盡管前傳時代的空間技術被迅速棄用，但其思想和方法是當今時代空間轉錄組學發(fā)展的基礎。在過去的 5 年中，隨著眾多新技術的出現和 10x 公司 Visium 技術解決方案的商業(yè)化普及，該領域得到了快速的發(fā)展。一、實驗技術有待改進。我們可以做更多的事情來改善實驗技術。例如 組織切片技術的發(fā)展、 smFISH 和 ISS 技術的實驗技術優(yōu)化、高效率的計算工具實現真正的 3D 空間轉錄組或者空間時序轉錄組等。二，數據庫的建立。盡管當前空間轉錄組的數據在快速地增長，但尚未有對應的數據庫來對這些數據進行匯總集成?？臻g轉錄組是一項前沿技術，涉及到很多細節(jié)方面的準備工作。浙江歐易生物空間轉錄組
**近，空間轉錄組學研究炙手可熱。細胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關系對于理解疾病病理可能至關重要?？臻g轉錄組學是一項開創(chuàng)性的技術，它使科學家能夠測量組織樣本中的所有基因活性，并繪制出發(fā)生該活性的位置的圖。該技術已經導致了新發(fā)現，這些新發(fā)現將有助于幫助科學家更好地了解生物過程和疾病。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于**、免疫、發(fā)育、神經和病理等研究方向。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗，致力通過質量的服務，助力各位科研工作者取得新的突破。浙江歐易生物空間轉錄組空間轉錄組細胞通訊分析方法簡介及實操。
1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數據的技術，從而解析單個組織切片中的所有mRNA?？臻g轉錄組的條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，空間轉錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序，均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息，為研究和診斷提供有效數據支撐。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發(fā)育、神經和病理等研究方向。
10x Genomics空間轉錄組的實現原理是什么？10x Genomics空間轉錄組用于文庫構建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應的barcode序列，然后進行文庫構建并進行測序。根據數據的條形碼信息對數據進行分析，以確定哪些數據來自哪個位置，從而實現空間基因表達的可視化。 作者借助空間轉錄組測序技術探究人類心臟在發(fā)育過程中的基因表達特征和細胞圖譜變化。
轉錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉錄本來獲取，目前已有多種技術策略被開發(fā)報道， 如空間轉錄組技術（Spatial Transcriptomics，ST）和 Visium 技術，通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上，來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉錄本，并獲取全轉錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術也被開發(fā)了出來，其中之一就是是 DNA 顯微技術，它記錄 cDNA 之間的接近度，該信息可用于重建轉錄本之間的相對位置。Science發(fā)表了將組織擴展和原位RNA測序結合起來的新型空間轉錄組技術ExSeq。四川歐易生物空間轉錄組質量
研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦，而其他***（例如肝臟）的空間轉錄組學研究相對滯后。浙江歐易生物空間轉錄組
空間轉錄組的應用有哪些？一、構建空間轉錄組圖譜：借助于空間分辨的單細胞轉錄組學，建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結構的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉錄組技術結合空間轉錄技術，得到多個***的時空轉錄組圖譜（相關研究后續(xù)會在如下專輯更新）。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍圖：胚胎發(fā)育是一個復雜的過程，其中動態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預期使用空間轉錄組學技術可以表征胚胎發(fā)育的空間表達藍圖。浙江歐易生物空間轉錄組
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢，是一家檢驗檢測服務。（依法須經批準的項目，經相關部門批準后方可開展經營活動，具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準）一般項目：生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā)，醫(yī)藥中間體、化工原料及產品（除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品）的研發(fā)、銷售，儀器儀表的銷售，并提供相關技術咨詢、技術服務，會務服務，企業(yè)管理咨詢。的公司。公司自創(chuàng)立以來，投身于科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢，是醫(yī)藥健康的主力軍。歐易生物致力于把技術上的創(chuàng)新展現成對用戶產品上的貼心，為用戶帶來良好體驗。歐易生物始終關注醫(yī)藥健康市場，以敏銳的市場洞察力，實現與客戶的成長共贏。