有趣的是,研究報道S100A4可以增強STAT3的磷酸化,而STAT3的磷酸化與OPN的表達是相關(guān)的,并且STAT3被預(yù)測是OPN的潛在轉(zhuǎn)錄因子。因此,檢測了S100A4敲除和過表達后OPN表達,STAT3表達和STAT3磷酸化,結(jié)果顯示OPN表達和STAT3磷酸化水平與S100A4的變化趨勢一致;并且敲除STAT3后HCC細(xì)胞系中OPN表達和STAT3磷酸化被***抑制(圖5a-c)。這些結(jié)果表明S100A4可以***STAT3磷酸化并增加OPN表達。
為了進一步探究S100A4過表達外泌體對STAT3磷酸化和OPN表達的影響,使用該外泌體預(yù)處理HCC細(xì)胞,結(jié)果顯示它可以***促進STAT3磷酸化和OPN表達,以及S100A4的表達(圖5d)。此外,在原位異種移植瘤模型中,HMH-exo***增強了核STAT3磷酸化和細(xì)胞質(zhì)OPN的表達(圖5e-f)??傊?,以上結(jié)果表明S100A4過表達外泌體促進低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移潛力,而外泌體S100A4是HCC細(xì)胞的關(guān)鍵增強子,其通過***STAT3的磷酸化和上調(diào)OPN的表達實現(xiàn)其功能(圖6a)。 TIMEOR是***個基于 Web 的自適應(yīng)時間序列多組學(xué)管道方法。炎癥因子課題技術(shù)指導(dǎo)
在基礎(chǔ)條件下,F(xiàn)th-KO小鼠皮層中鐵穩(wěn)態(tài)輕度受損
使用蛋白質(zhì)印跡分析,實時PCR和Fth免疫熒光證實了在基礎(chǔ)條件下神經(jīng)元Fth表達的喪失。Fth-KO小鼠的FTHmRNA和蛋白表達較低。我們還通過免疫熒光觀察了Fth的神經(jīng)元水平。從他莫昔芬處理的皮層神經(jīng)元Fth-KO小鼠具有減少的免疫原性FTH的。重要的是,在神經(jīng)元中觀察到幾乎罕見FTH陽性細(xì)胞Fth-KO小鼠。有趣的是,神經(jīng)元中Fth的喪失并未導(dǎo)致Ftl表達的代償性增加。接下來,檢查了神經(jīng)元Fth在鐵代謝和氧化還原穩(wěn)態(tài)中的假定作用。Fth-KO組與對照組相比,皮質(zhì)Fe2+,F(xiàn)e3+,總鐵水平***增加。Perls的藍色染色顯示在生理條件下,在Fth-KO中觀察到的鐵陽性細(xì)胞相對較少。這些結(jié)果表明,F(xiàn)th-KO小鼠具有活力和繁殖力,但鐵代謝發(fā)生了改變,這提供了神經(jīng)元鐵蛋白的鐵存儲功能在維持皮質(zhì)鐵穩(wěn)態(tài)基礎(chǔ)條件中起重要作用的證據(jù)。 焦亡生物相關(guān)課題詢問報價也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點。
3)CircMAPK1在體內(nèi)抑制胃*的發(fā)生和轉(zhuǎn)移
為了進一步證實體外研究結(jié)果,我們在體內(nèi)驗證了circMAPK1在影響致瘤性方面的生物學(xué)作用。circMAPK1的沉默可***促進**的生長。相比之下,過表達circMAPK1***抑制了皮下**的生長(圖3a)。接下來,我們通過對增殖細(xì)胞標(biāo)記物Ki67的染色來監(jiān)測異種移植瘤的增殖。穩(wěn)定敲除circMAPK1的**組織表現(xiàn)出更強的Ki67染色,而過表達circMAPK1的**組織表現(xiàn)出更弱的Ki67染色(圖3b和c)。為了研究circMAPK1在體內(nèi)的轉(zhuǎn)移潛能,我們用熒光素酶質(zhì)粒穩(wěn)定地轉(zhuǎn)染上述細(xì)胞系,然后注射到裸鼠的尾靜脈中。結(jié)果顯示,circMAPK1的敲低有效地增加了肺轉(zhuǎn)移病灶的數(shù)量和大小。相比之下,生物發(fā)光成像(圖3d和e)和H&E染色(圖3f和g)顯示,過表達circMAPK1減少了肺轉(zhuǎn)移病變。
二、胎兒造血過程中分化軌跡的推斷
接下來,研究者使用力導(dǎo)向圖繪制算法推斷了人類胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的分化軌跡。結(jié)果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端,并且在HSCs/MPPs下游,研究者鑒定了三個高度增殖的寡能祖細(xì)胞群,即MEMPs(紅系細(xì)胞、MKs和肥大細(xì)胞);GPs(粒細(xì)胞);LMPs(淋巴樣細(xì)胞、單核細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞)(圖2A和2B)。并使用Scanpy的paga_path函數(shù)顯示了沿三條分化途徑(MEMPs、GPs和LMPs)的譜系特異性基因動態(tài)表達(圖2C)。MEMPs將hsc / mpp與MKs、紅細(xì)胞和肥大細(xì)胞連接起來。與此一致的是,HSC/MPP向MEMPs轉(zhuǎn)化的差異調(diào)控基因包括MK/紅系/肥大細(xì)胞譜系特異性基因,如GATA1、ITGA2B、PLEK、KLF1、HDC和MS4A3(圖2C)。 按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進行文章的構(gòu)思與潤色。
***是一種系統(tǒng)性疾病,與炎癥細(xì)胞浸潤和免疫相關(guān)途徑的***有關(guān)。本文旨在揭示與免疫相關(guān)的變化,并探索頸***斑塊形成過程中的新型免疫學(xué)特征。首先,我們應(yīng)用了集成的生物信息學(xué)方法,包括CIBERSORT和基因集富集分析(GSEA)。基因表達矩陣GSE28829,GSE41571和GSE43292是從基因表達綜合(GEO)數(shù)據(jù)集獲得的。經(jīng)過一系列數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟后,使用CIBERSORT,GSEA和ClusterProfiler軟件包對所得的組合表達矩陣進行了分析。在對早期和晚期頸***斑塊進行比較和分析后,我們發(fā)現(xiàn),在晚期斑塊中活化記憶CD4T細(xì)胞的百分比較高,而靜息記憶CD4細(xì)胞的百分比較低。此外,記憶CD4T細(xì)胞的***可以促進頸***斑塊的發(fā)展。另外,F(xiàn)OXP3tTreg細(xì)胞成熟也可以參與頸動脈斑塊的進展。公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫。cancer免疫課題實驗外包
有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者。炎癥因子課題技術(shù)指導(dǎo)
近日,美國圣路易斯華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發(fā)布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中,作者采用單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組snRNA-seq和單細(xì)胞核染色質(zhì)可及性snATAC-seq技術(shù),對5個健康成人(50歲到62歲,男性(n = 3)和女性(n = 2))腎臟樣本進行檢測。此文揭示腎臟內(nèi)獨特的細(xì)胞狀態(tài),并重新定義近端小管和粗升肢的細(xì)胞異質(zhì)性。炎癥因子課題技術(shù)指導(dǎo)
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗