細(xì)胞凋亡基因芯片

5、hUC-MSCs調(diào)節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞Sirt1/p53信號(hào)通過(guò)miR-199a-5p

文獻(xiàn)報(bào)道在**和自身免疫疾病中，hUC-MSCs能夠?qū)iRNAs轉(zhuǎn)移到周圍的細(xì)胞。因此，作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導(dǎo)的對(duì)脾CD4+T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)調(diào)控。使用在線軟件Targetscan識(shí)別了10個(gè)miRNA，這些miRNA被預(yù)測(cè)靶向Sirt1。qPCR分析顯示，在這10個(gè)miRNAs中，只有miR-199a-5p的表達(dá)在MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中***降低(圖5A)。此外，miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達(dá)增加的miRNA(圖5A)。事實(shí)上，miR-199a-5pmimic不僅可以提高M(jìn)RL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中miR-199a-5p的水平，降低Sirt1的表達(dá)(圖5B-C)，而且還可以提高衰老標(biāo)志物p21、p16和乙?；痯53的表達(dá)水平(圖5D)。 英拜生物對(duì)整體實(shí)驗(yàn)實(shí)施的全局把控。細(xì)胞凋亡基因芯片

3.構(gòu)建微生物群共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行聚類分析

使用SparCC算法構(gòu)建差異ASV共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)。

分析并比較了腺瘤和對(duì)照組中生物標(biāo)志物的模式，將它們進(jìn)一步組裝成具有不同分類學(xué)組成的四個(gè)簇。這些簇與患者的年齡，性別和BMI等特征沒(méi)有緊密聯(lián)系。此外，還探討了CRC患者腸道菌群在24種生物標(biāo)記物組中的共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)，并產(chǎn)生了三個(gè)簇。聚類1的細(xì)小螺旋藻科物種被分配的ASV**少，而聚類2在分類學(xué)上是異質(zhì)的，在CRC個(gè)體中患病率較高。

4.結(jié)腸*、腺瘤分類模型的驗(yàn)證

結(jié)果表明，微生物來(lái)源的生物標(biāo)志物組在檢測(cè)大腸腺瘤方面優(yōu)于FIT，并且它們的組合可以提高非侵入性腺瘤診斷的準(zhǔn)確性。

5.在**隊(duì)列中驗(yàn)證結(jié)直腸腺瘤標(biāo)志物

本研究納入了另外兩個(gè)來(lái)自美國(guó)（驗(yàn)證組1）和中國(guó)（驗(yàn)證組2）的**隊(duì)列。驗(yàn)證隊(duì)列1由70名對(duì)照和102例腺瘤患者組成，而驗(yàn)證隊(duì)列2中有57例腺瘤患者和52例CRC患者。 神經(jīng)退行性疾病英拜生物致力于分子生物行業(yè)十余年。

通過(guò)在晚期核內(nèi)體上產(chǎn)生PI(3)P, INPP4B通過(guò)Hrs促進(jìn)晚期核內(nèi)體的形成。***的shrna介導(dǎo)的Hrs耗散(補(bǔ)充圖6a, b)導(dǎo)致gfp載體細(xì)胞中cd63陽(yáng)性晚期核內(nèi)體減少，并將GFPINPP4B細(xì)胞中晚期核內(nèi)體形成增加的水平逆轉(zhuǎn)為gfp載體控制水平(圖5a, b)。在非錨定細(xì)胞生長(zhǎng)試驗(yàn)中，耗用Hrs shRNA對(duì)gfp載體軟瓊脂集落的大小沒(méi)有影響，但減少了GFP-INPP4B細(xì)胞集落的大小，這與Hrs依賴的細(xì)胞增殖一致(圖5c, d)。將MCF-7細(xì)胞注射到雌性BALB/c裸小鼠腹股溝第四乳腺脂肪墊中，在體內(nèi)檢測(cè)**生長(zhǎng)的hrs依賴性。與GFPvector相比，GFP-INPP4B在體內(nèi)**體積和體外**重量***增加(3倍)(圖5e g)。雖然敲除Hrs沒(méi)有影響gfp載體**的大小和重量，但GFP-INPP4B**的增強(qiáng)生長(zhǎng)被減少Hrs抑制(圖5e g)，表明INPP4B促進(jìn)pik3a突變ER+乳腺*細(xì)胞的增殖和**生長(zhǎng)以hrsdependence的方式。

TRIM25的RNA結(jié)合活性對(duì)于其對(duì)底物的泛素連接酶活性是必需的。構(gòu)建了一個(gè)帶有FLAG標(biāo)記RNA結(jié)合域（RBD）缺失突變體。TRIM25ΔRBD不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平，對(duì)IGF2BPs的泛素化水平?jīng)]有明顯影響，表明TRIM25完整的RBD對(duì)于IGF2BPs的有效泛素化和降解是必要的。這些結(jié)果表明，TRIM25通過(guò)泛素-蛋白酶體途徑促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中IGF2BPs的降解，并且TRIM25的RNA結(jié)合活性對(duì)其在底物泛素化中的作用至關(guān)重要。

已經(jīng)顯示，TRIM25使用RNA作為其靶標(biāo)有效泛素化的支架。然后，探討了TRIM25對(duì)IGF2BPs的泛素連接酶活性是否取決于circNDUFB2的存在。 circNDUFB2的丟失顯示了TRIM25對(duì)IGF2BPs泛素化和降解的顯著減弱作用。進(jìn)一步驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)并檢查circNDUFB2是否充當(dāng)支架來(lái)增強(qiáng)TRIM25與IGF2BP的結(jié)合，進(jìn)行了Co-IP分析。在帶有circNDUFB2但沒(méi)有circNDUFB2-MUT過(guò)表達(dá)的A549細(xì)胞中，TRIM25和IGF2BP之間的關(guān)聯(lián)得到增強(qiáng)。由于circNDUFB2對(duì)RNA核酸外切酶的抗性，使用RNase A***會(huì)嚴(yán)重破壞相互作用。此外，在METTL3 / 14敲低后，IGF2BP的泛素化作用顯著降低。結(jié)果表明，circNDUFB2充當(dāng)支架，以增強(qiáng)TRIM25和IGF2BPs之間的相互作用，隨后促進(jìn)TRIM25介導(dǎo)的IGF2BPs泛素化和降解。 按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤(rùn)色。

表觀基因組學(xué) (ChIP-Seq) 模塊

ChIP-seq 模塊目前包含大量染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序 (ChIP-seq) 數(shù)據(jù)，反映了特定的衰老相關(guān)基因座是如何受組蛋白修飾和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)的。這些數(shù)據(jù)有助于闡明調(diào)控因素如何在全基因組范圍內(nèi)影響衰老過(guò)程中的基因表達(dá)。ChIP-seq 數(shù)據(jù)來(lái)自已發(fā)表的與衰老相關(guān)的文章，并使用相同的分析方法處理原始數(shù)據(jù)以保持一致性。直觀地顯示了衰老過(guò)程中特定基因組位點(diǎn)不同轉(zhuǎn)錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。

蛋白質(zhì)組學(xué)（蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用）模塊

衰老過(guò)程中蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)受損是典型的，蛋白質(zhì)相互作用隨著年齡的增長(zhǎng)而發(fā)生顯著變化。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用模塊（PPI）旨在允許查詢感興趣的蛋白質(zhì)及其與衰老相關(guān)的相互作用蛋白。結(jié)果以兩種方式呈現(xiàn)：交互式表格和網(wǎng)絡(luò)圖。前者提供了更詳細(xì)的信息，包括相互作用蛋白的數(shù)量、細(xì)胞/組織類型和支持相互作用的出版物；后者允許蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的可視化，并提供使用在線工具對(duì)選定數(shù)據(jù)執(zhí)行基因本體或 KEGG 通路分析的選項(xiàng)。因此，PPI 將成為分析細(xì)胞衰老過(guò)程中關(guān)鍵蛋白質(zhì)相互作用的有用模塊，從而可以在蛋白質(zhì)水平上更好地了解人類衰老。 表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。細(xì)胞凋亡基因芯片

TRF測(cè)序課題整體服務(wù)。細(xì)胞凋亡基因芯片

PTEN表達(dá)檢測(cè)的總有效率約為70%，而PTEN表達(dá)陰性患者的總有效率*為20%。PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩(wěn)定性有關(guān)。此外，小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(mef)中PTEN基因的缺失導(dǎo)致了未修復(fù)的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認(rèn)為通過(guò)至少兩種分子機(jī)制促進(jìn)了基因組的完整性。在細(xì)胞核中，PTEN與著絲粒結(jié)合蛋白CENP-C結(jié)合，促進(jìn)著絲粒組裝和中期到后期的轉(zhuǎn)變。此外，作為轉(zhuǎn)錄因子E2F1的輔助因子，核PTEN似乎調(diào)節(jié)Rad51的表達(dá)，Rad51是DNA修復(fù)機(jī)制的關(guān)鍵組成部分。然而，后續(xù)的研究得出了不一致的結(jié)果，表明PTEN在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)RAD51的調(diào)控可能***于特定的細(xì)胞環(huán)境。PTEN缺陷改變了多個(gè)細(xì)胞周期檢查點(diǎn)，可能留下更少的時(shí)間進(jìn)行DNA損傷修復(fù)和/或染色體分離。細(xì)胞周期的進(jìn)展需要幾個(gè)分子過(guò)程的完美執(zhí)行，以確保一個(gè)熟練的，無(wú)錯(cuò)誤的，細(xì)胞分裂。這些事件發(fā)生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定，CDKs磷酸化關(guān)鍵底物以促進(jìn)DNA合成和有絲分裂進(jìn)程細(xì)胞凋亡基因芯片

公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)