胰管腺*(PDAC)有明顯的肝轉移傾向。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環(huán)境形成和轉移的關鍵。2021年4月發(fā)表于Gut(IF=19.819)的文章“Exosome-delivered CD44v6/C1QBP complex drives pancreatic cancer liver metastasis by promoting fibrotic liver microenvironment”對此進行了探究。本研究旨在探討PDAC來源的外泌體(Pex)調控肝臟微環(huán)境、促進轉移的潛在機制。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物對于肝纖維化微環(huán)境和PDAC肝轉移的形成是必不可少的。高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物。我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達譜。單細胞相關課題課題推薦咨詢
乳腺*(BrCa)是世界范圍內**常見的**,診斷為IV期患者的5年相對生存率有所下降。晚期BrCa被認為是不可***的,目前仍缺乏有效的***策略。識別和表征新的**抑制基因對于建立有效的晚期BrCa預后生物標志物或***靶點非常重要。2021年3月發(fā)表于Theranostics(IF=11.556)的文獻“Tumor suppressor DRD2 facilitates M1 macrophages and restricts NF-κB signaling to trigger pyroptosis in breast cancer”對此展開了研究。在本文中,在BrCa中,DRD2被發(fā)現(xiàn)由于啟動子甲基化而下調。DRD2的高表達與更長的生存時間正相關,尤其是在HER2陽性患者中。DRD2還能促進BrCa細胞對紫杉醇的敏感性。DRD2異位表達***抑制BrCa**發(fā)生。在體內和體外,DRD2也能誘導細胞凋亡和壞死。DRD2通過與β-arrestin2、DDX5和eEF1A2相互作用抑制NF-κB信號通路的***。有趣的是,DRD2還調節(jié)微環(huán)境,促進巨噬細胞M1極化,并觸發(fā)GSDME執(zhí)行的焦亡。空間轉錄組學課題服務兩年zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。
人PTC組織中tRFs和tiRNAs的表達
為了鑒定人PTC組織中的tRFs和tiRNAs,收集3對PTC*組織和*旁組間,用于高通量測序,其結果比對至tRNAlibraryGtRNAdb文庫,并從中去除線粒體tRNA。**終累計獲得1723個tRN**段,其中594個片段只存在于**組織,136個只存在于*旁組織(圖1A-B)。成分分析顯示,**中tiRNAs的數(shù)量遠超*旁組織,而tRFs則主要存在于*旁(圖1C)?;鹕綀D可以看出5個在**組織中***上調的tRN**段:5’-tiRNA-Gly-GCC,5’-tiRNA-Lys-CTT,5’-tiRNA-Glu-CTC,5’-tRF-Val-CAC,pre-tRNA-Ser-TGA(Fig.1D)。圖1E顯示tRN**段1260,1293,1297和1385明顯來源于**組織。tRN**段1293和1297都是5’-tiRNA-Gly-GCC剪切自tiRNA-Gly-GCC的不同部分的。tRN**段1260切割自tRNA-Glu-CTC,tRN**段1358切割自tRNA-Lys-CTT。
關聯(lián)研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結直腸*(CRC)聯(lián)系起來。miRNA譜可能在CRC進展過程中多樣化,并在血液中反映CRC進展水平。但是,尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結直腸腺瘤、結直腸憩室炎和CRC患者(UICCstagesI/II,III,andIV)的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進行了基于微陣列的比較。接下來通過RT-PCR進行確認,并對另外36份血液樣本中miRNA進行驗證。與健康對照相比,有179個CRC相關miRNA的豐度差異。只有三個(miR-1225-5p、miR-1207-5p和miR-4459)在所有CRC階段表現(xiàn)出增加的水平。對3個miRNA進行通路分析,發(fā)現(xiàn)了miRNAs以各種方式對幾種**相關通路起作用。這項研究為改進CRC篩查的生物標志物發(fā)現(xiàn)提供了線索,是***項提供CRC血液表達譜的研究,******評估了不同CRC不同階段血液中miRNA的變化。這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。提供分子生物以及到后續(xù)動物建模的一整套服務。
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中,核GFP信號減少的細胞百分比***增加,而核GFP強度***降低(圖3B和C),說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來,我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創(chuàng)傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A),而創(chuàng)傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數(shù)量***增加,核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI,并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養(yǎng)。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示,KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G)。 英拜提供生物醫(yī)學課題外包服務。炎癥因子課題省自然科學基金
Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。單細胞相關課題課題推薦咨詢
三、INPP4B促進晚期核內體上PI(3,4)P2到PI(3)P的轉化
使用了幾種基于無偏性蛋白質組學的技術來表征INPP4B在pik3a突變ER+乳腺*中的下游信號功能。首先,利用液相色譜-串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)進行全細胞蛋白質組學研究,確定GFP-INPP4B與gfp載體表達MCF-7細胞中蛋白水平的差異(2倍)。功能注釋分析顯示,inpp4b過表達細胞中上調的蛋白與內溶酶體系統(tǒng)密切相關,內溶酶體系統(tǒng)是介導細胞外受體和貨物內化和降解的囊泡運輸途徑(圖3a)。免疫沉淀質譜(IP-MS)對受EGF刺激的MCF-7細胞進行GFP-INPP4B蛋白復合物的分析,以***I類PI3K信號。從該分析中鑒定出的**富集的結合伙伴是RAB7A (Rab7),這是一種定位于晚期核內體的小GTPase(圖3b)。GFP-INPP4B與內源性Rab7的共免疫共沉淀證實了INPP4B與Rab7的結合(圖3c)。通過免疫電鏡進一步分析INPP4B定位于晚期核內體,結果顯示GFPINPP4B定位于晚期核內體的限制膜和內膜(圖3d),之前的研究已經確定了PI(3,4)P2和PI(3)P。 單細胞相關課題課題推薦咨詢
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1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗