服務(wù)課題創(chuàng)新服務(wù)

來源: 發(fā)布時間:2021-10-29

四、FZD7是YTHDF1中真正的m6A修飾靶標

對于***腹肌Hippo或Wnt通路的13個轉(zhuǎn)錄本,我們采用了多步驟篩選策略(圖4A)。使用RIP結(jié)合qPCR驗證確定YTHDF1相互作用的轉(zhuǎn)錄本(4B)。Wnt途徑的FZD1、FZD7、CTBP2、MAPK9、MAP3K7等轉(zhuǎn)錄本,以及Hippo途徑的TP53BP1、PARD3、SMAD2、SMAD3等轉(zhuǎn)錄本均被YTHDF1抗體特異性免疫沉淀(4C)。YTHDF1基因敲除****降低了FZD7、MAPK9、SMAD2、SMAD3和PARD3的蛋白水平(圖4D),但它們的mRNA未受影響。m6A免疫沉淀反應(yīng)(m6A-IP)和YTHDF1 eCLIP和qPCR證實YTHDF1 對FZD7, MAPK9, SMAD2 SMAD3,和PARD3 mrna進行m6A修飾。FZD7的翻譯效率下調(diào)*****,而其他基因的翻譯效率均出現(xiàn)輕微的抑制(圖4G)。這些結(jié)果共同提示FZD7是YTHDF1在胃*中真正的直接靶點。
進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應(yīng)。服務(wù)課題創(chuàng)新服務(wù)

同時,白樺素并沒有促進HMGCR的降解(圖1B)。同樣,白樺素以Insig依賴的方式完全阻止了轉(zhuǎn)染SREBP-2的裂解(圖1C)。因此,白樺素特異性地抑制了SREBP的加工,但并不***LXR或加速HMGCR的降解。此外,在共免疫沉淀實驗中,白樺素刺激了SCAP和Insig-1之間的相互作用(圖1D, lanes 4和lanes 5),這暗示白樺素的作用機制。  

為了進一步測試白樺素是否通過與SCAP結(jié)合發(fā)揮作用,合成了一種白樺素衍生探針,命名為化合物1(圖2A)?;衔?包含一個光敏反應(yīng)基和一個疊氮乙酰基,可以通過點擊化學(xué)與生物素炔烴連接。與白樺素類似,化合物1可以抑制SREBP-2的加工(圖2B)?;衔?與膽固醇敲除的CHO細胞的膜組分孵育,然后暴露在紫外線下***交聯(lián)。紫外線照射后,用click化學(xué)方法粘貼生物素標簽。然后將膜球均質(zhì)化,與親和素結(jié)合的瓊脂糖孵育,以拉下白樺素結(jié)合蛋白。如圖2C所示,在化合物1和3 mM處,SCAP被沉淀,高濃度的白樺素可以取代其結(jié)合,說明白樺素與SCAP發(fā)生物理作用。作為陰性對照,用化合物1幾乎不沉淀轉(zhuǎn)鐵蛋白受體,白樺素競爭沒有影響(圖2C)??傊@些結(jié)果表明SCAP可能與白樺素結(jié)合,并且是其靶標。   課題國家自然科學(xué)基金英拜提供生物醫(yī)學(xué)課題外包服務(wù)。

    老年病是指人在老年期所患的與衰老有關(guān),并且有自身特點的疾病。老年人患病不僅比年輕人多,而且有其特點,主要是因為人進入老年期后,人體組織結(jié)構(gòu)進一步老化,各***功能逐步出現(xiàn)障礙,身體抵抗力逐步衰弱,活動能力降低,以及協(xié)同功能喪失。針對老年病的基因檢測,能有效判斷老年疾病的發(fā)生風(fēng)險,準確用以建立健康的個性化生活管理,達到及早預(yù)防、早***,延緩疾病發(fā)生的效果。英拜生物提供老年病風(fēng)險評估15項檢測:***、心房纖顫、心肌梗死等?;蛐酒?genechip)是目前生物芯片家族中完善、應(yīng)用*****的芯片,將許多特定的寡聚核苷酸或DN**段(稱為探針)固定在芯片的每個預(yù)先設(shè)置的區(qū)域內(nèi),將待測樣本標記后同芯片進行雜交,利用堿基互補配對原理進行雜交,通過檢測雜交信號并進行計算機分析,從而檢測對應(yīng)片段是否存在、存在量的多少,以用于疾病的臨床診斷和檢測等眾多方面。運用縮微技術(shù),基因芯片能夠同時分析成千上萬個生物樣本,將許多不連續(xù)的分析過程集成于玻璃介質(zhì)上,使這些分析過程連續(xù)化、微型化、集成化和自動化。

進一步使用E8聚類分析顯示,這些暴露于慢性d-flow的ec向免疫細胞樣類型(EndICLT)轉(zhuǎn)變,但沒有達到完全分化的免疫細胞狀態(tài)(圖3C和S3)。圖3D顯示了EC簇中EndMT、Tagln、Acta2、Cnn1和Snai1的四個標記物,分別**了s流(E2)、急性d流(E6)和慢性d流(E8)染色質(zhì)可及性的變化。與s-流(E2)和急性d-流(E6)相比,慢性d-流在E8的啟動子區(qū)域(箭頭)增加了這些基因的可及性。從scRNA-seq數(shù)據(jù)的小提琴圖中可以看出,E8中相應(yīng)基因的表達量增加,進一步證實了這一結(jié)果(圖3E)。

如圖4所示,與LS相比,慢性O(shè)S降低了KLF2和KLF4的表達,同時誘導(dǎo)了EndMT標記物(SNAI1和TAGLN)。重要的是,慢性O(shè)S誘導(dǎo)了兩個巨噬細胞標記基因(C1QC和C5AR1)的表達,直接證明了OS可以在體外誘導(dǎo)EndICLT。此外,我們利用小鼠PCL模型進行了一項en - face共免疫染色研究,以確定體內(nèi)CDH5+ ECs中是否表達巨噬細胞標記蛋白。如圖4A-4D所示,C1QA和LYZ在LCA ECs中明顯被誘導(dǎo),而在rca中沒有,這為血流誘導(dǎo)的eniclt提供了更有力的證據(jù)。我們分析了由基因本體結(jié)果確定的d-flow條件***的致***通路(圖2E)。 根據(jù)自身需要檢索相關(guān)基因或者化學(xué)品。

DNA生物標志物

DNA生物標記物是MarkerDB中比較大的一類標記物。MarkerDB中的DNA生物標記進一步分為26021個與209種疾病相關(guān)的DNA突變標記、353個與70種疾病相關(guān)的SNP標記和23個與16種傳染病相關(guān)的微生物/病毒基因。DNA突變數(shù)據(jù)(和臨床批準的突變試驗)來自GeneticTestingRegistry,序列數(shù)據(jù)從GenBank中提取,DNASNP生物標記物的主要來源是數(shù)據(jù)庫GWAS-ROCS,疾病信息從OMIM或GeneticsHomeReference中提取,關(guān)于微生物/病毒生物標記基因的剩余數(shù)據(jù)通過原始文獻或?qū)@麢z索獲得。目前,MarkerDB中的所有DNA標記都有一個或多個疾病關(guān)聯(lián),以及MarkerDBID、序列(標記了疾病變體)、詳細的基因描述(編碼區(qū)范圍內(nèi))、基因名稱/同義詞、一個或多個文獻參考和到其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接. 按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進行文章的構(gòu)思與潤色。常規(guī)課題地區(qū)科學(xué)基金

ATM對PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布。服務(wù)課題創(chuàng)新服務(wù)

miR-144在鼻咽*組織和細胞中上調(diào)

先前的文獻強調(diào)了miR-144在NPC發(fā)展過程中的促*作用。我們首先確定miR-144在NPC中的表達模式。采用qRT-PCR方法分析95例鼻咽*活檢標本和95例慢性鼻咽炎鼻咽活檢標本中miR-144的表達。結(jié)果表明,miR-144在鼻咽*組織中的表達水平高于在非*性鼻咽組織中的表達水平(圖1A),并通過原位雜交(ISH)進一步驗證(圖1B)。如圖1C所示,相對于非*性鼻咽組織,鼻咽*組織中CD31的免疫組化染色增強。在鼻咽*組織中,CD31的表達與miR-144的表達呈正相關(guān)(圖1D)。隨后,我們通過qRT-PCR比較了人鼻咽*細胞系(C666-1和SUNE1)和鼻咽上皮細胞系NP69之間miR-144的表達水平。與預(yù)期的一樣,C666-1和SUNE1細胞表現(xiàn)出相對于NP69更高水平的miR-144表達(圖1E)。以上結(jié)果提示,miR144在鼻咽*組織和細胞中呈高表達,與CD31表達呈正相關(guān),表明miR144與**血管生成具有潛在的相關(guān)性。 服務(wù)課題創(chuàng)新服務(wù)

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標書申請:提供標書課題設(shè)計、撰寫,標書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗