核仁小RNA(snoRNAs)是一泛存在于真核生物細(xì)胞核仁的小分子非編碼RNA.長(zhǎng)度60-300nt,能與核仁核糖**白結(jié)臺(tái)形成snoRNPs復(fù)合物。在脊椎動(dòng)物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過(guò)進(jìn)一步的轉(zhuǎn)錄后加工處理形成成熟的核仁小RNA。snoRNAS參與的生物學(xué)過(guò)程主要有rRNA的加工處理,RNA剪接和翻譯過(guò)程的調(diào)控以及氧化應(yīng)激反應(yīng)。由于snoRNA被認(rèn)為主要存在于核仁**能單一,之后的很長(zhǎng)-段時(shí)間,snoRNA的研究陷入低潮。然而，近幾年,隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的數(shù)據(jù)表明snoRNA在**中被異常調(diào)控,還參與到遺傳性疾病、造血、代謝以及**的過(guò)程中。新一代測(cè)序技術(shù)的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn)，為在基因組范圍內(nèi)快速研究任一物種已知的snoRNA的表達(dá)情況和預(yù)測(cè)挖掘新的snoRNA調(diào)控分子提供了強(qiáng)有力的技術(shù)工具。本公司snoRNA測(cè)序基于llumina測(cè)序平臺(tái),能夠準(zhǔn)確檢測(cè)樣本snoRNA表達(dá)情況。新一代測(cè)序技術(shù)具有高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn)。推薦測(cè)序動(dòng)物模型構(gòu)建
1、gDN**段化，片段末端修復(fù)加接頭,構(gòu)建文庫(kù);2、捕獲前對(duì)文庫(kù)進(jìn)行LM-PCR擴(kuò)增;3、將擴(kuò)增后的樣品與芯片進(jìn)行雜交;4、芯片清洗,去除未結(jié)合序列,然后將捕獲序列洗脫下來(lái);5、對(duì)捕獲后樣品再次進(jìn)行LM-PCR擴(kuò)增;6、通過(guò)qPCR估計(jì)目標(biāo)區(qū)域的相對(duì)富集倍數(shù),達(dá)到質(zhì)控要求后即可進(jìn)行測(cè)序前準(zhǔn)備;7、高通量測(cè)序分析。外顯子組捕獲芯片:RocheNimbleGen外顯子組捕獲芯片SeqCapEZExome產(chǎn)品捕獲區(qū)域達(dá)64Mb.。用于探針設(shè)計(jì)的數(shù)據(jù)庫(kù)涵蓋RefSeq,Vega,Gencode,Ensembl,CCDS和miRBase,可更***的覆蓋編碼區(qū)序列,捕獲效率更高,可更為經(jīng)濟(jì)有效的發(fā)現(xiàn)更多的編碼區(qū)序列變異。Nimblegen外顯子組捕獲2品支持多個(gè)樣品混合進(jìn)行捕獲實(shí)驗(yàn)。5、對(duì)捕獲后樣品再次進(jìn)行LM-PCR擴(kuò)增;6、通過(guò)qPCR估計(jì)目標(biāo)區(qū)域的相對(duì)富集倍數(shù),達(dá)到質(zhì)控要求后即可進(jìn)行測(cè)序前準(zhǔn)備;7、高通量測(cè)序分析。重慶測(cè)序詢(xún)問(wèn)報(bào)價(jià)利Ilumina測(cè)序平臺(tái)對(duì)帕金森病人白血球中IncRNAs進(jìn)行分析,探討其對(duì)mRNA選擇性剪接的調(diào)控機(jī)制。
SmallRNA是生物體內(nèi)-類(lèi)重要的調(diào)控分子,參與細(xì)胞生長(zhǎng)、發(fā)育、代謝、基因轉(zhuǎn)錄和翻譯等諸多生物學(xué)過(guò)程,在疾病的發(fā)***展轉(zhuǎn)歸的病理過(guò)程中也具有非常重要的作用,是一類(lèi)新的極具開(kāi)發(fā)潛質(zhì)的生物標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)。新-代測(cè)序技術(shù)的高通量、高靈敏性、高精確性、低樣品需求量、操作簡(jiǎn)便等特點(diǎn),為在基因組范圍內(nèi)快速研究任一物種已知的smallRNA的表達(dá)情況和預(yù)測(cè)挖掘新的smallRNA調(diào)控分子提供了強(qiáng)有力的技術(shù)工具。本公司在多年miRNA表達(dá)譜芯片服務(wù)的基礎(chǔ)上,推出基于lluminaGAllx的smallRNA測(cè)序服務(wù),結(jié)合lumina新推出的TruSeq樣品制備、簇生成和測(cè)序試劑以及升級(jí)更新的算法軟件,降低了測(cè)序過(guò)程中的GC偏向性,提高了測(cè)序覆蓋度和均一性,測(cè)序數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確、可靠。
目前對(duì)circularRNA的研究還不多,特別是對(duì)這類(lèi)RNA的生物學(xué)功能研究還有待挖掘。通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)尋找反向剪接的reads,即back-splicingreads。可以檢測(cè)樣本中circRNA表達(dá)及其發(fā)現(xiàn)樣本中新的circRNA。數(shù)據(jù)分析:1.基礎(chǔ)分析測(cè)序數(shù)據(jù)評(píng)估及預(yù)處理基因組比對(duì)circRNA預(yù)測(cè)circRNA注釋circRNA表達(dá)定量circRNA差異表達(dá)分析2.高級(jí)分析circRNA關(guān)聯(lián)基因的GO富集分析circRNA關(guān)聯(lián)基因的KEGG富集分析circRNA-miRNA靶向預(yù)測(cè)circRNA-miRNA-mRNAceRNA分析通過(guò)酶切富集啟動(dòng)子及CpG島區(qū)域,實(shí)現(xiàn)測(cè)序數(shù)據(jù)的高利用率。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)精確度高:在其覆蓋范圍內(nèi)可達(dá)到單堿基分辨率;重復(fù)性好:多樣本的覆蓋區(qū)域重復(fù)性可達(dá)到85%-95%,適用于多樣本間的差異分析;檢測(cè)范圍廣:覆蓋全基因組范圍內(nèi)超過(guò)5百萬(wàn)個(gè)CpG位點(diǎn);性?xún)r(jià)比高:測(cè)序區(qū)域更有針對(duì)性,數(shù)據(jù)利用率更高。研究結(jié)果充分證明了RRBS技術(shù)的可靠性。RRBS可作為一種更高效經(jīng)濟(jì)的研究方法,可應(yīng)用于檢測(cè)全基因組啟動(dòng)子和CpG島區(qū)域DNA甲基化狀態(tài)。ReducedRepresentationBisulfiteSequencing(RRBS)是-種準(zhǔn)確、高效、經(jīng)濟(jì)的DNA甲基化研究方法,通過(guò)酶切富集啟動(dòng)子及CpG島區(qū)域,并進(jìn)行Bisulfite測(cè)序,同時(shí)實(shí)現(xiàn)DNA甲基化狀態(tài)檢測(cè)的高分辨率和測(cè)序數(shù)據(jù)的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的熱點(diǎn),與基因表達(dá)、表型性狀息息相關(guān)。RRBS作為一種高性?xún)r(jià)比的甲基化研究方法,在大規(guī)模臨床樣本的研究中具有***的應(yīng)用前景。通過(guò)測(cè)序儀電泳讀取檢測(cè)結(jié)果。重慶測(cè)序服務(wù)兩年
通過(guò)qPCR估計(jì)目標(biāo)區(qū)域的相對(duì)富集倍數(shù),達(dá)到質(zhì)控要求后即可進(jìn)行測(cè)序前準(zhǔn)備。推薦測(cè)序動(dòng)物模型構(gòu)建
技術(shù)優(yōu)勢(shì):多種變異檢測(cè):單核苷酸多態(tài)行(SNP)、插入缺失(InDel)和結(jié)構(gòu)變異(SV);與芯片方法比較,可以檢測(cè)到新的變異序列;與人類(lèi)全基因組從頭測(cè)序相比，耗時(shí)更短、成本更低。研究?jī)?nèi)容:一、數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計(jì)基因組單堿基深度分布及覆蓋度分析。二、一致性序列組裝根據(jù)與參考基因組序列的比對(duì)結(jié)果,利用貝葉斯統(tǒng)計(jì)模型檢測(cè)出測(cè)序個(gè)體基因組中每個(gè)堿基位點(diǎn)比較大可能性的基因型,并組裝出該個(gè)體基因組的一致序列。三、SNP檢測(cè)及在基因組的分布在全基因組一致性序列的基礎(chǔ)上,從中提取全基因組中所有的潛在多態(tài)性位點(diǎn),再根據(jù)質(zhì)量值、深度、重復(fù)性等因素做進(jìn)一步的過(guò)濾篩選,**終得到高可信度的SNP數(shù)據(jù)集。根據(jù)已有的基因集對(duì)檢測(cè)到得變異進(jìn)行注釋。推薦測(cè)序動(dòng)物模型構(gòu)建
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀(guān)，客戶(hù)可隨時(shí)參觀(guān)實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀(guān)遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)