用免疫組化和westernblot檢測(cè)肝轉(zhuǎn)移灶周?chē)谓M織和正常肝組織的纖維化ECM微環(huán)境。與體內(nèi)實(shí)驗(yàn)一致，纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高，而玻連蛋白和固生蛋白C水平下調(diào)(圖7A，B)。接下來(lái)，我們研究了外泌體衍生CD44v6和C1QBP在PDAC患者中的預(yù)后價(jià)值。外泌體CD44v6和C1QBP在PDAC組織中的表達(dá)明顯高于正常胰腺組織(圖7C)。此外，有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無(wú)肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者(圖7C)。免疫電鏡顯示，CD44v6和C1QBP在PDAC組織來(lái)源的EVs***表達(dá)(圖7D)。Pex中CD44v6和C1QBP高表達(dá)的患者比其他患者更容易發(fā)生肝轉(zhuǎn)移(圖7E)。此外，生存分析顯示，EV中CD44v6和C1QBP高表達(dá)的患者的生存結(jié)局明顯較差(圖7F)。循環(huán)外泌體的隨訪數(shù)據(jù)也顯示了一致的結(jié)果。PDAC患者中循環(huán)外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于健康對(duì)照組(圖7G)，PDAC伴有肝轉(zhuǎn)移的患者中循環(huán)外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無(wú)肝轉(zhuǎn)移的患者(圖7G)。免疫電子顯微鏡顯示，CD44v6和C1QBP在PDAC患者的循環(huán)外泌體***表達(dá)(圖7H)。 致力于醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)和相關(guān)生物醫(yī)學(xué)課題的研究。江西課題整體服務(wù)
N6-甲基腺苷（m6A）是一種真核mRNA修飾，通過(guò)改變mRNA穩(wěn)定性、剪接、運(yùn)輸、定位、翻譯、微RNA（miRNA）處理和RNA-蛋白質(zhì)相互作用來(lái)調(diào)節(jié)基因表達(dá)，并改變修飾RNA分子的命運(yùn)。新的證據(jù)表明m6A修飾與**增殖、分化、**發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移相關(guān)，并在**發(fā)展中發(fā)揮重要作用。此外，m6A修飾還受許多蛋白質(zhì)編碼基因調(diào)控，非編碼RNA（如miRNAs、lncRNAs）通過(guò)相互作用控制切割、定位、運(yùn)輸、穩(wěn)定性和降解以及影響**細(xì)胞的增殖、浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移等生物過(guò)程。***我們來(lái)講一篇關(guān)于泛*m6A相互作用的RNA的文章，文章題名為：Comprehensiveanalysesofm6Aregulatorsandinteractivecodingandnon-codingRNAsacross32cancertypes，是南京醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)發(fā)表在Molecularcancer（IF=27.4）期刊的文章。該文章在泛*環(huán)境中***評(píng)估編碼和非編碼RNA的m6A相互作用基因。新疆課題創(chuàng)新服務(wù)我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。
七、股骨和肝臟細(xì)胞在不同細(xì)胞類(lèi)型之間的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異
HSC / MPP簇中的細(xì)胞來(lái)源于肝臟，股骨和髖部，這為評(píng)估起源于胚胎肝臟或骨髓的HSC/MPP群體中潛在的定性和定量差異提供了機(jī)會(huì)。研究者首先對(duì)處于不同細(xì)胞周期狀態(tài)的肝臟和股骨細(xì)胞的數(shù)量進(jìn)行了Fisher精確檢驗(yàn)。結(jié)果顯示，在股骨和肝臟中，絕大多數(shù)CD-REF細(xì)胞處于G0/G1期，而肝臟中處于S-G2-M期的細(xì)胞數(shù)量幾乎是股骨的兩倍。KS和MWW檢驗(yàn)顯示，與肝臟相比，股骨中HSCs/MPPS中基因表達(dá)數(shù)量也比較少，但股骨中HSCs/MPPs***上調(diào)了與核小體組裝、染色質(zhì)組裝和DNA組裝有關(guān)的基因，而肝臟中HSC/MPPs***上調(diào)了與肌動(dòng)蛋細(xì)胞骨架重塑、細(xì)胞粘附和遷移有關(guān)的基因。
二、TBI破壞了NPC和Ran***1的分布，導(dǎo)致TBPH/NPC共聚集
使用鼻咽*標(biāo)記Mab414，它可以識(shí)別包括Nup62在內(nèi)的幾個(gè)Nups的FG結(jié)構(gòu)域，我們發(fā)現(xiàn)在非tbi控制的果蠅大腦中，核膜上有一個(gè)主要的同質(zhì)的環(huán)狀標(biāo)記。非腦外傷對(duì)照組的腹神經(jīng)索(VNC)鼻咽*染色呈均勻分布。相比之下，暴露于TBI的vnc核膜NPC染色不規(guī)則，顯示核形態(tài)紊亂。我們?cè)谀X外傷后觀察到核膜間隙和聚集(Mab414團(tuán)塊)的出現(xiàn)(圖2A)。TBI腦中Mab414染色異常的細(xì)胞百分比明顯高于非TBI對(duì)照(圖2B）。tbi暴露的vnc中Tbph和Mab414的核周和細(xì)胞質(zhì)共聚集，而對(duì)照大腦顯示很少或沒(méi)有共聚集(圖2C)。定量結(jié)果顯示，與對(duì)照組相比，tbi暴露的vnc中具有共聚集的Mab414 tbph陽(yáng)性細(xì)胞百分比***升高(圖2D)。 公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。
4）circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成，促進(jìn)了RIC8A的降解
我們?cè)噲D鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是，MS結(jié)果顯示circPDE4B也結(jié)合了兩個(gè)E3連接酶，包括RNF2和MID1。然而，由于RNF2定位于細(xì)胞核內(nèi)，我們選擇MID1進(jìn)行進(jìn)一步研究。實(shí)際上，通過(guò)免疫沉淀分析，MID1被發(fā)現(xiàn)與RIC8A結(jié)合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實(shí)了它們?cè)贖Cs***定位(圖4B)。IP結(jié)果表明，MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過(guò)表達(dá)的泛素化作用，增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實(shí)驗(yàn)也顯示，與對(duì)照組相比，circPDE4B敲低細(xì)胞中RIC8A和MID1的結(jié)合減少，而過(guò)表達(dá)circPDE4B則有相反的作用(圖4D)。 動(dòng)物建模模型實(shí)驗(yàn)的整體服務(wù)。海南課題售后服務(wù)
將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細(xì)節(jié)。江西課題整體服務(wù)
5）circPDE4B和RIC8A調(diào)控軟骨細(xì)胞中的p38信號(hào)通路
為了闡明RIC8A下游的信號(hào)通路，我們研究了RIC8A敲低的HCs中MAPKs、NF-κB和mTOR的磷酸化水平。兩種RIC8AshRNA***降低了p38的磷酸化水平(圖5A)。然后用信號(hào)分子抑制劑對(duì)HCs進(jìn)行預(yù)處理，包括ERK1/2抑制劑、p38抑制劑和JNK抑制劑，然后是RIC8A過(guò)表達(dá)。經(jīng)過(guò)p38MAPK抑制劑預(yù)處理的RIC8A過(guò)表達(dá)抑制了OA，然而，ERK或JNK抑制劑對(duì)其沒(méi)有影響(圖5B)。此外，***RIC8AshRNA或過(guò)表達(dá)腺病毒后，p38MAPK的磷酸化及其定位發(fā)生了異常調(diào)節(jié)(圖5C-E)。這些結(jié)果表明，RIC8A在軟骨細(xì)胞中通過(guò)p38信號(hào)通路發(fā)揮作用。接下來(lái)我們研究了circPDE4B在OA中調(diào)控p38信號(hào)通路中的作用。circPDE4B過(guò)表達(dá)降低，而circPDE4B敲低***p38MAPK信號(hào)，同時(shí)p38磷酸化和核轉(zhuǎn)位(圖5F-H)。然后我們進(jìn)行了拯救試驗(yàn)。如圖5I-K所示，RIC8A過(guò)表達(dá)挽救了過(guò)表達(dá)circPDE4B誘導(dǎo)的p38信號(hào)通路的下調(diào)，而抑制RIC8A挽救了敲除circPDE4B誘導(dǎo)的p38信號(hào)通路的***，以及p38的磷酸化和核易位?；谶@些發(fā)現(xiàn)，circPDE4B-RIC8A軸在調(diào)節(jié)軟骨細(xì)胞下游p38MAPK信號(hào)通路中發(fā)揮重要作用。 江西課題整體服務(wù)
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)