深圳細(xì)胞骨架調(diào)控因子科研

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-13

作者進(jìn)行了PAR-CLIP實(shí)驗(yàn),以評(píng)估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結(jié)果表明,在H1299細(xì)胞中,通過過表達(dá)METTL3來提高m6A的甲基化水平,促進(jìn)YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結(jié)合(圖6D)。無論METTL3是否過表達(dá),YTH結(jié)構(gòu)域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進(jìn)行RNA-pull down實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)YTHDC2WT,優(yōu)先結(jié)合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR,而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外,YTHDC2傾向于結(jié)合m6A共識(shí)基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細(xì)胞中進(jìn)行METTL3的功能增加和丟失實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平?jīng)Q定的(圖6F和G)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2優(yōu)先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結(jié)合。為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機(jī)制。深圳細(xì)胞骨架調(diào)控因子科研

由于RPS3是NF-κB的重要調(diào)控因子,我們進(jìn)一步分析了circPLCE1對(duì)NF-κB信號(hào)通路的影響。Western blot結(jié)果顯示,過表達(dá)circPLCE1-411導(dǎo)致全細(xì)胞提取物中p-P65表達(dá)降低,細(xì)胞核中P65表達(dá)下調(diào)。正如預(yù)期的那樣,核P65的DNA結(jié)合活性也減弱了。相反,circPLCE1-411敲低則上調(diào)了全細(xì)胞提取物中p-P65的蛋白水平,增加了細(xì)胞核中P65的積累,增強(qiáng)了細(xì)胞核中P65的DNA結(jié)合活性。綜上所述,circPLCE1-411結(jié)合HSP90α的N端,促進(jìn)RPS3與HSP90α/RPS3復(fù)合物的解離,導(dǎo)致RPS3的泛素依賴性降解,抑制NF-κB信號(hào)。成都牙周病科研專注于生命科學(xué)內(nèi)的前沿研究。

急性腎損傷(Acute kidney injury, AKI)是一種起病急、進(jìn)展快、預(yù)后差的嚴(yán)重臨床急癥。**近的證據(jù)表明,AKI伴隨著***的代謝異常,包括脂質(zhì)代謝的改變。然而,脂質(zhì)在AKI中的具體變化及其作用和調(diào)控機(jī)制目前尚不清楚。***小編給大家?guī)碛?021年3月發(fā)表在影響因子8.579的“Theranostics”的文章“Relieving lipid accumulation through UCP1 suppresses the progression of acute kidney injury by promoting the AMPK/ULK1/autophagy pathway”。本研究***系統(tǒng)分析AKI中脂質(zhì)組成的變化,發(fā)現(xiàn)脂質(zhì)積累程度與UCP1高度相關(guān)。重要的是,通過上調(diào)UCP1緩解AKI中的脂質(zhì)堆積,可以通過促進(jìn)AMPK/ULK1/自噬通路,***抑制AKI的進(jìn)展。

2、在體內(nèi),慢性暴露于27HC可選擇更具致瘤性和轉(zhuǎn)移性的細(xì)胞目前已建立的聯(lián)系是膽固醇升高和**進(jìn)展相關(guān),作者認(rèn)為,雖然這些臨床觀察與27HC抑制細(xì)胞增殖的結(jié)果不一致,這可能與本研究中通過使細(xì)胞/**發(fā)生膽固醇/27HC急性升高而建立的高膽固醇血癥模型有關(guān)。為了探索這種可能性,構(gòu)建27HC抗性版本的4T1、Py230、BPD6、HCC1954、MDAMB436和B16F10細(xì)胞,在5μM27HC持續(xù)存在的2D培養(yǎng)中傳代14個(gè)月,直到菌落出現(xiàn)。4T1、Py230和BPD6的27HC敏感和等基因抗性細(xì)胞在2D培養(yǎng)下的時(shí)間/劑量-響應(yīng)生長(zhǎng)曲線如所示。盡管27HC的敏感性存在***差異,但在不含27HC的情況下,敏感細(xì)胞(27HCS)和耐藥細(xì)胞(27HCR)的總體增殖能力相似。然而,當(dāng)作為異種移植物在小鼠體內(nèi)傳播時(shí),所有這三種細(xì)胞模型的27HC抵抗衍生物都顯示出比27HC敏感的衍生物更具有致瘤性。尾靜脈注射模型評(píng)估敏感和耐藥細(xì)胞的肺轉(zhuǎn)移能力,結(jié)果顯示,在三種模型(4T1,Py230和BPD6)中,對(duì)27HC的抗性與***增加的轉(zhuǎn)移潛能相關(guān)。綜上所述,細(xì)胞在適應(yīng)27HC水平的增加時(shí),獲得了使它們更具致瘤性和轉(zhuǎn)移性的活性。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎。

二、偽時(shí)間軌跡,染色質(zhì)可及性和基因表達(dá)分析揭示Flow-Dependent內(nèi)皮細(xì)胞重新編程

我們的分析明確了3種主要的分化細(xì)胞類型:(1)ec,(2)免疫細(xì)胞(巨噬細(xì)胞,樹突狀細(xì)胞和T細(xì)胞),以及(3)SMCs和纖維細(xì)胞(圖3A)。此外,在每一細(xì)胞類型走向的軌跡路徑上,還有許多其他細(xì)胞出現(xiàn),表明它們響應(yīng)d-flow的過渡性去分化狀態(tài)。為了更好地理解軌跡結(jié)果,我們將分析分為四種實(shí)驗(yàn)條件(圖3B)。在s-flow條件下(2D-R和2W-R),大部分細(xì)胞分化良好,少數(shù)細(xì)胞處于過渡狀態(tài)。相反,d-flow條件誘導(dǎo)許多ec進(jìn)入過渡狀態(tài),潛在地向smc和纖維轉(zhuǎn)化分化,表明EndMT。令人驚訝的是,我們還發(fā)現(xiàn)許多ec在急性d-flow條件下(2D-L)向免疫細(xì)胞轉(zhuǎn)移,在慢性d-flow條件下(2W-L)進(jìn)一步增加。 我們?cè)谌祟愐认?細(xì)胞系中過表達(dá)或敲除METTL14。CAR-T科研省自然科學(xué)基金

N6甲基腺苷(m6A)是一種常見的真核細(xì)胞mRNA修飾。深圳細(xì)胞骨架調(diào)控因子科研

IL-3/IL-4能誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化,預(yù)先用50ng/mLIL-3/IL-4處理THP-1細(xì)胞3天,驗(yàn)證anti-miR-934對(duì)M2巨噬細(xì)胞極化的影響。結(jié)果顯示PTEN過表達(dá)部分減弱了miR-934和HCT-8細(xì)胞來源外泌體對(duì)M2標(biāo)記物(CD206,arginase-1和IL10)表達(dá)的增強(qiáng)作用,而PTEN的沉默則相應(yīng)地逆轉(zhuǎn)了anti-miR-934對(duì)M2標(biāo)記物表達(dá)的衰減效應(yīng)(Fig.5g,i)。流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)M2巨噬細(xì)胞標(biāo)志物CD163在PMA處理的THP-1細(xì)胞中的表達(dá),結(jié)果與上述結(jié)果一致(Fig.5j)??傊?,研究結(jié)果表明,miR-934增強(qiáng)了CRC細(xì)胞來源的外泌體對(duì)M2巨噬細(xì)胞極化誘導(dǎo)的增強(qiáng)作用,而anti-miR-934減弱了其增強(qiáng)作用。



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5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)