個性化tiRNA國家自然科學(xué)基金

來源: 發(fā)布時間:2021-11-25

英拜優(yōu)勢

超高性價比:一舉三得,同時檢測和分析tiRNA和tRF,以及miRNA。***檢測:**的tiRNA和tRF數(shù)據(jù)庫,提供***的tiRNA和tRF表達(dá)譜分析。高檢測效率:性能優(yōu)化的測序方法與嚴(yán)格的質(zhì)控過程,高檢測效率。一站式服務(wù):客戶只需提供細(xì)胞、組織、體液或總RNA,云序生物為您完成從樣品準(zhǔn)備、文庫制備、上機(jī)測序到數(shù)據(jù)分析的整套服務(wù)流程。專業(yè)的生物信息學(xué)分析:云序生物具有強(qiáng)大的生物信息學(xué)團(tuán)隊,能夠滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析要求。 tiRNA和tRF可作為疾病診斷的生物標(biāo)志物。個性化tiRNA國家自然科學(xué)基金

轉(zhuǎn)運(yùn)RNA (tRNA)是一種參與解碼mRNA、翻譯蛋白質(zhì)的接頭分子。近年來的研究表明tRNA還能作為小非編碼RNA (sncRNA)的主要來源之一,具有獨(dú)特且多樣的功能1。這些tRNA來源的ncRNA并非隨機(jī)降解的產(chǎn)物,而是通過精確的生物發(fā)生過程產(chǎn)生的 。源自tRNA的ncRNA大致分為兩大類:tiRNA (或者tRNA halves) 和tRFs (tRNA 衍生片段) ,具有其特定的分子大小、核苷酸組成、生理功能以及生物發(fā)生。

  tRNA halves (tiRNAs)是由angiogenin (ANG)在多種應(yīng)激條件下在成熟tRNA的反密碼子環(huán)處特異性切割產(chǎn)生的5’-和3’- tRNA半分子,長度約為29-50nt。 單細(xì)胞相關(guān)課題tiRNA省自然科學(xué)基金成熟tRNA的5'末端至反密碼子結(jié)束的片段被稱為5'tiRNA,反密碼子開始至成熟tRNA的3末端的片段被稱為3'tiRNA。

對下一代測序數(shù)據(jù)的深入分析揭示了許多具有不同功能的小分子非編碼RNA。近年來,來源于tRNA衍生的小分子RNA(ransfer-RNAderivedsmallRNAs,tsRNAs)引起***關(guān)注。其主要有2種類型,即tRNA源性應(yīng)激誘導(dǎo)RNA(tRNA-derivedstress-inducedRNA,tiRNA)和tRNA源性片段(tRNA-derivedfragment,tRF)。它們根據(jù)在前體或成熟tRNA轉(zhuǎn)錄物的切割位置不同而產(chǎn)生。這些tRF&tiRNA分子的核苷酸組成、生物發(fā)生和功能上具有異質(zhì)性。新的研究表明,tRF&tiRNA分子不僅是tRNA降解的碎片,而且在許多特定的生理和病理過程中起著調(diào)節(jié)作用。本文綜述了tRF&tiRNA分子的類型,提出了tRF&tiRNA分子的生物學(xué)功能和作用機(jī)制的新概念,重點(diǎn)介紹了tRF&tiRNA分子在人類疾病中的潛在應(yīng)用,并提出了目前存在的問題和未來的研究方向。

由于沒有有效的方法來特異性抑制或增強(qiáng)體內(nèi)成骨細(xì)胞的EVs轉(zhuǎn)移,為了驗證EVs在體內(nèi)的轉(zhuǎn)移效用,該團(tuán)隊通過向小鼠注射間歇性重組甲狀旁腺***(iPTH)等方法來增加成骨細(xì)胞數(shù)量,同時測量了EVs的轉(zhuǎn)移量及其對基于骨髓的免疫反應(yīng)的影響。當(dāng)受到致死劑量的白色念珠菌攻擊時,小鼠表現(xiàn)出骨髓細(xì)胞反應(yīng)的持續(xù)增加,存活率也***提高。這項研究確定了一種非常規(guī)的機(jī)制,即骨髓中的成骨細(xì)胞可以通過EVs與造血祖細(xì)胞發(fā)生聯(lián)系,其中的tiRNA提供了一種與傳統(tǒng)細(xì)胞因子所驅(qū)動的應(yīng)激反應(yīng)不同的調(diào)節(jié)信號軸,以促進(jìn)粒-巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞中蛋白質(zhì)的翻譯、細(xì)胞增殖和**終分化。這種獨(dú)特形式的應(yīng)激調(diào)節(jié)通訊方式,可能改變生物體的生理狀態(tài)以應(yīng)對包括***在內(nèi)的挑戰(zhàn)。tRF&tiRNA實時定量PCR技術(shù)是在普通PCR反應(yīng)體系中加入熒光試劑,利用熒光信號實時檢測PCR進(jìn)程.

英拜生物為您提供microRNA實時定量PCR技術(shù)服務(wù),您只需要提供保存完好的組織或細(xì)胞標(biāo)本,本公司專業(yè)的技術(shù)服務(wù)人員就可替您完成microRNA實時定量PCR實驗操作和數(shù)據(jù)分析,提供給您完整的實驗報告,為您節(jié)省大量的時間和精力。英拜生物microRNA實時定量PCR技術(shù)服務(wù)流程如下:引物設(shè)計、合成設(shè)計并合成目的microRNA的莖環(huán)RT引物、PCR引物。樣品RNA抽提a.組織樣品:取適量(50~100mg)新鮮組織或正確保存的組織樣品,勻漿后抽提RNA。b.細(xì)胞樣品:取1×106~1×107細(xì)胞,吸去培養(yǎng)液后用TRIZOL試劑抽提RNA。RNA質(zhì)量檢測a.紫外吸收測定法測定RNA在波長260nm和280nm的吸收值,獲得RNA的濃度并通過A260/280及A260/230的吸收比值判斷RNA的純度。b.用甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測RNA純度和完整性。注:用于microRNA實時定量PCR檢測的RNA樣品,必須高純度、完整,沒有RNase污染(降解的樣品不能用于實時定量PCR檢測),同時提取方法必須保證所得樣品包含完整的小RNA部分。經(jīng)過精確剪切過程產(chǎn)生的tRNA可分為兩類:tiRNA和tRFs。吉林tiRNA售后服務(wù)

需要注意的是5'tiRNA和3'tiRNA的成熟:依賴angiogenin的切割而不是Dicer,5'端具有羥基而不是磷酸。個性化tiRNA國家自然科學(xué)基金

上海英拜生物tRF&tiRNA實時定量PCR技術(shù)服務(wù)流程

1.引物設(shè)計、合成設(shè)計并合成目的tRF&tiRNA的特異性PCR引物。

2.樣品RNA抽提a.若實驗對象為組織樣品,取適量(50-100mg)新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),勻漿后抽提RNA。b.若實驗對象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1×106~1×107細(xì)胞,完全吸去培養(yǎng)液后加1ml的RNA抽提試劑Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA。

3.RNA質(zhì)量檢測a.紫外吸收測定法測定RNA在波長260nm和280nm的吸收值,獲得RNA的濃度并通過A260/280及A260/230的吸收比值判斷RNA的純度。b.甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA純度和完整性。注:用于tRF&tiRNA實時定量PCR檢測的RNA樣品,必須高純度、完整,沒有RNase污染(降解的樣品不能用于實時定量PCR檢測),同時提取方法必須保證所得樣品包含完整的小RNA部分。

4.RNA預(yù)處理(可選)使用rtStar?tRF&tiRNAPretreatmentKit(Cat#AS-FS-005,Arraystar)進(jìn)行預(yù)處理,去除3’氨?;┒伺c3‘環(huán)磷酸末端,磷酸化5’羥基末端,并移去m1A,m3C等多種甲基化修飾。 個性化tiRNA國家自然科學(xué)基金

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

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3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗