江西科研創(chuàng)新服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2021-11-10

編碼PI3Kαp110α亞基的PIK3CA在多達(dá)40%的乳腺*中發(fā)生突變,**常見的是雌***受體陽性(ER+)**。突變的PIK3CA在校正ER陽性等有利風(fēng)險變量時并不是預(yù)后的**標(biāo)記物,但它是改善晚期ER+乳腺*內(nèi)分泌和PI3K聯(lián)合***應(yīng)答的預(yù)測生物標(biāo)記物。有趣的是,與PTEN等其他PI3K通路改變的**相比,pikca突變ER+乳腺*顯示出極少的AKT***和對AKT信號的依賴。

NPP4B抑制AKT信號,并在三陰性(ER/PR/HER2)和基底樣乳腺*中表現(xiàn)出**抑制活性。此外,INPP4B蛋白在黑色素瘤、卵巢*和前列腺*中表達(dá)減少。在小鼠模型中,Inpp4b消融與Tp53/Brca1缺失共同增加了乳腺**外顯率,并與Pten雜合子缺失共同促進(jìn)體內(nèi)甲狀腺**的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。值得注意的是,INPP4B通過降解PI(3,4)P2,抑制早期核內(nèi)體的局部AKT2信號通路和EGFR降解。 英拜生物提供專業(yè)的編輯潤色團(tuán)隊保證服務(wù)到文章接收為止。江西科研創(chuàng)新服務(wù)

為了增加上述結(jié)果的嚴(yán)謹(jǐn)性,使用轉(zhuǎn)染了pLent-ROR的BxPC-3細(xì)胞來研究linc-ROR過表達(dá)是否會導(dǎo)致下游HIF1α-ZEB1表達(dá)的改變。實驗結(jié)果揭示了linc- ROR和共培養(yǎng)條件在HIF1α-ZEB1信號通路中的有效性和可行性,并與plt陰性對照或pbs對照處理的BxPC-3細(xì)胞進(jìn)行了比較。IL-1b等細(xì)胞因子在PC微環(huán)境中通過旁分泌信號在脂肪細(xì)胞和**細(xì)胞之間發(fā)揮重要的介導(dǎo)作用。因此,通過ELISA檢測了與脂肪細(xì)胞共培養(yǎng)微環(huán)境中IL-1b的濃度。數(shù)據(jù)顯示較高的外泌體linc-ROR可刺激脂肪細(xì)胞分泌IL-1b。此外,對PC細(xì)胞的western blot分析顯示,ZEB1誘導(dǎo)的EMT細(xì)胞發(fā)生了典型的變化,包括E-cadherin蛋白表達(dá)降低,而vimentin蛋白表達(dá)***升高。因此,這些結(jié)果表明,外泌體linc-ROR誘導(dǎo)脂肪細(xì)胞脫分化,并提高PC細(xì)胞中ZEB1的表達(dá),從而誘導(dǎo)EMT。臨床醫(yī)學(xué)科研實驗可參觀尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。

然后使用單細(xì)胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄譜(Fig. 4G)。使用pseudobulk RNA-seq分析和預(yù)轉(zhuǎn)移體外培養(yǎng)的基因比較,生成了持續(xù)細(xì)胞的基因標(biāo)記,其標(biāo)志是記憶相關(guān)基因(Sell,F(xiàn)oxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達(dá)和效應(yīng)相關(guān)基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(dá)(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細(xì)胞數(shù)據(jù)(Fig. 2H-J)的進(jìn)一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續(xù)性特征的細(xì)胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig. 4J-K)。這些數(shù)據(jù)表明,抑制CDK4/6促進(jìn)T細(xì)胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。

MIR210HG與子宮內(nèi)膜*患者的低生存率相關(guān)為了識別子宮內(nèi)膜*組中異常表達(dá)的lncRNA,我們分析了來自TCGA的數(shù)據(jù)。表達(dá)陣列分析顯示332個lncRNA的表達(dá)差異有統(tǒng)計學(xué)意義。7個lncRNA表達(dá)上調(diào)(圖1A和1B)。然后,我們分析了GEO數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜*GSE17025隊列中MIR210HG的表達(dá)也上調(diào)(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1D)。此外,我們分析了MIR210HG的表達(dá)與子宮內(nèi)膜*患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進(jìn)展過程中增加。MIR210HG的表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移***相關(guān)(圖1E)。原位雜交實驗結(jié)果顯示,MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)水平高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1F)。MIR210HG高表達(dá)的子宮內(nèi)膜*患者生存率較低(圖1G)。英拜有一支高精尖的團(tuán)隊。

6、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化促進(jìn)CRLM

將弱轉(zhuǎn)移的CRC細(xì)胞系SW480和RKO與miR-934mimics預(yù)處理的THP-1細(xì)胞的CM共培養(yǎng)。結(jié)果顯示,無論是體內(nèi)還是體外,侵襲和轉(zhuǎn)移能力都隨著miR-934mimics外泌體處理而升高,隨著anti-miR-934外泌體處理而下降(Fig.6c–g)。這些結(jié)果表明,CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化可以增強(qiáng)CRC細(xì)胞的侵襲和肝轉(zhuǎn)移能力。

7、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化,通過***CRC細(xì)胞中的CXCL13/CXCR5軸促進(jìn)CRLM

用HCT-8細(xì)胞來源的外泌體與陰性對照處理或PMA預(yù)處理的THP-1細(xì)胞孵育,分析趨化因子水平。如Fig.7a所示,CXCL13、IL-10和CCL22的表達(dá)水平遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他趨化因子的水平。然后,PMA-pretreatedTHP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934mimics或NC,ELISA表明CXCL13的表達(dá)***增加(大約10倍)而CCL22和IL-10(二至三倍),這表明CXCL13可能在CRLM的進(jìn)展扮演了一個重要的角色(Fig.7b)。此外,結(jié)果顯示,過表達(dá)miR-934或下調(diào)miR-934可部分增強(qiáng)或減弱HT29/HCT8細(xì)胞來源外泌體對M2巨噬細(xì)胞分泌CXCL13的增強(qiáng)作用(Fig.7c)。 大黃酸能緩解D。SS誘導(dǎo)的小鼠慢性結(jié)腸炎。常規(guī)科研地區(qū)科學(xué)基金

英拜提供生命科學(xué)內(nèi)的一體化服務(wù)。江西科研創(chuàng)新服務(wù)

2)整合單核RNA和ATAC數(shù)據(jù)集,用于預(yù)測和驗證ATAC細(xì)胞類型分配

snATAC-seq捕獲單個細(xì)胞的染色質(zhì)可及性特征。相對而言,我們對細(xì)胞類型特異性染色質(zhì)可及性圖譜的了解較少;因此,我們利用注釋snRNA-seq數(shù)據(jù)集使用標(biāo)簽轉(zhuǎn)移來預(yù)測使用Seurat的snATAC-seq細(xì)胞類型。標(biāo)簽轉(zhuǎn)移是通過從snATAC-seq數(shù)據(jù)創(chuàng)建一個基因活性矩陣來進(jìn)行的,這是一種衡量蛋白編碼基因的基因體和啟動子內(nèi)染色質(zhì)可及性的方法。在參考snRNA-seq數(shù)據(jù)集和查詢基因活性矩陣之間識別轉(zhuǎn)移錨點(diǎn),然后分配預(yù)測的細(xì)胞類型。snATAC-seq預(yù)測分?jǐn)?shù)的分布表明,絕大多數(shù)細(xì)胞具有較高的預(yù)測分?jǐn)?shù),并被自信地劃分為單細(xì)胞類型(補(bǔ)充圖2)。 江西科研創(chuàng)新服務(wù)

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗