四川tiRNA國(guó)家自然科學(xué)基金

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-27

與常規(guī)小RNA測(cè)序相比,上海英拜生物公司的small RNAs測(cè)序系列服務(wù)具有覆蓋種類全、數(shù)據(jù)分析特異性強(qiáng)等優(yōu)勢(shì)。常規(guī)的混合小RNA測(cè)序一般不能覆蓋全部小RNA分子,其通用的數(shù)據(jù)分析方法也并不適合所有類型的小RNA。上海英拜生物公司的small RNAs測(cè)序系列服務(wù)包含了迄今為止所有已知的小RNA分子類型,并針對(duì)每種類型,專門開(kāi)發(fā)了相應(yīng)的數(shù)據(jù)分析方法。上海英拜生物公司提供技術(shù)服務(wù),與我們特色的測(cè)序系列服務(wù)相結(jié)合,助力您深入挖掘小RNA。tRF&tiRNA實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)是在普通PCR反應(yīng)體系中加入熒光試劑,利用熒光信號(hào)實(shí)時(shí)檢測(cè)PCR進(jìn)程.四川tiRNA國(guó)家自然科學(xué)基金

外泌體成分包含蛋白質(zhì)、miRNA.tRFRNA、LncRNA.circRNA,可調(diào)節(jié)多種生理或病理反應(yīng),包括**細(xì)胞侵襲與轉(zhuǎn)移、血管生長(zhǎng)、兔疫應(yīng)答等。同時(shí),miRNA也可以作為**診斷以及預(yù)后標(biāo)志物。其中的tRFRNA也是目前的研究熱點(diǎn),其在體內(nèi)參與多種生理及病理過(guò)程,包括病毒***、氧化應(yīng)激、**、神經(jīng)退行性疾病、選傳性代謝疾病等??蛻舭咐?與上海、重慶.沈陽(yáng)等醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的老師合作就外泌體以及tRFRNA在**、神經(jīng)性疾病以及-些免疫代謝疾病方面取得了較大進(jìn)展,并且在影響因子較高的期刊雜志上發(fā)表了文章。提供服務(wù):根據(jù)客戶的研究方向與發(fā)表雜志要求,提供包括文獻(xiàn)搜索、查閱,分析實(shí)驗(yàn)思路的合理性,證明所需要的方法和檢測(cè)所需的指標(biāo)等。陜西tiRNA免費(fèi)設(shè)計(jì)tRFs和tiRNAs作為sncRNA執(zhí)行多種生物學(xué)功能,結(jié)合某些蛋白因子,與細(xì)胞色素C相互作用,調(diào)控細(xì)胞凋亡-6。

高通量測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)了-類新的小非編碼RNA。通過(guò)比對(duì),該類RNA可以比對(duì)到tRNA的基因,這類RNA被命名為tiRNA(tRNAhalves)或者tRF(tRNA-relatedfragment)。根據(jù)比對(duì)到成熟tRNA轉(zhuǎn)錄本的不同位置,tiRNA和tRF被分成了不同的類別。比如,在反密碼子處切割,產(chǎn)生兩種tiRNA。從成熟tRNA的5'末端至反密碼子結(jié)束的片段被稱為5'tiRNA,從反密碼子開(kāi)始至成熟tRNA的3’末端的片段被稱為3'tiRNA。這兩類分子的大小在29-50nt左右。需要注意的是5'tiRNA和3'tiRNA的成熟:依賴的angiogenin的切割而不是Dicer,5’端具有羥基而不是磷酸。

由于沒(méi)有有效的方法來(lái)特異性抑制或增強(qiáng)體內(nèi)成骨細(xì)胞的EVs轉(zhuǎn)移,為了驗(yàn)證EVs在體內(nèi)的轉(zhuǎn)移效用,該團(tuán)隊(duì)通過(guò)向小鼠注射間歇性重組甲狀旁腺***(iPTH)等方法來(lái)增加成骨細(xì)胞數(shù)量,同時(shí)測(cè)量了EVs的轉(zhuǎn)移量及其對(duì)基于骨髓的免疫反應(yīng)的影響。當(dāng)受到致死劑量的白色念珠菌攻擊時(shí),小鼠表現(xiàn)出骨髓細(xì)胞反應(yīng)的持續(xù)增加,存活率也***提高。這項(xiàng)研究確定了一種非常規(guī)的機(jī)制,即骨髓中的成骨細(xì)胞可以通過(guò)EVs與造血祖細(xì)胞發(fā)生聯(lián)系,其中的tiRNA提供了一種與傳統(tǒng)細(xì)胞因子所驅(qū)動(dòng)的應(yīng)激反應(yīng)不同的調(diào)節(jié)信號(hào)軸,以促進(jìn)粒-巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞中蛋白質(zhì)的翻譯、細(xì)胞增殖和**終分化。這種獨(dú)特形式的應(yīng)激調(diào)節(jié)通訊方式,可能改變生物體的生理狀態(tài)以應(yīng)對(duì)包括***在內(nèi)的挑戰(zhàn)。通過(guò)比對(duì),該類RNA可以比對(duì)到tRNA的基因,這類RNA被命名為tiRNA(tRNAhalves)或者tRF(tRNA-relatedfragment)。

我們前期發(fā)現(xiàn)5’-tiRNA-Val(一種tiRNA)的含量在結(jié)直腸*組織中***升高,且可能通過(guò)與Ago2相互作用調(diào)控mRNA的穩(wěn)定性參與ANG介導(dǎo)的腸*細(xì)胞遷移過(guò)程,但有待***與深入研究。為此,本項(xiàng)目擬在細(xì)胞和動(dòng)物水平明確5’-tiRNA-Val在ANG促結(jié)直腸*轉(zhuǎn)移中的作用;然后,利用RNA-seq技術(shù)篩選和鑒定受該tiRNA調(diào)控的轉(zhuǎn)移相關(guān)靶基因;***,從mRNA穩(wěn)定性調(diào)控層面,闡明該tiRNA對(duì)轉(zhuǎn)移相關(guān)基因調(diào)控的分子機(jī)制。我們認(rèn)為,本項(xiàng)目將拓展一類新的非編碼RNA的作用機(jī)制認(rèn)識(shí),同時(shí)也有助推動(dòng)tiRNA在**診斷和***的臨床轉(zhuǎn)化研究。tRFs和tiRNAs作為sncRNA執(zhí)行多種生物學(xué)功能,能作為miRNA行使RNA干擾;替換與mRNA結(jié)合的翻譯起始因子elF4G。四川tiRNA國(guó)家自然科學(xué)基金

在tRF&tiRNA兩端引入人工合成序列,設(shè)計(jì)跨連接位點(diǎn)定量PCR引物,可精確檢測(cè)微量樣品中tRF&tiRNA表達(dá)水平。四川tiRNA國(guó)家自然科學(xué)基金

microRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù)

microRNA是一類大小為21-23nt的非編碼小RNA分子,通過(guò)沉默或降解其靶點(diǎn)mRNA分子調(diào)控基因表達(dá)。microRNA在正常發(fā)育過(guò)程以及疾病發(fā)生過(guò)程中具有重要的作用。康成生物為您提供一站式microRNA測(cè)序服務(wù),提供直接可用的數(shù)據(jù)報(bào)告及Paper級(jí)結(jié)果圖表。我們的標(biāo)準(zhǔn)報(bào)告涵蓋其他服務(wù)商沒(méi)有或者*作為可選項(xiàng)的高級(jí)分析項(xiàng)目,助力您深入microRNA研究。

sdRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù)

sdRNA是來(lái)源于核仁小RNA(snoRNA)的一類小RNA分子,其大小與miRNA類似,分為兩種類型。sdRNA可能調(diào)控RNA選擇性剪接,或同miRNA一樣結(jié)合AGO蛋白以抑制靶基因的表達(dá)。***研究發(fā)現(xiàn),sdRNA與**發(fā)展進(jìn)程和惡性遷移密切相關(guān)。類似于tRF/tiRNA測(cè)序流程,康成生物sdRNA-Seq技術(shù)服務(wù)可為客戶提供:優(yōu)化的sdRNA測(cè)序方法學(xué);已知sdRNA序列及其前體snoRNA的注釋信息;從所有數(shù)據(jù)庫(kù)收集的snoRNA注釋信息 四川tiRNA國(guó)家自然科學(xué)基金

公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)