2021年，來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團(tuán)隊合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性。基于rna-seq的基因表達(dá)譜分析，確定了兩種新亞型，稱為原始型和committed型。基于基因表達(dá)、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異，在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外，表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。IGF-1信號在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。上海課題整包服務(wù)
三、通過RNA-seq、RIP-seq和MeRIP-seq鑒定ythdf1調(diào)控的轉(zhuǎn)錄本
2017年俞立團(tuán)隊進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，整合素與ECM蛋白的配對結(jié)合決定了遷移體的形成[2]，該研究成果也發(fā)表在CellResearch期刊。2108年俞立團(tuán)隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法[3]。2019年，俞立團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結(jié)構(gòu)域，這一結(jié)構(gòu)即遷移體的基本結(jié)構(gòu)，還證實遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結(jié)構(gòu)的剛度增加而產(chǎn)生的一種生物物理過程[4]，該研究成果發(fā)表于NatureCellBiology期刊中（IF=）。并同年在同期刊中發(fā)表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生，Tspan4a和Tspan7（遷移體生成相關(guān)基因）突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損，并闡明遷移體誘導(dǎo)胚胎細(xì)胞至正確的位置，從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團(tuán)隊還發(fā)表了關(guān)于遷移體標(biāo)志物的文章[6]，該文章闡明了人血清中存在遷移體；與外泌體相比，遷移體中存在四種特異性蛋白：NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。2021年5月，俞立團(tuán)隊在Cell期刊（IF=）上發(fā)表文章，文章主要講述在外界刺激下，細(xì)胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月，俞立團(tuán)隊利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細(xì)胞遷移和神經(jīng)活動。
檢測TYRO3基因拷貝數(shù)與細(xì)胞毒性T細(xì)胞抗**活性的相關(guān)性，CD8+T細(xì)胞水平與高表達(dá)TYRO3基因的患者的生存期延長無關(guān)，但確實介導(dǎo)了低TYRO3基因拷貝數(shù)患者的生存期延長，表明TYRO3降低細(xì)胞毒性T細(xì)胞抗**作用的觀點(diǎn)。為進(jìn)一步確定TYRO3和抗PD-1***結(jié)果之間的相關(guān)性，分析接受抗PD-1***的黑色素瘤患者RNA-Seq數(shù)據(jù)中TYRO3的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)耐藥**患者的TYRO3表達(dá)水平***高于**有反應(yīng)的患者。Westernblot分析也驗證了TYRO3，p-TYRO3在4T1-R克隆中的表達(dá)增強(qiáng)，說明TYRO3對配體刺激有反應(yīng)。為進(jìn)一步確定TYRO3和抗PD-1/PD-L1耐藥性在各種**類型中是否普遍相關(guān)，我們研究了29例繼續(xù)接受抗PD-1/PD-L1***患者的***結(jié)果。抗PD-1/PD-L1***耐藥患者的TYRO3表達(dá)水平高于對***有反應(yīng)的患者。綜上所述，患者**組織中TYRO3的高表達(dá)和磷酸化與抗PD-1/PD-L1***的耐藥性相關(guān)。caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。
1、白樺素作為SREBP加工特異性抑制劑的鑒定
構(gòu)建了一個由含SRE啟動子驅(qū)動的熒光素酶報告基因，并從人肝*細(xì)胞系Huh-7中生成了穩(wěn)定表達(dá)該報告基因的細(xì)胞系(命名為Huh-7/SRE-Luc)。然后將該細(xì)胞與不同化合物孵育，并進(jìn)行熒光素酶活性測定。有趣的是，只有白樺素[lup-20(29)-ene-3b,28-diol]有效降低了熒光素酶的活性。白樺素是一種天然存在的五環(huán)三萜，可以很容易地從樺樹皮中提取出來(比較高可達(dá)干重的30%)。
作者直接檢測了白樺素對SREBP加工的影響和特異性，并與25-HC進(jìn)行比較。25-HC有三個主要作用：通過抑制SREBP-2的切割降低n-SREBP-2(圖1A)；***LXR，進(jìn)而上調(diào)SREBP-1的轉(zhuǎn)錄，導(dǎo)致n-SREBP-1的增加(圖1A)；促進(jìn)HMG-CoA還原酶(HMGCR)的降解，HMGCR是膽固醇生物合成中的限速酶(圖1B)。另一方面，白樺素有效降低了內(nèi)源性的n-SREBP-1和n-SREBP-2(圖1A)，表明白樺素在不***LXR的情況下抑制了SREBP的加工。 英拜提供生物醫(yī)學(xué)課題外包服務(wù)。星形膠質(zhì)細(xì)胞課題實驗檢測服務(wù)
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為理解TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的機(jī)制作用，從4T1-P、TYRO3-OE、4T1-R和TYRO3–/–細(xì)胞中提取RNA進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組分析。2種耐藥細(xì)胞系Tyro3-OE和4T1-R之間的轉(zhuǎn)錄組學(xué)變化高度相似，變化的重疊百分比較高，表明Tyro3在促進(jìn)**細(xì)胞對抗PD-1/PD-L1***耐藥中的作用。來自TCGA數(shù)據(jù)庫的黑色素瘤患者TYRO3基因的通路分析也顯示TYRO3表達(dá)與PD-1/PD-L1**免疫***通路呈正相關(guān)，與T細(xì)胞介導(dǎo)的抗**反應(yīng)相關(guān)通路（CTL介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡和死亡受體信號），炎癥反應(yīng)相關(guān)通路（Th1活化、Th2活化、NF-κB信號）呈負(fù)相關(guān)。HMGB1是一種損傷相關(guān)分子模式分子，由嗜鐵細(xì)胞釋放，我們發(fā)現(xiàn)HMGB1信號與TYRO3表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。以上表明，TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的作用，并表明TYRO3有利于***TME。上海課題整包服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗