4)Pex來源的CD44v6對(duì)于HSCs的***是必要的,但不是充分的
我們之前的研究揭示了CD44v6參與調(diào)控PDAC細(xì)胞的IGF-1通路。因此,我們首先驗(yàn)證了CD44v6在外泌體中的表達(dá),發(fā)現(xiàn)CD44v6在Pex中的表達(dá)水平明顯高于Npex(圖5A)。為了研究CD44v6是否能夠被傳遞到受體細(xì)胞中,我們采用蛋白合成抑制劑環(huán)己酰亞胺檢測(cè)加入Pex后CD44v6的蛋白水平。westernblot分析顯示,加入Pex后,HSCs中CD44v6的表達(dá)水平明顯增加(圖5B)。與Npex-孵育的細(xì)胞相比,CD44v6的表達(dá)水平保持不變(圖5B)。我們還進(jìn)行了免疫熒光分析,檢測(cè)出HSC膜中CD44v6與Pan-cadherin共定位(圖5C)。這些結(jié)果表明,Pex可將CD44v6輸送到HSC膜。此外,westernblot檢測(cè)表明,敲除CD44v6或使用抗CD44v6抗體的Pex強(qiáng)烈減弱了Pex誘導(dǎo)的IGF-1信號(hào)通路的***(圖5D)。同時(shí),在CD44v6-kdPex或CD44v6抗體的作用下,Pex誘導(dǎo)的HSC活化(圖5E,F(xiàn))、ECM重塑(圖5G)的積極作用***減少。為了闡明CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中的作用,我們進(jìn)一步研究了過表達(dá)CD44v6在HSC中是否與Pex具有同樣的***HSC的作用。然而,過表達(dá)CD44v6并沒有像預(yù)期的那樣提高α-SMA的表達(dá)(圖5H)。這些結(jié)果表明,CD44v6在Pex誘導(dǎo)的HSC***中發(fā)揮了重要作用。 阻斷atm依賴的磷酸化會(huì)損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配細(xì)胞功能課題CRO
***是心肌梗死、缺血性中風(fēng)和外周動(dòng)脈疾病(PAD)的主要潛在原因,是世界范圍內(nèi)的主要死亡原因。***是一種慢性炎癥性疾病,優(yōu)先發(fā)生在暴露于紊亂血流(d-flow)的動(dòng)脈區(qū)域,而暴露于穩(wěn)定血流(s-flow)的動(dòng)脈區(qū)域則受到保護(hù)。血流被內(nèi)皮細(xì)胞(ECs)中的機(jī)械傳感器識(shí)別,進(jìn)而***信號(hào)通路,導(dǎo)致基因表達(dá)、內(nèi)皮功能和***通路的調(diào)控。D-flow誘導(dǎo)ec中重要的原***通路,包括內(nèi)皮炎癥和功能障礙、滲透性功能障礙、血栓形成和內(nèi)皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EndMT)。相反,s-flow保護(hù)ec免受這些原***途徑的影響。WNT課題設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤(rùn)色。
鑒于以上結(jié)果,作者想進(jìn)一步探究tiRNA-Gly與RBM17作用的分子結(jié)果。結(jié)果顯示,tiRNA-Gly可提高總RBM17蛋白的水平,但是不影響RBM17的mRNA水平(圖3H-I)。隨后,用蛋白質(zhì)合成抑制劑環(huán)己胺(CHX)處理細(xì)胞,tiRNA-Gly轉(zhuǎn)染后增加了K1細(xì)胞內(nèi)源性RBM17蛋白的半衰期,而β-actin作為對(duì)照(圖3J)。此外,蛋白酶體抑制劑MG132處理后,內(nèi)源性RBM17在轉(zhuǎn)染tiRNA-Gly的K1細(xì)胞中的積累量**高于轉(zhuǎn)染siRNA-NC的K1細(xì)胞,表明tiRNA-Gly抑制了蛋白酶體依賴性的PTC細(xì)胞中RBM17的降解(圖3K)。此外,tiRNA-Gly的過表達(dá)***抑制了泛素化RBM17的水平(圖3L)。綜上所述,tiRNA-Gly可以穩(wěn)定RBM17蛋白通過泛素/蛋白酶體依賴性降解。
piRNA-30473在DLBCL中升高,是DLBCL患者的不良預(yù)后因素
作者首先研究小RNA的表達(dá)水平與DLBCL患者的臨床相關(guān)性。通過分析微陣列數(shù)據(jù),與預(yù)后不良組(PP)比較,在預(yù)后良好(FPP)的病例中發(fā)現(xiàn)了4個(gè)***下調(diào)或上調(diào)的piRNAs(圖1A)。在這四個(gè)差異表達(dá)RNA的基礎(chǔ)上,作者進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)與預(yù)后良好(FPP)的患者相比,預(yù)后不良患者(PP)的piRNA-30473表達(dá)水平***升高(圖1B),且DLBCL患者高水平的piRNA-30473與較差的總生存率相關(guān)(圖1C)。綜上所述,piRNA-30473可作為預(yù)后的生物標(biāo)志物,并可用于DLBCL患者的預(yù)后分層。 醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。
這些基因的體細(xì)胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53(31.4%)、PTEN(5.7%)、NOTCH1(3.6%)、CTNNB1(3.6%)、XIST(3.4%)和MALAT1(3.4%)。還觀察到在子宮內(nèi)膜體*(UCEC)中有相對(duì)較高的突變頻率(7.6%)。
在泛*中構(gòu)建 m6A 亞型和特征
我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在排除死亡比例的**后,27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關(guān)?<?10%。具體來說,我們定義了按中位生存時(shí)間(MST)排序的聚類。MST**長(zhǎng)的組定義為第1組,MST**短的組定義為第3組,中間組定義為第2組。與第1組相比,第2組和第3組在27種**中有22種的生存率***降低。此外,當(dāng)臨床結(jié)果為無進(jìn)展間期(PFI)時(shí),分類在大多數(shù)**類型中仍然***(16/26)或疾病特異性生存率(DSS)(18/26)。在總體人群的KM生存率分析中,m6A亞型在調(diào)整**類型后可***分層患者的生存率。四個(gè)體細(xì)胞突變?cè)诓煌琺6A亞型中的分布有***性差異,包括TP53、NOTCH1、CTNNB1和PTEN。 致力于醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)和相關(guān)生物醫(yī)學(xué)課題的研究。納米顆粒課題一站式
有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者。細(xì)胞功能課題CRO
遷移體(migrasome)是清華大學(xué)生命科學(xué)院俞立團(tuán)隊(duì)新發(fā)現(xiàn)的胞外分泌囊泡,該研究成果已于2015年發(fā)表在Cell Research期刊(IF=20.509)[1]。遷移體是在遷移細(xì)胞后部回縮纖維的前列或交叉處生長(zhǎng)的大囊泡,直徑約為0.5μm到3μm,并且包含許多較小的囊泡(**多300余個(gè),**少不足10個(gè)),掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結(jié)構(gòu)。細(xì)胞遷移后,回縮纖維**終斷裂,遷移體分離。遷移體及其內(nèi)容物,包括細(xì)胞溶質(zhì)成分和來源不明的囊泡,被釋放到細(xì)胞外空間——這一過程稱為遷移。俞立團(tuán)隊(duì)推測(cè)遷移體可能在細(xì)胞間通訊中發(fā)揮重要作用。
2017年俞立團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),整合素與 ECM 蛋白的配對(duì)結(jié)合決定了遷移體的形成[2],該研究成果也發(fā)表在Cell Research期刊。2108年俞立團(tuán)隊(duì)明確闡述了收集和檢測(cè)遷移體的實(shí)驗(yàn)方法[3]。2019年,俞立團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)Tspan4和膽固醇在遷移體形成時(shí)組織成為微米級(jí)大型微結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)即遷移體的基本結(jié)構(gòu),還證實(shí)遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結(jié)構(gòu)的剛度增加而產(chǎn)生的一種生物物理過程[4],該研究成果發(fā)表于Nature Cell Biology期刊中(IF=20.041)。 細(xì)胞功能課題CRO
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)