進(jìn)一步檢測(cè)S100A4的功能，結(jié)果顯示敲除S100A4***降低高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力，過表達(dá)S100A4則***增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力（圖3d）。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達(dá)的HCC細(xì)胞的外泌體，結(jié)果得到了類似的結(jié)論，S100A4過表達(dá)外泌體***增強(qiáng)HCC細(xì)胞的遷移和侵襲，以及體內(nèi)肺部轉(zhuǎn)移的能力（圖3e-f）。這些結(jié)果證實(shí)了外泌體S100A4具有增強(qiáng)HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的功能。
4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉(zhuǎn)錄
接下來探究了S100A4的作用機(jī)制，首先選擇了21個(gè)**干性相關(guān)基因，然后下載了GEO數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性分析，結(jié)果顯示S100A4主要和11個(gè)基因正相關(guān)（圖4a）。隨后檢測(cè)了不同HCC細(xì)胞系中敲除和過表達(dá)S100A4后11個(gè)基因的表達(dá)水平的改變，結(jié)果顯示只有OPN是S100A4的下游基因，其表達(dá)受到S100A4的調(diào)控（圖4b-f）。OPN是促進(jìn)HCC轉(zhuǎn)移和干性的關(guān)鍵因子，但外泌體S100A4調(diào)節(jié)OPN的機(jī)制仍不清楚。 大黃酸處理沒有改變?nèi)樗峋蛩岬漠a(chǎn)生。江蘇科研地區(qū)科學(xué)基金
在s-flow條件下，KLF4的TF結(jié)合基元在E2中富集，而NRF1在E3和E4中富集(所有流條件下)(圖6B)。相比之下，暴露于d-flow條件下的E5 E8中，TEF、ETV3、RELA、FOS::JUN、TEAD1和STAT1的TF基序富集(圖6C)。對(duì)一些眾所周知的流量敏感tf的基模的鑒定，KLF4(與KLF2基模相同)，F(xiàn)OS:JUN (AP1)， RELA和TEAD1證實(shí)了我們分析的有效性。為了進(jìn)一步確定新發(fā)現(xiàn)的TF結(jié)合基序是否也與流量依賴反應(yīng)相關(guān)，我們檢測(cè)了phospho -STAT1水平是否對(duì)流量敏感，作為STAT1***的標(biāo)記。pcl術(shù)后2周，與RCA相比，CDH5+ LCA的ECs中phosphoSTAT1水平***升高(圖6D和6E)。臨床醫(yī)學(xué)科研動(dòng)物模型構(gòu)建FOXO3A誘導(dǎo)的LINC00926限制乳腺瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。
鐵死亡對(duì)調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)至關(guān)重要，是一種很有前途的肺****靶點(diǎn)。泛素特異性蛋白酶35 (USP35)屬于deubiquitinases家族，與細(xì)胞增殖和有絲分裂有關(guān)。于2021年4月發(fā)表于“Clin. Transl. Med”（IF=11.492）的文章“Deubiquitinase USP35 modulates ferroptosis in lung cancer via targeting ferroportin”對(duì)此展開了研究。本研究旨在闡明USP35在肺*中的潛在作用和分子基礎(chǔ)。研究表明USP35在人肺*組織和細(xì)胞系中大量存在。USP35敲除促進(jìn)鐵死亡，抑制肺*細(xì)胞的細(xì)胞生長(zhǎng)、集落形成和**進(jìn)展。USP35過表達(dá)在基礎(chǔ)條件下不影響**發(fā)生和鐵死亡，但減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡，從而促進(jìn)肺*細(xì)胞生長(zhǎng)和**進(jìn)展。進(jìn)一步的研究確定USP35直接與鐵轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(FPN)相互作用，并作為一種雙激酶來維持其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性。更重要的是，我們觀察到USP35敲除使肺*細(xì)胞對(duì)順鉑和紫杉醇化療敏感?？偠灾?，USP35通過靶向FPN調(diào)節(jié)肺*鐵死亡，是一個(gè)很有前途的肺****靶點(diǎn)。
TGFB/BMP信號(hào)通路ChIPqPCR芯片分析TGFB和BMP-mediated信號(hào)在致*作用上的84個(gè)關(guān)鍵基因的組蛋白修飾狀態(tài)或組.蛋白密碼。組蛋白修飾調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和與相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄活性。TGFB信號(hào)分子家庭包括4個(gè)主要信號(hào)通路:TGFB、骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMP)、節(jié)點(diǎn)苯丙酸諾龍。TGFB/BMP信號(hào)通路在**形成的早期抑制**生長(zhǎng)但隨后剌激轉(zhuǎn)移在以后的階段。這些信號(hào)通路在**中失調(diào)引起表觀速傳變化包括染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的改變,如組蛋白脫乙酰作用。這個(gè)芯片包含TGFB超級(jí)家族的成員及其細(xì)胞因子和受體，以及下游信號(hào)分子和靶基因。這個(gè)芯片的結(jié)果助于進(jìn)一步了解TGFB信號(hào)通路的組蛋白修飾狀態(tài),這可能闡述疾病惡化的潛在機(jī)制。通過染色質(zhì)免疫沉淀和EpiTectChIPqPCR芯片,可以很簡(jiǎn)易、可靠地分析組蛋白的化學(xué)修飾模式與TGFB和BMP介導(dǎo)信號(hào)通路重要基因的關(guān)聯(lián)。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。
接下來，通過體外復(fù)制、配對(duì)子細(xì)胞實(shí)驗(yàn)和體內(nèi)競(jìng)爭(zhēng)移植研究了HoxBlinc過表達(dá)對(duì)造血干細(xì)胞自我更新和再生能力的影響。在HoxBlincTg LSK細(xì)胞中，連續(xù)4輪的復(fù)制電位均***高于WT細(xì)胞(圖3d)。使用WT和HoxBlincTg原始CD34?LSK細(xì)胞的配對(duì)子細(xì)胞檢測(cè)顯示，具有對(duì)稱自我更新能力的HoxBlincTg CD34?LSK細(xì)胞比例更高，而進(jìn)行對(duì)稱分化或不對(duì)稱自我更新的細(xì)胞比WT減少（圖3e）。競(jìng)爭(zhēng)移植實(shí)驗(yàn)表明，HoxBlincTg BM細(xì)胞移植后，受體外周血中供體細(xì)胞(CD45.2+)嵌合率穩(wěn)定上升，移植7個(gè)月后達(dá)到~80%，而WT BM細(xì)胞移植后小鼠外周血中CD45.2+細(xì)胞群保持在~50%（圖3f）。有趣的是，接受HoxBlincTg BM細(xì)胞的小鼠在移植后2.5-7個(gè)月死亡率更高(圖3g)?？傮w而言，HoxBlinc基因在小鼠中的表達(dá)增強(qiáng)了HSC的自我更新，并擴(kuò)大了骨髓形成，導(dǎo)致AML樣疾病，與NPM1c/+小鼠中看到的表型相似。
發(fā)現(xiàn)乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。江蘇科研地區(qū)科學(xué)基金
2.Lnc-PMIF抑制OPCs遷移到骨形成表面
在成骨細(xì)胞分化過程中，lnc-PMIF在早期增加，在礦化啟動(dòng)后減少，表明lnc-PMIF可能在成骨分化的早期階段發(fā)揮作用。過表達(dá)/敲低lnc-PMIF不影響OPCs的增殖和成骨分化。敲低lnc-PMIF的細(xì)胞遷移減弱，敲低組細(xì)胞處理的小鼠脛骨中Dil標(biāo)記細(xì)胞數(shù)量升高，小鼠中l(wèi)nc-PMIF表達(dá)更高。這些表明lnc-PMIF可抑制OPCs向骨形成表面的遷移，而不干擾其增殖和成骨潛能。
3.Lnc-PMIF與HuR相互作用抑制β-actin的表達(dá)以抑制OPC遷移
為探索Lnc-PMIF介導(dǎo)的OPC遷移的調(diào)節(jié)機(jī)制。RNApulldown-MS實(shí)驗(yàn)尋找lnc-PMIF的相互作用蛋白，鑒定出一種RNA結(jié)合蛋白HuR，WB證實(shí)HuR在生物素標(biāo)記的lnc-PMIF細(xì)胞裂解的下拉組分中富集，RNA免疫沉淀(RIP)試驗(yàn)lnc-PMIF與HuR的結(jié)合。 江蘇科研地區(qū)科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)