piRNA-30473在DLBCL中升高，是DLBCL患者的不良預(yù)后因素
作者首先研究小RNA的表達(dá)水平與DLBCL患者的臨床相關(guān)性。通過分析微陣列數(shù)據(jù)，與預(yù)后不良組(PP)比較，在預(yù)后良好(FPP)的病例中發(fā)現(xiàn)了4個***下調(diào)或上調(diào)的piRNAs(圖1A)。在這四個差異表達(dá)RNA的基礎(chǔ)上，作者進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)與預(yù)后良好(FPP)的患者相比，預(yù)后不良患者(PP)的piRNA-30473表達(dá)水平***升高(圖1B)，且DLBCL患者高水平的piRNA-30473與較差的總生存率相關(guān)(圖1C)。綜上所述，piRNA-30473可作為預(yù)后的生物標(biāo)志物，并可用于DLBCL患者的預(yù)后分層。 文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細(xì)胞（與結(jié)腸炎癥密切相關(guān)）。丁酸科研服務(wù)兩年
在**微環(huán)境（TME）細(xì)胞浸潤的單樣本基因集富集分析（ssGSEA）中，亞型2和亞型3的β系數(shù)（95%順式），亞型1作為對照組。FDR校正后，28種免疫類型中有27種在m6A亞型之間存在***差異，但記憶CD8 T細(xì)胞類型除外。亞型3的TME入滲程度比較低，亞型1的TME入滲程度比較高。因此，我們將亞型1定義為免疫亞型，亞型2定義為中間亞型，亞型3定義為**增殖亞型。
PCA生成的m6A信號在不同的m6A亞型中***不同。在校正年齡、性別、分期、**類型和可能的表達(dá)殘差（PEER）因素估計(jì)后，m6A信號水平越高，總體人群的總體生存率越差。此外，臨床晚期疾?。≒trend）患者的m6A特征明顯更高或****級。在不同的**類型中，較高的m6A信號與較短的MST***相關(guān)。我們檢查了在整個泛*人群中m6A信號與**突變負(fù)荷（TMB）評分之間的關(guān)聯(lián)。不出所料，它們與皮爾遜r=?總?cè)丝跒?.53。m6A信號正相關(guān)，16種**類型的TMB評分。 細(xì)胞表面標(biāo)志物科研實(shí)驗(yàn)可參觀大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正?；湍c道尿酸水平的降低。
總之，SLE患者純化T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析根據(jù)ISG表達(dá)水平將其分為兩組，表達(dá)高I型IFN標(biāo)記的患者顯示線粒體編碼基因和線粒體相關(guān)代謝途徑的表達(dá)減少，在CD8+T細(xì)胞中更明顯。這表明SLE中與I型IFN相關(guān)的線粒體功能失調(diào)。
2、ISGs高表達(dá)患者CD8+T細(xì)胞線粒體異常
在研究I型IFN信號與線粒體異常之間的潛在聯(lián)系之前，應(yīng)用計(jì)算機(jī)模擬和體外相結(jié)合的方法，根據(jù)I型IFN信號的強(qiáng)弱程度對SLE患者進(jìn)行分層：高水平的ISGs(IFN-high)、低水平的ISGs(IFN-low)和無ISGs(IFN-Neg)。隨后，探究IFN-high和IFN-Neg的SLE患者中T細(xì)胞的線粒體基因型，以類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎（RA）患者為疾病對照。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與健康組，IFN-Neg組和RA組相比，來源于IFN-high的SLE患者的CD8+T細(xì)胞表現(xiàn)出線粒體大小增加（圖2a,b）和線粒體膜超極化（圖2c）。在IFN-High的SLE患者中，也觀察到細(xì)胞ROS(cROS)陽性CD8+T細(xì)胞比例增加，但只是線粒體ROS(mROS)染色細(xì)胞比例有上升趨勢（圖2d）。在IFN-Neg的SLE患者中也檢測到更高比例cROS陽性細(xì)胞，這表明了一種疾病特異性效應(yīng)（圖2d）。
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)
為了進(jìn)一步探究miR-208b的分子機(jī)制，探究了其下游靶基因機(jī)制，使用生信預(yù)測了其靶基因，**終挑選到PDCD4（圖5A）。熒光素酶進(jìn)一步證實(shí)了miR-208b和PDCD4之間的結(jié)合（圖5C-D）。研究發(fā)現(xiàn)，T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)在SW480外泌體處理組***下降，而這個抑制作用在SW480-OXA組更加明顯，PCD表達(dá)在miR-208b缺失組則***升高（圖5E）。此外，加入miR-208bmimics后，PDCD4蛋白***降低，而抑制miR-208b后，PDCD4蛋白的表達(dá)相對增強(qiáng),此外，PDCD4在mRNA水平的表達(dá)沒有明顯變化（圖5F）。然后，評估了miR-208b對CD4+T細(xì)胞擴(kuò)增的影響。研究表明，轉(zhuǎn)染miR-208bmimics***增強(qiáng)了Treg的擴(kuò)增，而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴(kuò)增（圖5G-H）。這些結(jié)果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達(dá)，導(dǎo)致Treg分化。 大黃酸可以改變腸道菌群組成。
這與之前的研究結(jié)果一致，即YTHDF1主要調(diào)控基因翻譯。MeRIP-seq鑒定YTHDF1調(diào)控的m6A修飾的轉(zhuǎn)錄本。2365個轉(zhuǎn)錄本檢測到m6A修飾，主要發(fā)生在mrna中(98%;圖3 e;補(bǔ)充表S7)，優(yōu)先聚集在外顯子(58%;圖3 e)。與其他n6 -甲基腺苷測序結(jié)果一致，m6A峰在30UTR區(qū)域富集(圖3F)，并*被典型GGAC基元檢測(圖3G)。將RIP-seq和MeRIP-seq整合的重疊轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行富集分析，發(fā)現(xiàn)Wnt和Hippo信號通路受到了***影響(圖3H）。假設(shè)YTHDF1抑制通過Hippo或Wnt途徑抑制**生長(圖3I)。為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機(jī)制。深圳神經(jīng)肌肉科研
評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子（METTL3、METTL14和WTAP）的表達(dá)。丁酸科研服務(wù)兩年
2.PC細(xì)胞衍生的外泌體中l(wèi)inc-ROR表達(dá)的增加可以轉(zhuǎn)移到脂肪細(xì)胞中，在共培養(yǎng)系統(tǒng)中誘導(dǎo)去分化作者接下來使用體外間接共培養(yǎng)模型研究了外泌體linc-ROR在誘導(dǎo)脂肪細(xì)胞去分化中的作用。為了探究外泌體linc-ROR在脂肪細(xì)胞脫分化中的作用機(jī)制，作者繼續(xù)誘導(dǎo)3T3-L1脂肪細(xì)胞5天，使其成為具有獨(dú)特脂滴的成熟脂肪細(xì)胞。脂滴經(jīng)紅油染色呈規(guī)則的圓形。當(dāng)從PC細(xì)胞中分離出來的外泌體(綠色熒光染料，pkh67標(biāo)記)與脂肪細(xì)胞共培養(yǎng)時，激光掃描共聚焦顯微鏡(LSCM)顯示，受體細(xì)胞(藍(lán)色熒光染料，DAPI標(biāo)記)隨著時間的增加表達(dá)更高的攝取潛能。這證實(shí)了吸收能力是依賴于時間的。丁酸科研服務(wù)兩年
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