PGE2 增強(qiáng) IL4Rα 信號(hào)以增強(qiáng)巨噬細(xì)胞的 M2 ***
巨噬細(xì)胞能夠響應(yīng)可變的局部微環(huán)境信號(hào)從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經(jīng)典的信號(hào)級(jí)聯(lián)(例如,IL4/IL4Rα),巨噬細(xì)胞還可以整合由細(xì)胞外刺激觸發(fā)的代謝線索,以***它們的 M2表型。在這里,我們想知道 PGE2 是否也參與了 AP 損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的 M2 極化。為此,我們首先檢查了 AP 損傷后 PGE2 的動(dòng)態(tài)表達(dá)。COX1 和 COX2 是產(chǎn)生前列腺素的兩種關(guān)鍵酶。在這里我們發(fā)現(xiàn)Ptgs2 (COX2)的表達(dá)在第 3 天達(dá)到峰值,而Ptgs1 (COX1)的表達(dá)在第 1 天下降并在第 3 天回到基礎(chǔ)水平。一致地,免疫熒光分析顯示 PGE2 在第 3 天升高,并在第 5 天迅速恢復(fù)到基礎(chǔ)水平。值得注意的是,PGE2在第 3 天主要與導(dǎo)管樣細(xì)胞(CK19 +細(xì)胞)共表達(dá),以及部分與巨噬細(xì)胞(F4/80 +細(xì)胞)共表達(dá)。此外,根據(jù)我們的 RNA-seq 數(shù)據(jù)和流式細(xì)胞術(shù)分析,我們發(fā)現(xiàn)巨噬細(xì)胞中 COX2 的表達(dá)也在第 3 天達(dá)到峰值。更有趣的是,與 IL4Rα -巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞相比,IL4Rα +巨噬細(xì)胞表達(dá)了更高水平的 COX2。 促進(jìn)了對定義腎臟細(xì)胞特性的基因和途徑的更深入的理解。浙江焦亡活化標(biāo)書
在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經(jīng)的保護(hù)作用被**取消
為了進(jìn)一步探索神經(jīng)元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導(dǎo)的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標(biāo)志物。發(fā)現(xiàn)***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平?jīng)]有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達(dá)水平?jīng)]有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達(dá)水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(zhì)(xCT,Cox2、4HNE)的表達(dá)。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細(xì)胞的數(shù)目。這些結(jié)果表明褪黑素沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上減少TBI引起的鐵死亡和神經(jīng)元變性。 重慶RNA甲基化標(biāo)書在786-O細(xì)胞中穩(wěn)定轉(zhuǎn)染靶向circSDHC的shRNA.
FIR 逆轉(zhuǎn) circACTN4 在 BC 細(xì)胞中的**促進(jìn)作用
為了進(jìn)一步研究 circACTN4 是否通過 circACTN4/FUBP1/MYC 軸發(fā)揮其生物學(xué)作用,在 OE-FIR 或 sh-FIR 與circACTN4或si-circ#2 共轉(zhuǎn)染后,在 BC 細(xì)胞中進(jìn)行了一系列拯救實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,F(xiàn)IR 過表達(dá)可以顯著逆轉(zhuǎn) circACTN4 上調(diào)在 BC 細(xì)胞增殖、遷移和侵襲中的促進(jìn)作用,而 FIR 敲低通過傷口愈合、EdU 和 transwell 測定減弱了 BC 細(xì)胞中 circACTN4 下調(diào)介導(dǎo)的抑制作用。此外,IF 分析還表明 FIR 過表達(dá)和敲低可以明顯逆轉(zhuǎn) circACTN4 上調(diào)和下調(diào)對 MYC 表達(dá)的影響。IF發(fā)現(xiàn)與*旁組織相比,在BC 組織中 MYC 高表達(dá)。WB分析表明,F(xiàn)IR的上調(diào)和下調(diào)可以通過過表達(dá)和沉默circACTN4來抵消對MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2表達(dá)的增強(qiáng)和抑制作用。綜上所述,上述結(jié)果進(jìn)一步證明circACTN4可能與FUBP1競爭性結(jié)合,阻斷FIR對MYC的轉(zhuǎn)錄抑制作用,從而促進(jìn)BC的**發(fā)生和進(jìn)展。
白血病發(fā)生需要增強(qiáng)由致*基因引起的自我更新。其潛在的分子機(jī)制尚不完全清楚。本文確定C/D box snoRNAs和rRNA甲基化是白血病干細(xì)胞活性的關(guān)鍵決定因素。Aes基因在有融合基因AML1-ETO, PML-RARα和PLZF-RARα的白血病中高表達(dá),但是其功能和機(jī)制一直是未知的。研究者通過老鼠模型和細(xì)胞系實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)Aes對**細(xì)胞的自我更新能力是至關(guān)重要的。研究者通過RNA-seq對比Aes(*基因)缺失前后轉(zhuǎn)錄組的變化,意外發(fā)現(xiàn)大量的snoRNA下調(diào),而在過表達(dá)Aes后snoRNA表達(dá)量***上升,這說明Aes能影響snoRNA的表達(dá)。有趣的是,研究者利用CRISPR技術(shù)敲除snoRNA后,發(fā)現(xiàn)即使是敲除單個(gè)snoRNA,rRNA的甲基化***降低,并且抑制白血病細(xì)胞的克隆形成能力。這說明,snoRNA不僅是一類受*細(xì)胞調(diào)控的非編碼RNA,更參與了**的發(fā)***展。AES通過與RNA解旋酶DDX21相互作用誘導(dǎo)snoRNA/RNP形成。CircRNA在NSCLC發(fā)生、發(fā)展中誘導(dǎo)免疫反應(yīng)的行為和機(jī)制尚未見報(bào)道.
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)
為了進(jìn)一步探究miR-208b的分子機(jī)制,探究了其下游靶基因機(jī)制,使用生信預(yù)測了其靶基因,**終挑選到PDCD4(圖5A)。熒光素酶進(jìn)一步證實(shí)了miR-208b和PDCD4之間的結(jié)合(圖5C-D)。研究發(fā)現(xiàn),T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)在SW480外泌體處理組***下降,而這個(gè)抑制作用在SW480-OXA組更加明顯,PCD表達(dá)在miR-208b缺失組則***升高(圖5E)。此外,加入miR-208bmimics后,PDCD4蛋白***降低,而抑制miR-208b后,PDCD4蛋白的表達(dá)相對增強(qiáng),此外,PDCD4在mRNA水平的表達(dá)沒有明顯變化(圖5F)。然后,評估了miR-208b對CD4+T細(xì)胞擴(kuò)增的影響。研究表明,轉(zhuǎn)染miR-208bmimics***增強(qiáng)了Treg的擴(kuò)增,而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴(kuò)增(圖5G-H)。這些結(jié)果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達(dá),導(dǎo)致Treg分化。
5、確認(rèn)PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用
隨后探究了PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用。如圖A-C所示,成功構(gòu)建了PDCD4的過表達(dá)和干擾表達(dá)細(xì)胞系。與對照組相比,PDCD4過表達(dá)***降低了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率,而干擾其表達(dá)則***提高了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率。表明PDCD4是負(fù)調(diào)節(jié)Treg細(xì)胞擴(kuò)增的關(guān)鍵基因。 FMT可能通過***NF -κB信號(hào)通路來緩解腸道炎癥。肝損傷標(biāo)書北京
circNDUFB2作為一個(gè)支架增強(qiáng)IGF2BP蛋白與TRIM25的結(jié)合。浙江焦亡活化標(biāo)書
RNA甲基化修飾(m6A)研究
RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上**為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]?!熬幋a器(Writer)”即甲基轉(zhuǎn)移酶,目前已知這個(gè)復(fù)合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識(shí)別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。 浙江焦亡活化標(biāo)書
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)