在Fth- KO小鼠中， TBI后褪黑素對(duì)神經(jīng)的保護(hù)作用被**取消
為了進(jìn)一步探索神經(jīng)元Fth的喪失是否影響褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的鐵死亡的影響，測量了鐵死亡的幾種假定的生物標(biāo)志物。發(fā)現(xiàn)***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平?jīng)]有影響。令人驚訝的是，盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達(dá)水平?jīng)]有顯著差異，但是在褪黑素***的小鼠中，觀察到Fpn mRNA和蛋白表達(dá)水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是，與未***的Fth- KO小鼠相比，用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA（Slc7a11，Ptgs2）和蛋白質(zhì)（xCT，Cox2、4HNE）的表達(dá)。另外，用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上降低GSH和MDA以及4HNE的水平，和FJB陽性細(xì)胞的數(shù)目。這些結(jié)果表明褪黑素沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上減少TBI引起的鐵死亡和神經(jīng)元變性。 英拜生物提供專業(yè)的編輯潤色團(tuán)隊(duì)保證服務(wù)到文章接收為止。細(xì)胞周期科研整體服務(wù)
1.下載GEO數(shù)據(jù)并進(jìn)行預(yù)處理
下載數(shù)據(jù)集GSE28829，GSE41571和GSE43292，使用Perl腳本和R軟件的sva軟件包進(jìn)行原始數(shù)據(jù)的合并和預(yù)處理。然后，使用Perl腳本將每個(gè)基因的探針I(yè)D轉(zhuǎn)換為基因名。
2.CIBERSORT分析免疫浸潤
CIBERSORT的LM22基因文件用于定義22個(gè)免疫細(xì)胞亞群，這些數(shù)據(jù)可從CIBERSORT網(wǎng)站進(jìn)行下載。使用CIBERSORT對(duì)表達(dá)文件的P值和均方根誤差進(jìn)行計(jì)數(shù)，獲得免疫細(xì)胞收據(jù)，使用R包，corplot，vioplot和ggplot2進(jìn)行結(jié)果的可視化。
野生型科研國家自然科學(xué)基金METTL14是其***的潛在靶點(diǎn)。
2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因，降低細(xì)胞脂質(zhì)水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標(biāo)，因此白樺素將其表達(dá)下調(diào)40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子這一觀點(diǎn)一致，膽固醇合成途徑中的10個(gè)被測基因，例如HMGCR，HMG-CoA合酶（HMGCS）和角鯊烯環(huán)氧酶（SE），都被白樺素處理抑制了（圖3A）。類似地，與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關(guān)的所有9個(gè)基因，例如SREBP-1c，脂肪酸合酶（FAS）和乙酰輔酶A羧化酶α（ACC），都被白樺素顯著下調(diào)（圖3B）。與早期觀察結(jié)果一致（圖1A），包括ABCG5和ABCG8在內(nèi)的LXR靶基因不受白樺素的影響（圖3C）。
4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取
Xc-系統(tǒng)是一個(gè)胱氨酸/谷氨酸逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白，捕獲細(xì)胞外的胱氨酸，用于谷胱甘肽的合成，以交換谷氨酸的釋放。在圖3中，被抑制的Xc-系統(tǒng)功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關(guān)，然而YTHDC2如何調(diào)節(jié)Xc-系統(tǒng)依然未知。文獻(xiàn)報(bào)道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統(tǒng)活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發(fā)現(xiàn)，SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負(fù)調(diào)控(圖4A、B)。在小鼠中，與KPE和KPYΔYTH小鼠相比，KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達(dá)下調(diào)(圖4C、D)。這證明YTH結(jié)構(gòu)域是YTHDC2抑制SLC7A11表達(dá)的前提。 增加乳酸桿菌水平導(dǎo)致尿酸水平下降。
由于HoxBlinc通過招募SETD1A和MLL1復(fù)合物，并在HoxB前位點(diǎn)組織活躍的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域，促進(jìn)HoxB前基因的表達(dá)，NPM1c+或HoxBlincTg引起的HoxBlinc上調(diào)可以通過增強(qiáng)子/啟動(dòng)子染色質(zhì)可及性來***其在HSPC中的靶基因。為了驗(yàn)證這一點(diǎn)，使用WT、NPM1c/+和HoxBlincTg小鼠的LSK細(xì)胞進(jìn)行了轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)分析高通量測序 (ATAC-seq)。巧合的是，NPM1c/+和HoxBlincTg LSK細(xì)胞有相當(dāng)一部分基因表現(xiàn)出啟動(dòng)子可及性的增加(28.9%)或減少(24.3%)（圖4e）。此外，NPM1c+或HoxBlincTg使啟動(dòng)子可及性增加的基因中有相當(dāng)一部分也上調(diào)，這些基因包括NPM1c特征基因HoxB2-5、HoxA9-10、Meis1和Runx1，以及其他靶基因如Stat1和Cdr2（圖4f-g）。這些結(jié)果表明HoxBlinc lncRNA的過表達(dá)通過增強(qiáng)HSPC中增強(qiáng)子/啟動(dòng)子染色質(zhì)的可及性特異性***NPM1c+標(biāo)記基因。英拜提供一年三節(jié)的購物卡津貼。運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元科研服務(wù)兩年
大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。細(xì)胞周期科研整體服務(wù)
5、hUC-MSCs調(diào)節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞Sirt1/p53信號(hào)通過miR-199a-5p
文獻(xiàn)報(bào)道在**和自身免疫疾病中，hUC-MSCs能夠?qū)iRNAs轉(zhuǎn)移到周圍的細(xì)胞。因此，作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導(dǎo)的對(duì)脾CD4+T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)調(diào)控。使用在線軟件Targetscan識(shí)別了10個(gè)miRNA，這些miRNA被預(yù)測靶向Sirt1。qPCR分析顯示，在這10個(gè)miRNAs中，只有miR-199a-5p的表達(dá)在MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中***降低(圖5A)。此外，miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達(dá)增加的miRNA(圖5A)。事實(shí)上，miR-199a-5pmimic不僅可以提高M(jìn)RL/lpr脾CD4+T細(xì)胞中miR-199a-5p的水平，降低Sirt1的表達(dá)(圖5B-C)，而且還可以提高衰老標(biāo)志物p21、p16和乙?；痯53的表達(dá)水平(圖5D)。 細(xì)胞周期科研整體服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)