接下來，在低氧條件下，在HCCLM3和Hep3B細胞中敲低CFL1的表達（圖5A）。結(jié)果表明，CFL1敲除***逆轉(zhuǎn)了缺氧誘導(dǎo)的HCCLM3細胞增殖、細胞遷移和侵襲以及EMT（圖5A-D）。綜上所述，這些結(jié)果表明CFL1表達受HIF-1α的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，介導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)的HCC進展。
6、CFL1通過抑制泛素介導(dǎo)的PLD1降解來維持PLD1的表達為了進一步探索CFL1在HCC中致*作用的下游機制，利用KEGG數(shù)據(jù)庫篩選了受CFL1影響的通路。其中CFL1的高表達與細胞膜中細胞粘附分子和蛋白的定位密切相關(guān)（圖6A）。然后，基于蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫預(yù)測了CFL1和PLD1之間的潛在相互作用（圖6B）。CFL1敲低降低了HCCLM3細胞中PLD1的蛋白水平，而CFL1過表達增強了Hep3B細胞中PLD1蛋白表達（圖6C）。co-IP實驗表明，CFL1與PLD1相互作用，敲低CFL1可促進肝*細胞中PLD1的泛素化(圖6D-E)。用放線菌酮(CHX，2μg/mL)阻斷肝*細胞蛋白質(zhì)合成。繪制蛋白降解曲線，表明CFL1敲低時PLD1蛋白降解更快（圖6F）。此外，蛋白酶體抑制劑MG132(25μM)處理可阻斷CFL1敲低誘導(dǎo)的HCC細胞中PLD1降解（圖6F）。因此，這些結(jié)果表明CFL1抑制肝*細胞中泛素介導(dǎo)的PLD1蛋白水解。 英拜生物對實驗可行性分析。動物模型構(gòu)建服務(wù)
二、G4穩(wěn)定性在基因區(qū)和非基因功能區(qū)之間存在差異
根據(jù)穩(wěn)定性得分將G4基因座分為2組，高于19分的為“穩(wěn)定G4基因座”（342778個），低于19分的為“不穩(wěn)定G4基因座”（327298個），繪制穩(wěn)定性得分分布圖：
三、G4功能受到不同基因區(qū)域的限制
HKT檢驗顯示，G4基因座的進化取決于它們位于哪個基因組件內(nèi)。G4基因座在上游、下游基因區(qū)域、5'UTR、3'UTR的優(yōu)勢比***大于1。位于增強子、復(fù)制起點以及在TAD邊界區(qū)域的G4基因座優(yōu)勢比都很高，這一發(fā)現(xiàn)表明這三種區(qū)域的G4基因座是有功能的。
這項工作表明， G4 的覆蓋率、密度、預(yù)測穩(wěn)定性和選擇壓力取決于它們所在的基因成分和非基因功能區(qū)域。自然選擇在基因組的某些功能區(qū)域中保持了高密度的 G4 位點和高穩(wěn)定性的 G4 結(jié)構(gòu)，以及在其他功能區(qū)中保持低密度和低穩(wěn)定性。每個特定區(qū)域組的情況可能取決于維持功能性 G4 的選擇壓力與容納此類結(jié)構(gòu)的成本之間的平衡。 磷酸化ATM對PTEN的磷酸化驅(qū)動細胞周期進程。
7.EVs介導(dǎo)的ELNAT1被HLECs內(nèi)化以誘導(dǎo)淋巴管生成
共聚焦顯微鏡顯示HLECs中PKH67標(biāo)記EVs孵育后的點狀熒光強度（Figure7A），表明HLECs內(nèi)化了BCa分泌的EVs。此外,孵化UM-UC-3-EVELNAT1***上調(diào)HLECs中ELNAT1表達,而孵化T24-EVsi-ELNAT1，則T24細胞分泌的EVs中ELNAT1表達下調(diào)，則削弱了HLECs中EVs誘導(dǎo)ELNAT1過表達的能力（Figure7B,C）。
為了排除淋巴血管生成是由內(nèi)源性ELNAT1***HLECs中誘導(dǎo)的可能性，構(gòu)建了ELNAT1-KO HLECS ELNAT1（HLECsELNAT1-KO）模型（Figure 7 D, E）。與HLECsELNAT1-WT一致，我們觀察到，EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達增強了HLECsELNAT1-KO的管狀形成和遷移能力，而下調(diào)ELNAT1則抑制了BCa細胞分泌EVs誘導(dǎo)HLECsELNAT1-KO管狀形成和遷移的能力（Figure 7 F-H）。這表明BCa細胞分泌的EVs通過運輸EVs介導(dǎo)的ELNAT1促進淋巴管生成，而不是轉(zhuǎn)錄***內(nèi)源性的ELNAT1。綜上所述，這些結(jié)果表明EVs介導(dǎo)的ELNAT1被HLECs內(nèi)化誘導(dǎo)BCa淋巴管生成。
環(huán)狀RNA（circRNA）是動植物中一類豐富且保守的RNA。**近的研究表明，circRNA可以通過充當(dāng)非編碼RNA或編碼RNA發(fā)揮多種生物學(xué)作用。體外合成的circRNA可以不依賴于帽的方式進行翻譯。但鑒定circRNA編碼的蛋白質(zhì)是困難的，主要是因為circRNA序列及其宿主基因的同源線性mRNA具有較大的重疊。近期NucleicAcidsResearch雜志在線發(fā)表了題名為：TransCirc:aninteractivedatabasefortranslatablecircularRNAsbasedonmulti-omicsevidence的文章，該文章主要講述了circRNA翻譯預(yù)測和分析的數(shù)據(jù)庫——TransCirc。soRNA測序的 整套服務(wù)。
CRC中circPLCE1的特征及臨床意義
為了識別CRC中差異表達的circRNA，我們使用正常的人類腸道上皮細胞系和CRC細胞系進行了總RNA測序。我們確定研究對象為circPLCE1(hsa_circ_0019223，命名為circPLCE1)。我們分析了85對CRC樣本中的circPLCE1表達，證實了88.2%(75/85)的CRC患者中circPLCE1表達下調(diào)。進一步分析顯示，circPLCE1在晚期臨床期或T期患者中表達下調(diào)。使用qRT-PCR分析circPLCE1在正常人腸上皮細胞株和CRC細胞株中的表達水平差異，得到了相似的結(jié)果。circPLCE1由PLCE1外顯子2反向剪接而成。通過Sanger測序證實了circPLCE1的反向拼接連接。PLCE1的環(huán)狀轉(zhuǎn)錄本只能通過擴增引物在cDNA中擴增。circPLCE1還能抵抗RNaseR酶切。半衰期試驗進一步表明，circPLCE1比circPLCE1線性mRNA更穩(wěn)定。通過核質(zhì)量分離試驗和熒光原位雜交(FISH)檢測了circPLCE1的定位，結(jié)果顯示circPLCE1在CRC細胞的細胞質(zhì)中富集。此外，circPLCE1在臨床晚期或T期患者中表達較低。KaplanMeier曲線結(jié)果顯示，CRC患者circPLCE1表達較低與較差的生存率相關(guān)。這些數(shù)據(jù)驗證了circPLCE1的特征和臨床意義。 可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。骨代謝
Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。動物模型構(gòu)建服務(wù)
我們之前的研究揭示了CD44v6參與調(diào)控PDAC細胞的IGF-1通路。因此，我們首先驗證了CD44v6在外泌體中的表達，發(fā)現(xiàn)CD44v6在Pex中的表達水平明顯高于Npex(圖5A)。為了研究CD44v6是否能夠被傳遞到受體細胞中，我們采用蛋白合成抑制劑環(huán)己酰亞胺檢測加入Pex后CD44v6的蛋白水平。western blot分析顯示，加入Pex后，HSCs中CD44v6的表達水平明顯增加(圖5B)。與Npex-孵育的細胞相比，CD44v6的表達水平保持不變(圖5B)。我們還進行了免疫熒光分析，檢測出HSC膜中CD44v6與Pan-cadherin共定位(圖5C)。這些結(jié)果表明，Pex可將CD44v6輸送到HSC膜。此外，western blot檢測表明，敲除CD44v6或使用抗CD44v6抗體的Pex強烈減弱了Pex誘導(dǎo)的IGF-1信號通路的***(圖5D)。同時，在CD44v6- kd Pex或CD44v6抗體的作用下，Pex誘導(dǎo)的HSC活化(圖5E，F(xiàn))、ECM重塑(圖5G)的積極作用***減少。為了闡明CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中的作用，我們進一步研究了過表達CD44v6在HSC中是否與Pex具有同樣的***HSC的作用。然而，過表達CD44v6并沒有像預(yù)期的那樣提高α-SMA的表達(圖5H)。這些結(jié)果表明，CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中發(fā)揮了重要作用。動物模型構(gòu)建服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗