piRNA測序技術服務
piRNA是一類長度約26-32nt的小非編碼RNA分子,通過與Piwi蛋白家族成員作用發(fā)揮功能。與miRNA數(shù)目只有幾百種不同,piRNA在人、小鼠、大鼠中***表達。piRNA在長度、表達類型、基因結構和生成方式上均與miRNA截然不同。在功能上,piRNA在生殖發(fā)育和精子形成過程中保護精子基因組免受轉座子插入的危害,通過表觀遺傳調控基因表達,蛋白翻譯和mRNA更新,以及維持染色質結構和細胞周期進程,并與**進程有關。
上海英拜提供多種模式piRNA測序服務,滿足不同客戶的研究需求:可同時對piRNA和miRNA兩種分子進行檢測,共同進行數(shù)據(jù)比對、注釋和分析;也可*對piRNA進行檢測,精確的片段篩選能夠保證覆蓋所有piRNA,并為客戶提供piRNA專有的數(shù)據(jù)分析。 特別的,tRNA和tRF&tiRNA類群高度富集與生物體液中,有時甚至高于miRNA的含量。廣東tiRNA分子生物學實驗
實時熒光定量PCR技術是在普通PCR反應體系中加入熒光試劑,利用熒光信號實時檢測PCR進程,***通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。實時熒光定量PCR能夠專一、靈敏、快速、高重復性地精確定量起始模板濃度。tRF & tiRNA是由tRNA切割產(chǎn)生,長度約15-45個核苷酸的小RNA。由于tRF & tiRNA長度太短,且與tRNA序列完全重疊,不能通過傳統(tǒng)的實時定量PCR進行檢測。本公司通過在tRF & tiRNA兩端引入人工合成序列(adaptor), 設計特殊的跨連接位點的定量PCR引物,可以精確檢測微量樣品中tRF & tiRNA表達水平??臻g轉錄組學tiRNA詢問報價tRFs是來源于成熟tRNA或前體tRNA的小片段,可進一步分為tRF-5,tRF-3,tRF-1和i-tRF等,長度約為15-30nt。
對下一代測序數(shù)據(jù)的深入分析揭示了許多具有不同功能的小分子非編碼RNA。近年來,來源于tRNA衍生的小分子RNA(ransfer-RNAderivedsmallRNAs,tsRNAs)引起***關注。其主要有2種類型,即tRNA源性應激誘導RNA(tRNA-derivedstress-inducedRNA,tiRNA)和tRNA源性片段(tRNA-derivedfragment,tRF)。它們根據(jù)在前體或成熟tRNA轉錄物的切割位置不同而產(chǎn)生。這些tRF&tiRNA分子的核苷酸組成、生物發(fā)生和功能上具有異質性。新的研究表明,tRF&tiRNA分子不僅是tRNA降解的碎片,而且在許多特定的生理和病理過程中起著調節(jié)作用。本文綜述了tRF&tiRNA分子的類型,提出了tRF&tiRNA分子的生物學功能和作用機制的新概念,重點介紹了tRF&tiRNA分子在人類疾病中的潛在應用,并提出了目前存在的問題和未來的研究方向。
小RNA是一類長度小于200nt、不具蛋白編碼能力的RNA分子,主要包含microRNA、tRF&tiRNA、sdRNA、piRNA、tRNA、snoRNA以及pre-microRNA等種類。作為重要的調控分子,小RNA在基因表達、表觀遺傳、疾病發(fā)***展進程中發(fā)揮著重要功能。此外,高豐度、高穩(wěn)定性和高特異性預示其在臨床分子標志物(biomarker)研究中具有高潛在價值。針對以上不同類型的小RNA分子,我們提供從樣品處理到數(shù)據(jù)分析的一站式服務。針對特定類型分子“量身訂做”的數(shù)據(jù)分析可以幫助客戶快速開展相應的生物學功能研究。新的研究表明,tRF&tiRNA分子不僅是tRNA降解的碎片,而且在許多特定的生理和病理過程中起著調節(jié)作用。
tRFs長度約16-28nt,來源于成熟tRNA或前體tRNA,根據(jù)其在tRNA上的對應位置可進一步分為:(i) tRF-5,對應成熟tRNA的5’端,切割發(fā)生在D-loop;(ii) tRF-3,對應成熟tRNA的3’端,包含CCA部分,切割發(fā)生在T-loop;(iii) tRF-1,源自前體tRNA的3’尾部序列,3’末端含有多聚U序列;(iv) i-tRF,不屬于tRF-5,tRF-3或tRF-1,主要來自成熟tRNA的中間區(qū)域。tRF-1產(chǎn)生于前體tRNA的3’尾端序列。tRF-5,i-tRF和tRF-3分別起源自成熟tRNA的5’、內部、和3’端。當切割發(fā)生在成熟tRNA反密碼子環(huán),將產(chǎn)生兩個半分子,tiRNAs,包括5’-tRFs和3’-tRFs。當tRNAs被切割為tRFs&tiRNAs時,這些修飾(包括甲基化修飾、氨?;┒诵揎棧炕虿糠值谋A粝聛?。空間轉錄組學tiRNA實驗可參觀
tRFs和tiRNAs能夠作為miRNA行使RNA干擾;替換與mRNA結合的翻譯起始因子eIF4G,直接抑制蛋白的翻譯過程。廣東tiRNA分子生物學實驗
高通量測序分析發(fā)現(xiàn)了-類新的小非編碼RNA。通過比對,該類RNA可以比對到tRNA的基因,這類RNA被命名為tiRNA(tRNAhalves)或者tRF(tRNA-relatedfragment)。根據(jù)比對到成熟tRNA轉錄本的不同位置,tiRNA和tRF被分成了不同的類別。比如,在反密碼子處切割,產(chǎn)生兩種tiRNA。從成熟tRNA的5'末端至反密碼子結束的片段被稱為5'tiRNA,從反密碼子開始至成熟tRNA的3’末端的片段被稱為3'tiRNA。這兩類分子的大小在29-50nt左右。需要注意的是5'tiRNA和3'tiRNA的成熟:依賴的angiogenin的切割而不是Dicer,5’端具有羥基而不是磷酸。廣東tiRNA分子生物學實驗
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗