs具有許多microRNA的功能特性,例如,Dicer依賴的生物發(fā)生,與Argonaute蛋白形成RISC復(fù)合體以及RNA沉默。某些收錄的miRNA直接與tRFs匹配浙江tiRNA贈(zèng)送提供技術(shù)路線經(jīng)過(guò)精確剪切過(guò)程產(chǎn)生的tRNA可分為兩類:tiRNA和tRFs。
microRNA-circRNA(lncRNA)靶基因驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)環(huán)狀RNA(circRNA)和長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類非編碼RNA,不翻譯蛋白。但在細(xì)胞中它們能夠調(diào)控其他基因的表達(dá)變化。近年的研究表明circRNA和lncRNA分子富含microRNA結(jié)合位點(diǎn),在細(xì)胞中起到miRNA海綿(miRNAsponge)的作用,進(jìn)而解除miRNA對(duì)其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表達(dá)水平,這一作用機(jī)制被稱為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA(ceRNA)機(jī)制。因此,通過(guò)與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA相互作用,circRNA和lncRNA在疾病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。研究cirRNA、lncRNA的調(diào)控機(jī)制需要先找到與cirRNA、lncRNA相互作用的miRNA,而熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)可以用來(lái)證明miRNA與circRNA,miRNA與lncRNA的直接相互作用。
tiRNA和tRF是近期發(fā)現(xiàn)的一類來(lái)源于tRNA的新型小RNA,長(zhǎng)度在16-50 nt。tiRNA是來(lái)源于成熟tRNA的半分子,血管生成素會(huì)在壓力應(yīng)激下介導(dǎo)tRNA切割成5’-和3’-tRNA半分子,長(zhǎng)度約30-35nt。tRFs是來(lái)源于成熟tRNA或前體tRNA的小片段,根據(jù)其在tRNA上對(duì)應(yīng)的位置可進(jìn)一步分為tRF-5,tRF-3, tRF-1和i-tRF等,長(zhǎng)度約為15-30nt。據(jù)報(bào)道,tiRNA和tRF可以microRNA的方式參與RNA干擾,另外可結(jié)合諸如YBX1蛋白因子調(diào)控靶mRNA的穩(wěn)定性。tiRNA和tRF不僅可作為疾病診斷的生物標(biāo)志物,還具有***潛能。云序生物tiRNA測(cè)序采用獨(dú)有的﹑***的tiRNA和tRF數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行分析,并額外附送miRNA表達(dá)譜分析。tRF&tiRNA是由tRNA切割產(chǎn)生,長(zhǎng)度約15-45個(gè)核苷酸的小RNA。
上海英拜生物tiRNA測(cè)序優(yōu)勢(shì)
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tiRNA測(cè)序采用tiRNA和tRF數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行分析,并額外附送miRNA表達(dá)譜分析。浙江tiRNA贈(zèng)送提供技術(shù)路線
tRF&tiRNA實(shí)時(shí)定量PCR
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是在普通PCR反應(yīng)體系中加入熒光試劑,利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)PCR進(jìn)程,***通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR能夠?qū)R?、靈敏、快速、高重復(fù)性地精確定量起始模板濃度。tRF & tiRNA是由tRNA切割產(chǎn)生,長(zhǎng)度約15-45個(gè)核苷酸的小RNA。由于tRF & tiRNA長(zhǎng)度太短,且與tRNA序列完全重疊,不能通過(guò)傳統(tǒng)的實(shí)時(shí)定量PCR進(jìn)行檢測(cè)。本公司通過(guò)在tRF & tiRNA兩端引入人工合成序列(adaptor),設(shè)計(jì)特殊的跨連接位點(diǎn)的定量PCR引物,可以精確檢測(cè)微量樣品中tRF & tiRNA表達(dá)水平。 浙江tiRNA贈(zèng)送提供技術(shù)路線
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
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