為了探討UCP1與AKI之間的相關(guān)性,我們?cè)隗w內(nèi)、體外檢測(cè)了UCP1在AKI模型中的表達(dá)。結(jié)果顯示,UCP1在AKI小鼠中***下調(diào),更重要的是,隨著腎損傷的加重,其表達(dá)量逐漸降低(圖2E-F)。在體外,隨著順鉑刺激時(shí)間的延長(zhǎng),HK2細(xì)胞中UCP1的表達(dá)降低(圖2G)。這些結(jié)果表明UCP1與AKI的嚴(yán)重程度呈負(fù)相關(guān)。此外,隨著AKI腎細(xì)胞損傷程度的增加,脂質(zhì)的積累,UCP1的表達(dá)逐漸降低(圖2H)。這一結(jié)果表明,UCP1在AKI中的表達(dá)可能影響脂質(zhì)積累。
3)AKI中的脂質(zhì)積累與UCP1高度負(fù)相關(guān)在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)
后,我們?cè)噲D闡明其潛在的關(guān)系。首先,我們使用UCP1特異性過表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動(dòng)劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示,UCP1過表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。天津課題國家自然科學(xué)基金
乳腺*(BrCa)是世界范圍內(nèi)**常見的**,診斷為IV期患者的5年相對(duì)生存率有所下降。晚期BrCa被認(rèn)為是不可***的,目前仍缺乏有效的***策略。識(shí)別和表征新的**抑制基因?qū)τ诮⒂行У耐砥贐rCa預(yù)后生物標(biāo)志物或***靶點(diǎn)非常重要。2021年3月發(fā)表于Theranostics(IF=11.556)的文獻(xiàn)“Tumor suppressor DRD2 facilitates M1 macrophages and restricts NF-κB signaling to trigger pyroptosis in breast cancer”對(duì)此展開了研究。在本文中,在BrCa中,DRD2被發(fā)現(xiàn)由于啟動(dòng)子甲基化而下調(diào)。DRD2的高表達(dá)與更長(zhǎng)的生存時(shí)間正相關(guān),尤其是在HER2陽性患者中。DRD2還能促進(jìn)BrCa細(xì)胞對(duì)紫杉醇的敏感性。DRD2異位表達(dá)***抑制BrCa**發(fā)生。在體內(nèi)和體外,DRD2也能誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和壞死。DRD2通過與β-arrestin2、DDX5和eEF1A2相互作用抑制NF-κB信號(hào)通路的***。有趣的是,DRD2還調(diào)節(jié)微環(huán)境,促進(jìn)巨噬細(xì)胞M1極化,并觸發(fā)GSDME執(zhí)行的焦亡。陜西課題詢問報(bào)價(jià)動(dòng)物建模模型實(shí)驗(yàn)的整體服務(wù)。
1肺腺*(LUAD)細(xì)胞及其細(xì)胞系中均可通過選擇性剪接產(chǎn)生mRNAPD-L1亞型LncRNAPD-L1為探索LUAD不同階段PD-L1蛋白的表達(dá)量異,對(duì)PD-L1蛋白陽性和陰性樣品均進(jìn)行了mRNAPD-L1表達(dá)的檢測(cè),結(jié)果在198bp和92bp處都擴(kuò)增出了條帶。Sanger測(cè)序結(jié)果顯示,198bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而92bp處條帶為非編碼亞型PD-L1(PD-L1-Lnc)。為進(jìn)一步證實(shí),設(shè)計(jì)了探針對(duì)缺失片段進(jìn)行檢測(cè),在878bp和705bp處檢測(cè)出兩條條帶,878bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而705bp的條帶顯示與PD-L1mRNA相比,第4個(gè)外顯子中存在106nt的序列缺失,第5個(gè)和第6個(gè)外顯子之間存在67nt的缺失。通過BASESCOPE顯色實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在肺*組織中mRNAPD-L1(藍(lán)點(diǎn))和LncRNAPD-L1(紅點(diǎn))存在明顯的共表達(dá)接下來,作者設(shè)計(jì)了PD-L1mRNA和PD-L1-Lnc的特異性探針,對(duì)這些RN**段進(jìn)行定量,通過PCR探針擴(kuò)增并進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè),檢測(cè)到PD-L1蛋白陽性和陰性樣品中在PD-L1mRNA和PD-L1-ln數(shù)量一致。
然后,我們?cè)贖460和H1299細(xì)胞中測(cè)量了USP35敲除和TKI之間的協(xié)同效應(yīng),數(shù)據(jù)表明USP35沉默在體內(nèi)和體外使H460和H1299細(xì)胞對(duì)GFB化療敏感(圖9F-H)。值得注意的是,EGFR突變的肺*細(xì)胞對(duì)TKI更敏感,因此我們?cè)u(píng)估了USP35沉默是否會(huì)使H1650細(xì)胞對(duì)GFB化療敏感。如圖9I,J所示,USP35沉默進(jìn)一步抑制了GFB***后H1650細(xì)胞的生長(zhǎng)、集落形成和**進(jìn)展??偟膩碚f,USP35缺乏的肺*細(xì)胞對(duì)化療藥物更敏感。
結(jié)論:FPN蛋白穩(wěn)定性和肺*細(xì)胞的鐵輸出需要USP35,從而保持細(xì)胞內(nèi)鐵穩(wěn)態(tài)和**生長(zhǎng)。而USP35敲除通過減少游離鐵輸出增加細(xì)胞內(nèi)LIP水平和鐵死亡,并伴隨著肺*細(xì)胞生長(zhǎng)、定殖和**形成的減少,以及對(duì)DDP和PTX化學(xué)敏感性的增加。因此USP35是一個(gè)很有前途的肺****靶點(diǎn)。 解決了對(duì)確定因果調(diào)節(jié)機(jī)制網(wǎng)絡(luò)的方法的關(guān)鍵需求。
相反,miR-199a-5p抑制劑處理可提高WT小鼠脾CD4+ T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)(圖5E),并降低衰老標(biāo)志物p21, p16和乙酰p53水平(圖5F)。***,與MRL/lpr相比,hUC-MSCs可增加miR-199a-5p的產(chǎn)生,表明hUC-MSCs是miR-199a-5p來源的關(guān)鍵調(diào)控因子 (圖5G)。在transwell系統(tǒng)中,hUC-MSCs與MRL/lpr脾CD4+ T細(xì)胞共培養(yǎng)48 h后,細(xì)胞內(nèi)miR-199a-5p升高,Sirt1基因表達(dá)降低,CD4+ T細(xì)胞中衰老標(biāo)志物的表達(dá)水平恢復(fù),而miR-199a-5p抑制劑處理后仍處于抑制狀態(tài)(圖5G-I)??偟膩碚f,這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p介導(dǎo)的Sirt1下調(diào)和隨后p53去乙?;臏p少,增加了脾臟CD4+ T細(xì)胞的衰老。高通量測(cè)序后續(xù)的機(jī)制實(shí)驗(yàn)。天津課題國家自然科學(xué)基金
Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。天津課題國家自然科學(xué)基金
二、改進(jìn)標(biāo)簽轉(zhuǎn)移和差異分析
研究了方法差異對(duì)下游生物學(xué)分析的影響
A.B.去除中性粒細(xì)胞**提高了在細(xì)胞核和細(xì)胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細(xì)胞類型的能力.
C使用這些工具,中性粒細(xì)胞的去除提高了標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分,與核基方法相比,滲透性細(xì)胞產(chǎn)生了更多具有高標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分的細(xì)胞.
D所有方法產(chǎn)生的CD16+單核細(xì)胞均少于流式細(xì)胞術(shù)觀察到的CD16+單核細(xì)胞,這表明無論是使用核或通透細(xì)胞的scATAC-seq過程中,CD16+單核細(xì)胞可能丟失,或者標(biāo)簽轉(zhuǎn)移方法不利于識(shí)別這種細(xì)胞類型. 天津課題國家自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)