為了確定s-flow和d-flow在體內(nèi)單細胞分辨率下對ECs基因轉(zhuǎn)錄表達和染色質(zhì)可及性譜的全基因組影響，我們使用小鼠PCL模型進行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結(jié)扎，以暴露于血流的對側(cè)RCA作為對照，在LCA中誘導d-血流。部分結(jié)扎后2天(2D)和2周(2W)， rca (2D- r和2W- r)和lca (2D- l和2W- l)用膠原酶酶解獲得單個細胞和單個核，分別用于scRNA-seq和scATAC-seq。
在標準化之后，一個基于無監(jiān)督圖的聚類將細胞劃分成組，通過統(tǒng)前列形近似和投影(UMAP)圖可視化(圖1A)。我們的UMAP分析確定了16個獨特的細胞簇以流和時間依賴的方式分布(圖1A和1B)。每個細胞簇都是用確定的標記基因進行鑒定(1C).發(fā)現(xiàn)8個EC簇(E1E8)、血管平滑肌細胞(SMCs)、成纖維細胞(Fibro)、4個單核/巨噬細胞(macrophages14)、樹突狀細胞(DCs)和T細胞。通過Pecam1、Icam2、Cdh5和Tie1的表達來鑒定EC簇。smc特異性標記為Cnn1、Myl9和Speg。同樣，Medag、Dpep1和Lum作為纖維的標記物;巨噬細胞C1qa,C1qb,C1qc,C5ar1;DCs的Ccr7和Mmp25;T細胞的Itk(圖1C)。
大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。腸道微生物組科研地區(qū)科學基金
一、上傳數(shù)據(jù)
可以上傳原始的fast文件，也可以上傳時序count表達文件。按照數(shù)據(jù)情況填寫以下6個問題，然后點擊“Run”開始進行質(zhì)控
二、初級分析
數(shù)據(jù)質(zhì)控合格后，進行初級分析，包括：差異表達量計算、基因簇分析。差異計算方法包括ImpulseDE2、NextmaSigPro、DESeq2，可以根據(jù)實際情況自由選擇。
三、次級分析
次級分析用于評估豐富度、因子結(jié)合和時間關(guān)系。我們可以選擇不同類型的分析來分析初級分析中獲得的基因簇，即Enrichment，用于識別基因簇中高表達的基因；FactorBinding，使用motif和CHIP-seq預(yù)測影響基因簇表達的轉(zhuǎn)錄因子；TemporalRelations，識別轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)（GRN）。
腦白質(zhì)損傷WMI科研英拜提供一年三節(jié)的購物卡津貼。
IGF2BPs是circNDUFB2的下游功能性蛋白
IGF2BPs是致*蛋白，circNDUFB2可降低IGF2BPs的穩(wěn)定性，推測IGF2BPs介導circNDUFB2對NSCLC進展的影響。IGF2BPs過表達***增加了A549細胞的遷移和侵襲能力以及集落形成能力。IGF2BPs敲除***降低H1650細胞的遷移和侵襲能力以及集落形成能力。這些結(jié)果證實IGF2BPs是NSCLC的促瘤因子。隨后，觀察到IGF2BPs過度表達*部分恢復了circNDUFB2過度表達減少的遷移和侵襲能力以及集落形成能力，表明circNDUFB2部分通過降解IGF2BPs發(fā)揮**抑制作用。盡管circNDUFB2 MUT不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平但它仍然對NSCLC細胞的進展具有抑制作用。這些數(shù)據(jù)表明circNDUFB2 MUT的抑制作用除了降解IGF2BPs外，還可能與circNDUFB2的其他機制有關(guān)。
2.Tempol能中度改善DHEA誘導的PCOS大鼠的糖耐量
由于多囊卵巢綜合征與代謝紊亂密切相關(guān)，評估了不同組的胰島素敏感性和葡萄糖穩(wěn)態(tài)。DHEA+PBS組大鼠的空腹血糖水平雖然沒有明顯差異，但其空腹血清胰島素水平和HOMA-IR值均高于油+PBS組。Tempol***降低了空腹胰島素水平，而對PCOS大鼠的空腹血糖水平和HOMA-IR值無***影響(圖2A-C)。OGTTs顯示PCOS大鼠葡萄糖***延遲和曲線下面積增加，這表明DHEA處理降低了葡萄糖排泄能力。經(jīng)tempol***后，糖耐量受損情況得到改善(圖2D)。ITTs證明，三組大鼠對胰島素的反應(yīng)相同(圖2E)。 鑒定的前列腺瘤細胞內(nèi)源性雄***受體網(wǎng)絡(luò)。
褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡
為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用，將HT-22細胞系用siRNA轉(zhuǎn)染，然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質(zhì)水平。鑒于脂質(zhì)過氧化是鐵死亡的標志，使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評估了溶質(zhì)ROS。與對照組+刮擦損傷組相比，siFth +刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加，表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產(chǎn)生的上調(diào)。重要的是，與未經(jīng)***的siFth組相比，用褪黑素處理siFth轉(zhuǎn)染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調(diào)。
上海英拜生物提供可視化實驗過程參觀。廣州WB科研
英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。腸道微生物組科研地區(qū)科學基金
2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因，降低細胞脂質(zhì)水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標，因此白樺素將其表達下調(diào)40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子這一觀點一致，膽固醇合成途徑中的10個被測基因，例如HMGCR，HMG-CoA合酶（HMGCS）和角鯊烯環(huán)氧酶（SE），都被白樺素處理抑制了（圖3A）。類似地，與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關(guān)的所有9個基因，例如SREBP-1c，脂肪酸合酶（FAS）和乙酰輔酶A羧化酶α（ACC），都被白樺素顯著下調(diào)（圖3B）。與早期觀察結(jié)果一致（圖1A），包括ABCG5和ABCG8在內(nèi)的LXR靶基因不受白樺素的影響（圖3C）。 腸道微生物組科研地區(qū)科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請：提供標書課題設(shè)計、撰寫，標書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗