qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實時積累的熒光信號監(jiān)測整個擴增過程,然后通過標準曲線來對未知模板進行定量分析。qPCR 主要是依賴于標準品制備標準曲線,進而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法。隨著PCR的循環(huán)進行,染料熒光強度增加,從而檢測到定量反應的DNA。SYBR Green是一種DNA插入染料,范圍廣用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好。dPCR可用于常規(guī)qPCR所需的標準品定量,具有計量學意義 。珠三角靈敏度qPCR儀報價
而在指數增長期,由于底物充足,聚合酶活性高,反應產物以指數形式積累,且與初始模板量存在定量關系,因此,在該時期對模板起始量進行定量分析準確且重復性比較好。Ct值,是在指數增長期內,熒光信號到達熒光檢測閾值時所經歷的循環(huán)數,其中C循環(huán)(Cycle),t閾值(threshold)。每條擴增曲線的Ct值都與初始模板量的對數存在線性關系,初始模板的拷貝數濃度越高,對應的Ct值越小;反之則越大。因此,先根據已知拷貝數濃度標準品的擴增曲線擬合出標準曲線方程,再將樣本擴增曲線的Ct值代入標準曲線方程中,便可計算未知樣本初始模板的拷貝數濃度,從而實現定量分析。華南地區(qū)酷博qPCR儀價格qPCR 反應所需時間取決于反應溶液進行變溫所需要的時間,這過程受到加熱塊升降溫速度和液體升降溫速度影響。
PCR:Polymerase chain reaction. 是體外模擬生物的DNA 復制。需要DNA 聚合酶,DNA 模板,兩端引物,脫氧核苷酸dNTPs( dATP, ACTP, dGTP, dTTP),以及適當的緩沖體系。PCR 產物的增長形式為2N (如果各種試劑和外部所加條件均理想化,N 是循環(huán)數)。實際中,擴增效率不為100%。Real time PCR 是定量PCR 的一種,當然是在PCR 的基礎上發(fā)展出來的。(普通)PCR 包含很多因素,屬性,如:試劑,溫度,循環(huán)數,程序,PCR 產物(擴增子,amplicon)的量,擴增曲線(擴增子累積曲線),摻錯率,擴增子長度。一般來說,人們關心的是擴增子的量。而real time PCR 主要利用的是擴增曲線(amplification curve), 循環(huán)數;擴增子長度,擴增效率,擴增子多少,也加以考慮。
定量首先需要建立Ct值和拷貝數之間的線性關系,即標準曲線,標曲需要由標準品生成,標準品中基因序列要與待測樣品中基因序列一致,從而保證引物在兩者中擴增效率完全相同,標準品來源可以是質粒,純化的PCR產物或者基因組DNA等。標準品在加樣時需要注意體積比較好大于2微升,以減少標曲誤差,標曲是由不同梯度標準品生成,每個標準品梯度建立Ct值與拷貝數對數值之間的聯(lián)系,落在標曲上的梯度點比較好有5個及以上,至少3個點。標準品和待測樣品同時反應,將待測樣品檢測的Ct值代入標曲后即可換算出待測樣品中基因的拷貝數。。q225 所使用的熱循環(huán)系統(tǒng)峰值變溫速率可達4°C/s。
qPCR的熒光標記方法分為以SYBR Green I染料法為主的熒光染料嵌合法,以Taqman探針法為主的熒光探針法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬滅染料引物法。SYBR Green I 是高靈敏度的非特異性雙鏈DNA熒光染料,具有綠色激發(fā)波長。它以非特異性方式結合在dsDNA雙螺旋小溝區(qū)域。游離的SYBR Green I 只發(fā)出極弱的熒光信號,PCR過程中,當擴增生成dsDNA時,SYBR Green I 逐漸與dsDNA結合,熒光信號被千倍放大,熒光信號的強度與擴增得到的dsDNA的濃度成正比。熒光信號被儀器檢測并采集得到“擴增曲線”,通過熒光信號的強度反映出體系中dsDNA的濃度。QPCR用于基因表達研究、轉基因研究,藥物療效考核、病原體檢測等諸多領域。蘇州單通道qPCR儀作用
qPCR在原有PCR基礎上與熒光檢測方法結合,實現了PCR從定性到定量的飛躍,具有靈敏度高、特異性強的優(yōu)點。珠三角靈敏度qPCR儀報價
所有儀器的操作都基本一致。設置的時候包括反應板設置(plate setup)和程序設置(program setup)。我們以 ABI StepOne為例,詳細看一下反應設置:A. 首先是實驗目的選擇:定量還是其他。我們命名為“BioTeke”,進行“定量”實驗。B. 實驗方法的選擇:我們選用的比較Ct的SYBR Green方法, Fast程序,以cDNA為模板進行。C. 目的基因的設置:有幾個目的基因和目的基因的名稱。D. 樣品的設置:包括哪個是實驗組,哪個是對照組。以及負對照的設置和生物重復的設置。E. 對照組和內參基因的設置:這個是為后面的定量做準備F. 反應程序的設置:PCR反應程序的設置要根據不同公司的MasterMix。比如BioTeke的95℃ 2分鐘就可以DNA聚合酶(ABI的需要10 分鐘)。循環(huán)反應是95℃15秒,60℃15秒的40個循環(huán)。溶解曲線程序采用儀器默認設置就可以。或者是儀器說明書上建議的程序。G. 反應體系的設置:A-G這五個步驟簡單設置好,可以保存,修改反應程序或者立刻進行反應。
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