結(jié)腸炎課題產(chǎn)學(xué)研合作

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-28

    2017年俞立團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),整合素與ECM蛋白的配對(duì)結(jié)合決定了遷移體的形成[2],該研究成果也發(fā)表在CellResearch期刊。2108年俞立團(tuán)隊(duì)明確闡述了收集和檢測(cè)遷移體的實(shí)驗(yàn)方法[3]。2019年,俞立團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)Tspan4和膽固醇在遷移體形成時(shí)組織成為微米級(jí)大型微結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)即遷移體的基本結(jié)構(gòu),還證實(shí)遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結(jié)構(gòu)的剛度增加而產(chǎn)生的一種生物物理過程[4],該研究成果發(fā)表于NatureCellBiology期刊中(IF=)。并同年在同期刊中發(fā)表,遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生,Tspan4a和Tspan7(遷移體生成相關(guān)基因)突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損,并闡明遷移體誘導(dǎo)胚胎細(xì)胞至正確的位置,從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了關(guān)于遷移體標(biāo)志物的文章[6],該文章闡明了人血清中存在遷移體;與外泌體相比,遷移體中存在四種特異性蛋白:NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。2021年5月,俞立團(tuán)隊(duì)在Cell期刊(IF=)上發(fā)表文章,文章主要講述在外界刺激下,細(xì)胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月,俞立團(tuán)隊(duì)利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細(xì)胞遷移和神經(jīng)活動(dòng)。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。結(jié)腸炎課題產(chǎn)學(xué)研合作

4)CircMAPK1編碼109個(gè)氨基酸的新蛋白MAPK1-109aa

根據(jù)在線數(shù)據(jù)庫(kù)circRNADb的預(yù)測(cè)結(jié)果,circMAPK1序列中包含一個(gè)開放閱讀框,起始密碼子為ATG,IRES位于274-327nt。這一觀察結(jié)果表明circMAPK1具有編碼109aa蛋白的潛能,本研究將其命名為MAPK1-109aa(圖4a)。為了驗(yàn)證預(yù)測(cè)的IRES在circMAPK1中的活性,我們進(jìn)行了雙熒光素酶檢測(cè),結(jié)果顯示野生型IRES報(bào)告基因的熒光素酶活性明顯高于突變型IRES報(bào)告基因的熒光素酶活性(圖4b)。為了進(jìn)一步證實(shí)MAPK1-109aa的存在,我們將circMAPK1IRES突變質(zhì)粒和circMAPK1過表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)入HEK293T細(xì)胞。銀染色結(jié)果顯示,在分子量為13kDa時(shí)存在明顯的蛋白帶,與MAPK-109aa的預(yù)測(cè)大小一致。MS檢測(cè)到AMEIMLNSKLCL序列,與MAPK1-109aa含有特定C端序列LCL的氨基酸序列一致(圖4c)。 HE染色課題第三方實(shí)驗(yàn)室Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。

7)SsD克服了m6A介導(dǎo)的白血病對(duì)酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性由于FTO抑制使耐藥細(xì)胞對(duì)酪氨酸激酶抑制劑(TKI)***敏感,我們檢測(cè)了SsD對(duì)TKI耐藥細(xì)胞的療效。我們發(fā)現(xiàn)SsD聯(lián)合尼洛替尼或PKC412在降低細(xì)胞活力方面更有效(圖7A),這表明SsD***抑制了Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞的增殖。細(xì)胞的分子特征也顯示TKIS介導(dǎo)的m6A低甲基化被挽救(圖7B-C)。雖然SsD沒有改變Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞中ALKBH5、METTL3、YTHDF2的蛋白水平(圖7D),但TKI上調(diào)的m6A相關(guān)基因MerTK、BCL-2和STAT3的表達(dá)受損(圖7E)。與上述結(jié)果一致,MerTK、BCL-2和STAT3在TKI耐藥細(xì)胞的mRNA和蛋白水平上更穩(wěn)定

HOXBLINClncRNA在NPM1c+白血病中特異性上調(diào)

HOX基因,特別是HOXA和HOXB聚類基因的上調(diào)不僅是AML發(fā)病的特點(diǎn),也是其主要機(jī)制。HoxBlinclncRNA已經(jīng)被證明是在發(fā)育過程中***前HoxB基因轉(zhuǎn)錄所必需的。為了確定HOXBLINC是否與HOXB基因一起在AML中異常表達(dá),檢測(cè)了正常BMMNC細(xì)胞和CD34+陽(yáng)性細(xì)胞,以及NPM1c+AML病人中HOXBLINClncRNA的表達(dá),發(fā)現(xiàn)HOXBLINClncRNA在NPM1c+AML病人中***高表達(dá),在TCGA數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)一樣的結(jié)果(圖1A-B)。表明HOXBLINClncRNA在NPM1c+白血病中特異性上調(diào)。 阻斷atm依賴的磷酸化會(huì)損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配

二、腸道微生物群落動(dòng)態(tài)變化

確定每個(gè)個(gè)體部位12個(gè)**豐富的科。HSCT后,在腸內(nèi)第II期Lachnospiraceae的豐度減少,從檢查前的13%減少到第1周的4.7%,然后在第III期開始的第3個(gè)月恢復(fù)到27.5%(圖2A)。同時(shí),腸球菌科在II期的擴(kuò)張(檢查前:6.1%;第1周:22.8%)和第二階段的乳酸菌科(預(yù)檢:2%;第3個(gè)月后,第三階段分別減少到0.2%和0.6%(圖2A)。LDA在腸道中顯示了19個(gè)支系(共102個(gè)ASVs),這些支系在時(shí)間點(diǎn)上對(duì)樣品的分離效果比較好(圖2B)。兩個(gè)相當(dāng)有鑒別能力且LDA系數(shù)為正的進(jìn)化支系包括腸球菌科(Enterococcaceae)和乳酸桿菌科(Lactobacillaceae)的ASVs(圖2B)。從第3個(gè)月開始,它們的豐度再次下降到與預(yù)處理時(shí)間相當(dāng)?shù)乃?圖2C)。其中,ASV78的數(shù)量**多,觀察頻率比較高(圖2D),其16SrRNA部分基因序列與wexlerae序列相似性較高。另一項(xiàng)PCA分析也支持這些發(fā)現(xiàn)(圖2E)。腸球菌科(Enterococcaceae)在II期樣品中更為豐富,Lachnospiraceae和Ruminococcaceae在I期和III期樣品中更為豐富(圖2E)。 生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。snoRNA課題

可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。結(jié)腸炎課題產(chǎn)學(xué)研合作

并同年在同期刊中發(fā)表,遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生,Tspan4a和Tspan7(遷移體生成相關(guān)基因)突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損,并闡明遷移體誘導(dǎo)胚胎細(xì)胞至正確的位置,從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了關(guān)于遷移體標(biāo)志物的文章[6],該文章闡明了人血清中存在遷移體;與外泌體相比,遷移體中存在四種特異性蛋白:NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。

2021年5月,俞立團(tuán)隊(duì)在Cell期刊(IF=38.637)上發(fā)表文章,文章主要講述在外界刺激下,細(xì)胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月,俞立團(tuán)隊(duì)利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細(xì)胞遷移和神經(jīng)活動(dòng),并觀察了哺乳動(dòng)物在中性粒細(xì)胞遷移和**細(xì)胞循環(huán)過程中的各種亞細(xì)胞動(dòng)力學(xué)[8],該研究成果亦發(fā)表于Cell期刊中。 結(jié)腸炎課題產(chǎn)學(xué)研合作

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