廣州神經(jīng)炎癥科研

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-13

使用SmartSeq2協(xié)議對(duì)15個(gè)胎兒的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq處理(圖1 a)。

基于差異表達(dá)(DE)分析和按標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排序的前20個(gè)標(biāo)記基因。紅細(xì)胞(表達(dá)HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達(dá)FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細(xì)胞祖細(xì)胞和單核細(xì)胞(表達(dá)CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細(xì)胞、肥大細(xì)胞(表達(dá)CD63、GATA2和HDC)、漿細(xì)胞樣樹(shù)突狀細(xì)胞(pDCs;表達(dá)IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環(huán)pDCs(表達(dá)pDC和增殖標(biāo)記物;例如,MKI67)和粒細(xì)胞1、2和3(表達(dá)AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細(xì)胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細(xì)胞和祖細(xì)胞群體中存在***的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性,一些表型祖細(xì)胞群體(如造血干細(xì)胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過(guò)10個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個(gè)不同群體(圖1 d). 代謝變化被認(rèn)為是腸病**重要的特征之一。廣州神經(jīng)炎癥科研

三、在體內(nèi),tbi介導(dǎo)的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制

為了確定TBI是否會(huì)損害體內(nèi)的核質(zhì)運(yùn)輸,我們?cè)诠夁\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中過(guò)表達(dá)了一個(gè)帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標(biāo)記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達(dá)nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號(hào)分布在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達(dá)的vnc暴露于TBI中,核GFP信號(hào)減少的細(xì)胞百分比***增加,而核GFP強(qiáng)度***降低(圖3B和C),說(shuō)明GFP核進(jìn)口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來(lái),我們?cè)谶\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中表達(dá)了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標(biāo)記的沒(méi)有核輸出活性的GFP蛋白。表達(dá)NLS的非創(chuàng)傷性腦損傷動(dòng)物的腦細(xì)胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細(xì)胞核的強(qiáng)大定位(圖3A),而創(chuàng)傷性腦損傷動(dòng)物的vnc顯示了核GFP減少的細(xì)胞數(shù)量***增加,核GFP強(qiáng)度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲(chóng)暴露于TBI,并在DMSO單獨(dú)、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養(yǎng)。對(duì)經(jīng)歷過(guò)TBI的果蠅幼蟲(chóng)的羽化試驗(yàn)顯示,KPT-350處理的動(dòng)物(圖3D)或KPT-276處理的動(dòng)物(圖3E)具有***的劑量依賴(lài)性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號(hào)***高于dmso處理的對(duì)照組(圖3G)。 壞死科研服務(wù)兩年英拜注重客戶(hù)的隱私。

PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩(wěn)定性有關(guān)。此外,小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(mef)中PTEN基因的缺失導(dǎo)致了未修復(fù)的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認(rèn)為通過(guò)至少兩種分子機(jī)制促進(jìn)了基因組的完整性。在細(xì)胞核中,PTEN與著絲粒結(jié)合蛋白CENP-C結(jié)合,促進(jìn)著絲粒組裝和中期到后期的轉(zhuǎn)變。此外,作為轉(zhuǎn)錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調(diào)節(jié)Rad51的表達(dá),Rad51是DNA修復(fù)機(jī)制的關(guān)鍵組成部分。然而,后續(xù)的研究得出了不一致的結(jié)果,表明PTEN在轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)RAD51的調(diào)控可能***于特定的細(xì)胞環(huán)境。

PTEN缺陷改變了多個(gè)細(xì)胞周期檢查點(diǎn),可能留下更少的時(shí)間進(jìn)行DNA損傷修復(fù)和/或染色體分離。細(xì)胞周期的進(jìn)展需要幾個(gè)分子過(guò)程的完美執(zhí)行,以確保一個(gè)熟練的,無(wú)錯(cuò)誤的,細(xì)胞分裂。這些事件發(fā)生的速度由周期蛋白依賴(lài)激酶(CDKs)的活性決定,CDKs磷酸化關(guān)鍵底物以促進(jìn)DNA合成和有絲分裂進(jìn)程。CDKs的催化活性受細(xì)胞周期檢查點(diǎn)的調(diào)控,這些檢查點(diǎn)監(jiān)測(cè)細(xì)胞周期中主要事件的有序執(zhí)行。檢查點(diǎn)**了故障安全機(jī)制,它確保只有在滿(mǎn)足的比較好情況下才允許細(xì)胞分裂。

三、沿著推斷分化軌跡的Motif可及性動(dòng)態(tài)

由于技術(shù)限制,scRNA-seq難以檢測(cè)低豐度轉(zhuǎn)錄本(如轉(zhuǎn)錄因子TFs),而通過(guò)染色質(zhì)的可及性可推斷出這些TFs的活性,因此整合scRNA-seq和scATAC-seq方法具有重要意義。研究者利用scATAC-seq檢測(cè)了人類(lèi)胚胎Lin- CD34+ CD38-細(xì)胞的單細(xì)胞染色質(zhì)可及性,分別對(duì)18、20和21PCW胚胎的肝臟和股骨中的4,001個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了測(cè)序,基于SNN算法,共得到7個(gè)不同的可明顯分離的集群 (Figure 3A)。scRNA-seq數(shù)據(jù)中檢測(cè)了所選標(biāo)記基因的可及性,與干細(xì)胞相關(guān)的標(biāo)記基因(如MLLT3、PROM1、FLI1和GATA2)的可及性較高,而與不同譜系相關(guān)的基因(如MPO、ALAS2、MPEG1和CD19)的可及性較低,這與分選細(xì)胞的未分化特性一致(圖3B)。 上海英拜生物的動(dòng)物建模實(shí)驗(yàn)。

褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細(xì)胞中機(jī)械性損傷引起的鐵死亡

為了進(jìn)一步證實(shí)褪黑素對(duì)Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用,將HT-22細(xì)胞系用siRNA轉(zhuǎn)染,然后在體外進(jìn)行機(jī)械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質(zhì)水平。鑒于脂質(zhì)過(guò)氧化是鐵死亡的標(biāo)志,使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評(píng)估了溶質(zhì)ROS。與對(duì)照組+刮擦損傷組相比,siFth +刮擦損傷組細(xì)胞的熒光強(qiáng)度顯著增加,表明siFth增強(qiáng)了HT-22細(xì)胞中機(jī)械刮擦損傷引起的ROS產(chǎn)生的上調(diào)。重要的是,與未經(jīng)***的siFth組相比,用褪黑素處理siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細(xì)胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調(diào)。



m6A表達(dá)水平較高的**患者淋巴轉(zhuǎn)移***增加。肺纖維化小鼠模型科研服務(wù)兩年

英拜生物您隨身的科研小助手。廣州神經(jīng)炎癥科研

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1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專(zhuān)題,外泌體研究專(zhuān)題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng):提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě),標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)