長期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn),都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基因組整合潛力,需要通過長期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn);...
CIRCLE-seq原理。細(xì)胞內(nèi)檢測方法由于提純的基因組已經(jīng)消化去除了組蛋白,結(jié)構(gòu)較細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)更為松散,理論上容易找到更多的脫靶位點(diǎn)。為捕獲CRISPR在細(xì)胞內(nèi)工作時(shí)真實(shí)發(fā)生的脫靶切割,研究者們也設(shè)計(jì)了一些細(xì)胞內(nèi)的脫靶位點(diǎn)檢測方法。1) Guide-seq...
CIRCLE-Seq,將gDNA打斷并環(huán)化,環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育,NGS測序檢測線性化的DNapian段,確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測序,成本相對較低,能檢測低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評估,安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評估服務(wù)...
使用核酸載體進(jìn)行基因轉(zhuǎn)導(dǎo)或修飾時(shí),應(yīng)持續(xù)關(guān)注細(xì)胞產(chǎn)品中載體系統(tǒng)的殘留情況,分析外源在基因組中的插入位置、拷貝數(shù)等,監(jiān)控基因編輯用酶的細(xì)胞內(nèi)持續(xù)表達(dá)時(shí)間等,并在受試者給藥后進(jìn)行長期安全性監(jiān)測。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時(shí),需要進(jìn)一步研究確...
一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中,但近年來已發(fā)現(xiàn)載體基因整合到特定基因座中導(dǎo)致的可能性。建議設(shè)計(jì)時(shí)充分考慮重組載體的安全性,關(guān)注目的基因的啟動子選擇、給藥劑量、整合區(qū)域等多種相關(guān)因素。建議對病毒載體進(jìn)行全基因組測序。另外,也可將病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)目標(biāo)細(xì)胞后,...
近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個(gè)方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhi...
當(dāng)載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險(xiǎn)特征增加時(shí),例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)粒或改變給yaofang式以提高整合能力等,需要提高對長期隨訪觀察的要求;反之,也可以對目前認(rèn)為存在遲發(fā)風(fēng)險(xiǎn)的基因zhiliao載體進(jìn)行修飾,以降低這些風(fēng)險(xiǎn)。長期表達(dá),與其...
物流:夠低溫嗎?CGT 供應(yīng)鏈本質(zhì)上是以患者為中心的,因?yàn)榛颊呒瓤梢允侵圃斓纳嫌我部梢允窍掠巍Mㄟ^自體療法,從體內(nèi)提取細(xì)胞,進(jìn)行操作,然后將其注射回同一位患者體內(nèi),從而創(chuàng)建了一個(gè)被稱為“靜脈到靜脈”的供應(yīng)鏈。一個(gè)完美的 CGT 供應(yīng)鏈需要從頭到尾進(jìn)行嚴(yán)格的流程...
免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量描述,很多免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的細(xì)胞組成并非均一,往往包含多種類型的細(xì)胞,起主要zhiliao作用的可能是其中一種細(xì)胞類型,但不良反應(yīng)可能受同一產(chǎn)品中其它類型細(xì)胞的影響。在描述免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的劑量時(shí),需要考慮產(chǎn)...
拷貝數(shù),是指某基因(可以是質(zhì)粒)在某一生物的基因組中的個(gè)數(shù)。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個(gè),多拷貝則指有多個(gè)。在細(xì)菌細(xì)胞中,根據(jù)復(fù)制特性,質(zhì)粒分嚴(yán)緊型和松弛型兩類,前者在細(xì)胞中只含1?2個(gè),而后者含10?15個(gè)以上。恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、宿...
在開展除惡性liu外其他適應(yīng)癥的臨床研究時(shí),每一劑量水平的受試者數(shù)量還應(yīng)考慮不同適應(yīng)癥人群對風(fēng)險(xiǎn)的可接受程度,或者安全性的評價(jià)要求,可能需要通過更大的樣本量提供更充分的安全性信息。此外,其他研究目的,如耐受性、制備可行性和藥理學(xué)活性評估,也可能影響樣本量或劑量...
CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段,然后首尾相連成環(huán)狀DNA,這種方法很好地避...
堿基編輯器:CBE:胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base editor,CBE),依賴于胞嘧啶核苷脫氨基酶,通過將胞嘧啶核苷脫氨轉(zhuǎn)換為尿嘧啶核苷,尿嘧啶核苷在DNA復(fù)制和修復(fù)過程中會轉(zhuǎn)換為胸腺嘧啶核苷,從而實(shí)現(xiàn)C到T的轉(zhuǎn)換。已開發(fā)出四代CBE(BE1、...
載體拷貝數(shù)一般檢測方法有:若是測序結(jié)果,可選用censor軟件檢測相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標(biāo)記的核酸探針進(jìn)行雜交,在與探針有同源序列的固相D...
2020年9月發(fā)布的《細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品申請臨床試驗(yàn)藥學(xué)研究和申報(bào)資料的考慮要點(diǎn)》“生產(chǎn)工藝開發(fā)的技術(shù)要求”及“質(zhì)量研究和質(zhì)量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色體中的整合情況及提供細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化(成瘤性和致瘤性)進(jìn)行安全性研究和評估內(nèi)容。2020...
4目前已有多個(gè)產(chǎn)品經(jīng)美國、歐盟、中國批準(zhǔn)上市,5適應(yīng)癥涉及急性B淋巴細(xì)胞白血病、B淋巴細(xì)胞瘤、多發(fā)性骨髓6瘤。由于CAR-T細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)和作用機(jī)制,在開展CAR-7T臨床試驗(yàn)過程中也暴露出了細(xì)胞因子釋放綜合征(Cytokine8releases...
目前鼓潤已掌握了該項(xiàng)技術(shù),簡述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標(biāo)基因組位點(diǎn)的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時(shí)轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點(diǎn)處...
流式檢測CAR+T細(xì)胞數(shù)量,較,作者用FC流式評估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細(xì)胞的數(shù)量。在CAR-T細(xì)胞給藥后5個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)冷凍的PBMCs上對UPN#009(軸細(xì)胞)和UPN#020(組織細(xì)胞)進(jìn)行了回顧性FC...
目前鼓潤已掌握了該項(xiàng)技術(shù),簡述如下:1、CRISPR與dsODNtag整合的實(shí)驗(yàn)技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標(biāo)基因組位點(diǎn)的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時(shí)轉(zhuǎn)染入真核細(xì)胞,CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后,dsODNtag將整合入斷點(diǎn)處...
對特定類型基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品的特殊考慮鑒于基因修飾細(xì)胞的產(chǎn)品種類繁多、各有特點(diǎn),除上述一般技術(shù)要求外,還應(yīng)基于產(chǎn)品的特性進(jìn)行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。CAR或TCR修飾的免疫細(xì)胞對于嵌合抗原受體(Chimericantigenrec...
慢病毒整合事件要素及檢測方法要求:對于食藥監(jiān)局指導(dǎo)性文件和既往研究內(nèi)容,我們不難發(fā)現(xiàn)對于慢病毒整合檢測所謂整合事件至少包含三個(gè)要素:整合位置;整合方向;特定整合位置和整合方向的juedui克隆數(shù)目;因此檢測在定性和定量性能方面都有要求,檢測方法需要結(jié)合臨床樣本...
拷貝數(shù)對于質(zhì)粒載體,拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實(shí)際上,每個(gè)細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì),可以把質(zhì)粒分為兩類:嚴(yán)緊型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時(shí),質(zhì)粒也復(fù)制一次,每個(gè)細(xì)菌內(nèi)只含1~2個(gè)質(zhì)粒;松弛型質(zhì)粒:當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后仍...
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個(gè)非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zh...
基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)...
f如果RCT設(shè)計(jì)不可行,申請人可能在確證性臨床試驗(yàn)中采用單臂試驗(yàn)(singlearmtrial,SAT)。在這種情況下,申請人應(yīng)解釋無法開展RCT試驗(yàn)的理由并提供相應(yīng)研究證據(jù),并有必要利用回顧性數(shù)據(jù)、前瞻性真實(shí)世界研究、薈萃分析或流行病學(xué)調(diào)查等數(shù)據(jù)及探索性研究...
用低拷貝質(zhì)粒作表達(dá)載體有什么好處?因?yàn)楦呖截愘|(zhì)粒穩(wěn)定性低,而且給宿主細(xì)胞的壓力大。低拷貝數(shù)的質(zhì)粒DNA在宿主細(xì)胞分裂前只能復(fù)制1~2次,而多拷貝數(shù)質(zhì)??梢栽诩?xì)胞分裂前復(fù)制成10~200拷貝。高拷貝數(shù)的質(zhì)粒稱為松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid),單獨(dú)于細(xì)...
近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個(gè)方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhi...
主要有兩方面的原因:一方面,高拷貝數(shù)時(shí)外源基因的表達(dá)量不再由質(zhì)粒的拷貝數(shù)決定,可能是由轉(zhuǎn)錄和翻譯水平?jīng)Q定的;另一方面,高拷貝數(shù)的質(zhì)粒往往很不穩(wěn)定。由于質(zhì)??截悢?shù)的變化直接與基因目標(biāo)產(chǎn)物的產(chǎn)率有關(guān),因此對于重組蛋白的生產(chǎn)來說,質(zhì)粒的拷貝數(shù)是一個(gè)非常重要的參數(shù)。同...
以上長期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型,具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時(shí)間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累,研究者和研究申辦...
4嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)-T細(xì)胞5(CAR-T)是指通過基因修飾技術(shù),使用病毒等載體將帶有特異6性抗原識別結(jié)構(gòu)域、鉸鏈區(qū)、跨膜區(qū)、共刺激信號jihuo區(qū)等遺傳7物質(zhì)轉(zhuǎn)入自體或異體T細(xì)胞形成的。CAR-T回輸?shù)交颊?..