circRNA是一種新型的非編碼RNA，已被報道通過多種機制參與疾病的發(fā)生和發(fā)展。MAPK通路是一種常見的信號轉(zhuǎn)導通路，參與細胞增殖、炎癥和凋亡，在**中起著特別重要的作用。然而，與MAPK通路相關(guān)的circRNA在胃*中的作用尚未被探索。因此，小編為大家?guī)硪黄?021年4月發(fā)表于影響因子為15.302的雜志Molecular Cancer上的文章“A novel protein encoded by circMAPK1 inhibits progression of gastric cancer by suppressing activation of MAPK signaling”。在本研究中，我們發(fā)現(xiàn)circMAPK1在胃*組織中較鄰近正常組織表達下調(diào)。重要的是，較低的circMAPK1表達預示著GC患者較差的生存。CircMAPK1在體內(nèi)外均能抑制胃*細胞的增殖和侵襲。接下來，我們發(fā)現(xiàn)circMAPK1編碼了一個長度為109個氨基酸的新蛋白。通過一系列功能實驗，我們證實了circMAPK1通過編碼的蛋白MAPK1-109aa發(fā)揮了抑制**的作用。在機制上，**抑制因子MAPK1-109aa通過競爭性結(jié)合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化，從而抑制MAPK1及其下游因子在MAPK通路中的***。我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達譜。上海課題國家自然科學基金
D.箱形圖描述了在0 I級aGvHD患者和II IV級aGvHD患者移植前時間點預測ASVs的對數(shù)轉(zhuǎn)化相對豐度。在aGvHD 0級I和II級IV的患者中基于樹的稀疏LDA識別出普雷沃氏科和放線菌科ASVs的E軌跡，包括ASV 226和ASV 568，這些ASV 226和ASV 568可以預測aGvHD(粗體線).
六、急性GvHD的嚴重程度可以在造血干細胞移植前同時從所有三個身體部位的微生物群預測
在一個聯(lián)合模型中，來自所有三個身體部位的分類群都可以預測HSCT之前樣本的aGvHD嚴重程度(圖6)。該報道發(fā)現(xiàn)了7種預測性asv，其中2種來自腸道，1種來自口腔，1種來自鼻子，2種主要在口腔中發(fā)現(xiàn)，但也在鼻子中發(fā)現(xiàn)，1種主要在口腔中發(fā)現(xiàn)，但也在鼻子和腸道中發(fā)現(xiàn)(圖6A)。3個類群(副弧菌屬ASV_131、放線菌屬ASV_568和梭菌屬ASV_166)起源于后來發(fā)展為II級和IV級aGvHD的患者。一致地，這些asv的log-transformed相對豐度在檢查前、適應開始和HSCT當天，在aGvHD分級為II級和IV級的患者中大多高于那些表現(xiàn)為0級和I級的患者(圖6B)。所有七個分類單元都在CTREE回歸框架中從所有身體部位識別出來，在身體站點特異性支持向量機線性核(svmLinear)模型和/或Boruta特征選擇和/或CTREE回歸框架中也檢測到(圖6C)。 上海課題細胞實驗ATM對PTEN的磷酸化驅(qū)動細胞周期進程。
一、CRPC細胞中AR的染色體
散點圖顯示在VCaP細胞的兩個生物重復中由AR ChIP-SICAP鑒定的染色質(zhì)相關(guān)蛋白。在暴露于R1881(合成AR激動劑）中使用差異的silac標記。在190個ChIP-SICAP定量蛋白中，87個形成了r1881誘導的AR染色體，從而發(fā)現(xiàn)了可能與受體功能相互作用的蛋白。r1881誘導的AR chromatome被分為不同的功能蛋白組(圖1b)。DNA和rna結(jié)合蛋白，組蛋白，DNA修復和mRNA加工相關(guān)蛋白形成了大部分(~50%)的網(wǎng)絡。
二、SMARCA4共占據(jù)了大多數(shù)ar結(jié)合位點，但對其染色質(zhì)可及性的影響有限
SMARCA4和AR共同占據(jù)的位點，以及雄***如何影響共同占據(jù)。SMARCA4(61534)的大多數(shù)染色質(zhì)結(jié)合位點沒有受到DHT的影響(簇C1，圖2a），在C2位點，AR和SMARCA4與結(jié)合高度相關(guān)。DHT增強了SMARCA4在這些位點的招募(集群C1，圖2b)。基序分析顯示，與C1位點相比，C2位點具有更高的雄***響應元件(AREs)富集，進一步支持雄***誘導的SMARCA4到染色質(zhì)上的募集。FOXA1、ERG和HOXB13的基序依次在C1和C2位點上同樣富集(圖2c)。ChIP-seq數(shù)據(jù)集顯示，F(xiàn)OXA1和ERG的結(jié)合隨著***暴露在C2位點而增加，而在C1位點則不增加(圖2d和e)。然而，HOXB13似乎在C1位點結(jié)合更多(圖2f)。
7）SsD克服了m6A介導的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性由于FTO抑制使耐藥細胞對酪氨酸激酶抑制劑（TKI）***敏感，我們檢測了SsD對TKI耐藥細胞的療效。我們發(fā)現(xiàn)SsD聯(lián)合尼洛替尼或PKC412在降低細胞活力方面更有效(圖7A)，這表明SsD***抑制了Kas-1NR和MV4-11PR細胞的增殖。細胞的分子特征也顯示TKIS介導的m6A低甲基化被挽救(圖7B-C)。雖然SsD沒有改變Kas-1NR和MV4-11PR細胞中ALKBH5、METTL3、YTHDF2的蛋白水平(圖7D)，但TKI上調(diào)的m6A相關(guān)基因MerTK、BCL-2和STAT3的表達受損(圖7E)。與上述結(jié)果一致，MerTK、BCL-2和STAT3在TKI耐藥細胞的mRNA和蛋白水平上更穩(wěn)定可以上傳原始的fast文件。
白血病發(fā)生需要增強由致*基因引起的自我更新。其潛在的分子機制尚不完全清楚。本文確定C/D box snoRNAs和rRNA甲基化是白血病干細胞活性的關(guān)鍵決定因素。Aes基因在有融合基因AML1-ETO, PML-RARα和PLZF-RARα的白血病中高表達，但是其功能和機制一直是未知的。研究者通過老鼠模型和細胞系實驗，發(fā)現(xiàn)Aes對**細胞的自我更新能力是至關(guān)重要的。研究者通過RNA-seq對比Aes（*基因）缺失前后轉(zhuǎn)錄組的變化，意外發(fā)現(xiàn)大量的snoRNA下調(diào)，而在過表達Aes后snoRNA表達量***上升，這說明Aes能影響snoRNA的表達。有趣的是，研究者利用CRISPR技術(shù)敲除snoRNA后，發(fā)現(xiàn)即使是敲除單個snoRNA，rRNA的甲基化***降低，并且抑制白血病細胞的克隆形成能力。這說明，snoRNA不僅是一類受*細胞調(diào)控的非編碼RNA，更參與了**的發(fā)***展。AES通過與RNA解旋酶DDX21相互作用誘導snoRNA/RNP形成。zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。海南課題整體服務
英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。上海課題國家自然科學基金
LC3陽性囊泡在質(zhì)膜損傷后在修復部位積聚用激光照射*細胞MCF7，致使細胞膜上形成小孔。使用膜不可滲透的FM1-43染料測量膜完整性，發(fā)現(xiàn)在Ca2+存在下，細胞能夠在20到30s內(nèi)修復它們的質(zhì)膜(Fig.1,AandB,left)；在缺乏Ca2+的培養(yǎng)基中受損的細胞無法修復并繼續(xù)吸收細胞不可滲透的染料(Fig.1B,right)。使用穩(wěn)定表達融合蛋白增強型綠色熒光蛋白(eGFP)-LC3的MCF7細胞研究激光照射后自噬是否參與該過程，結(jié)果顯示，LC3陽性點在損傷后大約8-10min開始在修復部位形成（Fig.1C）；在未損傷區(qū)域中LC3陽性點未增加（Fig.1D）；LC3依賴于ATG7（Fig.1E-H）。上海課題國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗