質譜成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作為一種新型的分子影像技術，能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內源性代謝物和外源***物等分子的結構、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法（如熒光成像、放射性標記成像等），該技術無需化學或放射性標記、不需復雜樣品前處理，具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質譜成像技術可以實現生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析，結合生物信息學分析，發(fā)展為空間代謝組學方法，可從生物組織原位發(fā)現差異代謝物，并識別其生物學功能?？臻g代謝組學,代謝組數據如何分析。山西空間代謝組學公司
在空間上的代謝變化表明，在東莨菪堿***后，大鼠腦微區(qū)的代謝網絡發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網絡的關鍵因素，基于空間分辨的代謝組學信息為發(fā)現酶或基因異常提供了線索，但若要完成完整的代謝網絡分析必須進一步驗證蛋白質和基因表達水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網絡作圖方法，通過無需衍生化、特定標記或復雜樣品預處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學策略，在具有復雜結構化腦組織中發(fā)現代謝分子變化。能檢測出多種極性內源性代謝物，并繪制相關代謝網絡，提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子（例如核苷酸、多胺、肌酸、神經酰胺代謝物）含量分布可視化。山西空間代謝組學公司空間代謝組學:一種高靈敏、高覆蓋質譜成像技術新技術。
通過空間代謝組學測量了四種轉基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-ALL）中甘油磷脂（GPs）的含量，發(fā)現在不同的**中，MYC誘導改變了磷酸酰甘油（PGs）的豐度（圖 4A），能夠增加了大多數PG物質。MYC失活后，PG豐度恢復到基礎水平（圖 4B）。PGs由磷脂酸(PA)通過向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成，因此，PG誘導可以建立在MYC促進的FA增加的基礎上。然而，在體內PGs相對于其他GPs的相對優(yōu)先合成，這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調節(jié)脂肪生成。
空間代謝組學能夠在復雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型，本文作者使用兩個隊列對食管腺*的甘油磷脂特征進行了表征。**初運用空間代謝組學對連續(xù)患者的成對手術切除活檢(EA和MHEE)進行甘油磷脂差異分析；（樣本策略）選擇這種取樣方法的目的是為了進行手術切緣分析，并通過取樣更大的樣本來克服**的區(qū)域代謝組學差異。接下來，采用內窺鏡活檢對第二組人群進行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標本。這樣還使作者能夠驗證***個隊列的發(fā)現，調查該技術在小樣本上的表現，并演示在內鏡套件中促進診斷的第二次臨床應用?？臻g代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態(tài)范圍寬。
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系（BCL）進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達，在MYC誘導的肝細胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細胞*（RCC）的三種體內轉基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現MYC與這些FA合成基因的啟動子結合并啟動mRNA轉錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達，但不降低MYC基因的表達。其次，ChIP的MYC與啟動子結合，不僅調節(jié)FA合成基因的表達，還調節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此，MYC似乎會依次調節(jié)參與脂質合成的基因：首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。蛋白質組學的研究方法。山西空間代謝組學公司
空間代謝組學-靶向代謝組學服務-擅長多組學聯(lián)合分析。山西空間代謝組學公司
本篇小鹿分享一篇空間代謝組學專業(yè)應用技術文章，探究空間代謝組學如何進行前列腺*診斷和預后生物標志物的差異研究？該研究發(fā)現了前列腺*樣本中的特定組織區(qū)室的不同代謝特征，確定了幾種可能被進一步開發(fā)為前列腺*的診斷和預后生物標志物的差異代謝物和脂質?？臻g代謝組學能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息，是臨床上有潛力的創(chuàng)新診斷工具。免標記、無需基質噴涂、周期短、定位準是AFADESI空間代謝組技術的主要特點。該技術作為一種新型的分子影像技術，能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。山西空間代謝組學公司
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