CIRCLE-Seq,將gDNA打斷并環(huán)化,環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育,NGS測序檢測線性化的DNapian段,確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測序,成本相對較低,能檢測低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評估,安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評估服務(wù),幫助您挑選高度特異,脫靶率低的sgRNA進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。同時,我們也協(xié)助您檢測分析基因編輯后細(xì)胞樣品的脫靶情況,通過各種高通量測序檢測技術(shù),我們能準(zhǔn)確的分析全基因組范圍內(nèi)的脫靶位點(diǎn),推動CRISPR/Cas9技術(shù)在zhiliao藥物開發(fā)和臨床研究中的應(yīng)用。我們的優(yōu)勢:靈敏度高:能檢測低頻脫靶突變★準(zhǔn)確性高:檢測結(jié)果可通過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證★多種檢測...
插入突變風(fēng)險(xiǎn)評估一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中,這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點(diǎn)的偏好性;(2)載體的設(shè)計(jì),如增強(qiáng)子、啟動子等構(gòu)建元件的活性,影響鄰近基因的潛力;產(chǎn)生剪接突變體的潛在剪接位點(diǎn)或多聚腺苷酸信號等;(3)細(xì)胞載體拷貝數(shù);4)轉(zhuǎn)基因表達(dá)產(chǎn)物的功能活性(如與細(xì)胞生長調(diào)控相關(guān))和表達(dá)水平;5)靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性,這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)。如何降低脫靶效應(yīng)?選擇特異的gRNA; 使用RNP; 使...
誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn),在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此,應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成致瘤性試驗(yàn)。若設(shè)計(jì)科學(xué)合理,能夠滿足評價要求,也可在持續(xù)時間足夠長的毒性研究中評估致瘤性風(fēng)險(xiǎn)。體內(nèi)致瘤性試驗(yàn)建議采用摻入未分化iPS細(xì)胞的細(xì)胞產(chǎn)品作為陽性對照,以確認(rèn)實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的靈敏度。如果iPS細(xì)胞設(shè)計(jì)了機(jī)制以降低致瘤風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)在體內(nèi)試驗(yàn)中確認(rèn)/驗(yàn)證此類機(jī)制的功能 脫靶檢測技術(shù)是一系列針對CRISPR/Cas9系統(tǒng)作用機(jī)制研發(fā)的用于確定CR...
改進(jìn)Cas變體使用SpCas9和SaCas9 變體:已研發(fā)出諸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多種Cas變體,可降低脫靶效應(yīng)。改進(jìn)的Cas9同源物具有更廣的PAM功能和特異性:實(shí)驗(yàn)表明Cpf1、CRISPR-Cpf1-RNP可降低脫靶效應(yīng)。CRISPR 遞送方法:基于病毒的遞送方法:腺病毒 (AdV) 顯示出整合到靶細(xì)胞基因組中的微弱潛力,這一特征有利于限制脫靶效應(yīng)。然而,AdVs 會引發(fā)免疫反應(yīng),目前還不能完全排除它與宿主基因組整合的可能性。非病毒遞送...
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點(diǎn),可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點(diǎn)附近的原基因等,進(jìn)而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險(xiǎn),例如,國外已有多項(xiàng)研究報(bào)告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細(xì)胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對于存在此類風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品,有必要進(jìn)行長期隨訪臨床研究以評估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。脫靶檢測服務(wù),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測效率高...
CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn),不論哪種CRISPR系統(tǒng),都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象,CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過10年,期間迅速取代TALEN和ZFN,成為學(xué)術(shù)界通用的基因編輯技術(shù),也徹底改變了我們的生物學(xué)研究方法。為提高CRISPR技術(shù)的安全性,特別是往臨床應(yīng)用發(fā)展時的安全性問題,研究者們一直以提高靶位點(diǎn)的編輯效率和準(zhǔn)確性,同時降低脫靶位點(diǎn)編輯發(fā)生概率為目標(biāo),來優(yōu)化CRISPR技術(shù)。另一方面,研究者們也開發(fā)了大量檢測方法,用于檢測CRISPR的靶向風(fēng)險(xiǎn)和脫靶風(fēng)險(xiǎn),用于早期sgRNA序列...
基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無優(yōu)先異常增殖。對于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細(xì)胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。脫靶檢測安全性評價,推薦唯可生物,...
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對整個行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來,基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等?!彪S著脫靶影響因素、降低策略及脫靶檢測技術(shù)研究的不斷深入,未來CRISPR/Cas9系統(tǒng)將在更多領(lǐng)域造福人類。廣州種子脫靶檢測評估檢測...
細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性,同時也會帶來新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時,除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評價技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外,還應(yīng)具體問題具體分析,基于產(chǎn)品特點(diǎn)和目前已有的科學(xué)認(rèn)知,結(jié)合擬定適應(yīng)癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮,科學(xué)合理的設(shè)計(jì)和實(shí)施非臨床研究,充分表征產(chǎn)品的藥理學(xué)、毒理學(xué)和藥代動力學(xué)特征。在進(jìn)行獲益風(fēng)險(xiǎn)評估時,還應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注由非臨床向臨床過渡時非臨床研究的局限性和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測的不確定性??梢耘c靶基因之外的其他基因作用...
檢測方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過驗(yàn)證,并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年栃院完幮詫φ眨划?dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽性的比例超出預(yù)期范圍時,應(yīng)開展克隆性生長的評估。如果存在優(yōu)勢克隆或單克隆生長,應(yīng)在不超過3個月的時間內(nèi)再次檢測確認(rèn),并盡快開展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整合位點(diǎn)確定后,應(yīng)與人類基因組數(shù)據(jù)庫及基因組的其他數(shù)據(jù)庫等進(jìn)行比較,確定整合位點(diǎn)的基因功能,評估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽性細(xì)胞的克隆性生長,或檢測發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近,應(yīng)縮短檢測間隔至不超過3個月并密切監(jiān)測惡性liu征兆,直至檢測不到基因zhiliao載體。檢測脫靶效應(yīng)比較好的方法:C...
如何檢測脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測結(jié)合PCR檢測法,利用脫靶預(yù)測軟件預(yù)測潛在的脫靶位點(diǎn),PCR擴(kuò)增預(yù)測的脫靶位點(diǎn),利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預(yù)測。全基因組測序,一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法,需要選擇適當(dāng)?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變,數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點(diǎn),進(jìn)一步基因擴(kuò)增驗(yàn)證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs,Indel...
由于設(shè)計(jì)的sgRNA會與非靶點(diǎn)DNA序列錯配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測序,通過生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點(diǎn)再檢測的思路;與其他的評估方法相比,GUIDE-seq更...
2022年2月下旬,在醫(yī)麥客舉辦的年度盛會——“蓄力前行,助航新生——2021 CSGCT基因與細(xì)胞zhiliao醫(yī)學(xué)峰會”期間,唯可生物創(chuàng)始人兼CEO-吳寧博士分享了唯可生物在基因zhiliao賽道針對安全性展開的技術(shù)服務(wù),讓在場行業(yè)大咖和觀眾真正領(lǐng)會到ISA(integration site analysis,整合位點(diǎn)插入分析)領(lǐng)域國際金標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)的優(yōu)勢,以及基因編輯定量脫靶檢測、載體拷貝數(shù)檢測、載體質(zhì)量控制等多項(xiàng)檢測技術(shù)的行業(yè)意義。吳寧博士畢業(yè)于德國海德堡大學(xué),德國國家aizheng研究中心(DKFZ),并于2021年3月同幾位合伙人聯(lián)合創(chuàng)立了上海唯可生物科技有限公司。其創(chuàng)始團(tuán)隊(duì)擁有的檢測...
先導(dǎo)編輯器:CBE和ABE組合使用可以有效地進(jìn)行4種堿基轉(zhuǎn)換(C→T, G→A, A→G, T→C),而無需產(chǎn)生DSB,然而除了這4種堿基轉(zhuǎn)換,對另外8種堿基轉(zhuǎn)換(C→A, C→G, G→C, G→T, A→C, A→T, T→A, T→G)以及堿基的插入和缺失,依然缺乏有效的研究工具。先導(dǎo)編輯器(Prime Editor, PE),PE在不依賴DSB和供體DNA的條件下便可有效實(shí)現(xiàn)所有12種堿基轉(zhuǎn)換,此外還能有效實(shí)現(xiàn)多堿基的精細(xì)插入(較多可插入44bp)和刪除(較多刪除80bp)。> 抗CRISPR蛋白??笴RISPR(Acr)蛋白是天然的CRISPR/Cas系統(tǒng)抑制劑,由各種可移動遺傳元件...
基因編輯定量脫靶檢測:基因編輯定量脫靶檢測,使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點(diǎn)。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。.基于PCR的檢測唯可生物采用LTA-PCR方法分析基因組編輯引起的靶向和非靶向整合。1.方便地檢測脫靶目標(biāo)變化和隨機(jī)性2.適用于解決監(jiān)管機(jī)構(gòu)提出的具體問題3.定制化生物信息學(xué)分析基于NGS的檢測唯可生物使用靶向富集測序(TES)進(jìn)行全基因組檢測和定量靶向和非靶向改變。我們可在一次反應(yīng)中經(jīng)濟(jì)高效...
臨床研究人群,如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),需要開展長期隨訪觀察時,所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長期隨訪臨床研究。在設(shè)計(jì)長期隨訪臨床研究的方案時,應(yīng)考慮目標(biāo)受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來說,當(dāng)臨床研究人群的某些特征(如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物)可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時,會影響長期隨訪觀察在評估和減輕受試者風(fēng)險(xiǎn)方面的效用;而在病情較輕或較局限,合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中,通過長期隨訪觀察...
如何檢測脫靶效應(yīng)?在gRNA修飾中,截短的sgRNA是一種減少脫靶效應(yīng)的簡單方法,并且基于RNP的遞送在大多數(shù)情況下適用于獲得更高的目標(biāo)活性。此外,選擇合適的Cas變體對于減少脫靶效應(yīng)也至關(guān)重要。但選擇合適的脫靶檢測工具,也是重中之重。脫靶預(yù)測結(jié)合PCR檢測法,利用脫靶預(yù)測軟件預(yù)測潛在的脫靶位點(diǎn),PCR擴(kuò)增預(yù)測的脫靶位點(diǎn),利用直接測序或酶切法檢測脫靶情況。操作簡便、成本低偏倚性預(yù)測。全基因組測序,一種通過高通量測序檢測脫靶突變的方法,需要選擇適當(dāng)?shù)膮⒖蓟蚪M過濾背景突變,數(shù)據(jù)比對分析獲得含有PAM基序的潛在修飾位點(diǎn),進(jìn)一步基因擴(kuò)增驗(yàn)證其突變情況。高通量全基因組范圍檢測可檢測SNPs,Indel...
CRISPR/Cas9的問題:和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣,CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標(biāo)位點(diǎn)發(fā)生切割,引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細(xì)胞的基本功能,帶來不可預(yù)控的嚴(yán)重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)?gRNA的GC含量:gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性,因?yàn)檩^高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA:RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響,位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優(yōu)先選...
CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段,然后首尾相連成環(huán)狀DNA,這種方法很好地避免了DNA隨機(jī)斷裂造成的背景噪聲。實(shí)驗(yàn)的第二步是用Cas9切割環(huán)狀DNA,再連上接頭并進(jìn)行雙端測序,這樣就可以在一次測序中同時獲取切割位點(diǎn)的兩側(cè)序列,彌補(bǔ)了SITE-seq的另一個缺點(diǎn)。CIRCLE-seq從總體上來說要優(yōu)于SITE-seq,但是將基因組DNA隨機(jī)打斷后成環(huán)的效率并不高,所以同一作者在3年后發(fā)表了CHANGE-seq,用T...
改進(jìn)Cas變體使用SpCas9和SaCas9 變體:已研發(fā)出諸如SpCas9-Nickase、dCas9 、dCas9–FokI、xCas9、Cas9-NG、evoCas9、SpCas9 – HFI、eSpCas9和Hypa-Cas9等多種Cas變體,可降低脫靶效應(yīng)。改進(jìn)的Cas9同源物具有更廣的PAM功能和特異性:實(shí)驗(yàn)表明Cpf1、CRISPR-Cpf1-RNP可降低脫靶效應(yīng)。CRISPR 遞送方法:基于病毒的遞送方法:腺病毒 (AdV) 顯示出整合到靶細(xì)胞基因組中的微弱潛力,這一特征有利于限制脫靶效應(yīng)。然而,AdVs 會引發(fā)免疫反應(yīng),目前還不能完全排除它與宿主基因組整合的可能性。非病毒遞送...
基因編輯定量脫靶檢測:基因編輯定量脫靶檢測,使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計(jì)核酸酶進(jìn)行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點(diǎn)。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。.基于PCR的檢測唯可生物采用LTA-PCR方法分析基因組編輯引起的靶向和非靶向整合。1.方便地檢測脫靶目標(biāo)變化和隨機(jī)性2.適用于解決監(jiān)管機(jī)構(gòu)提出的具體問題3.定制化生物信息學(xué)分析基于NGS的檢測唯可生物使用靶向富集測序(TES)進(jìn)行全基因組檢測和定量靶向和非靶向改變。我們可在一次反應(yīng)中經(jīng)濟(jì)高效...
國內(nèi)外基因zhiliao產(chǎn)品開展的非臨床研究、長期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn),都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。通常認(rèn)為,很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等)有基因組整合潛力,需要通過長期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn);根據(jù)目前的認(rèn)識和研究數(shù)據(jù),質(zhì)粒、痘病毒、腺病毒和腺相關(guān)病毒(AAV)等載體的基因zhiliao產(chǎn)品整合風(fēng)險(xiǎn)較低,國際上開展的臨床試驗(yàn)中也表現(xiàn)出較低的遲發(fā)性不良反應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)載體或基因zhiliao產(chǎn)品原有的風(fēng)險(xiǎn)特征增加時,例如經(jīng)過修飾以攜帶基因組編輯成分的質(zhì)?;蚋淖兘oyaofang式以...
對基于慢病毒/逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的基因zhiliao產(chǎn)品,如出現(xiàn)與可復(fù)制xingbing毒可能相關(guān)的不良事件,還應(yīng)開展可復(fù)制xingbing毒(replicablecompetentlentivirus/retrovirus,RCL/RCR)的檢測。關(guān)于基因編輯產(chǎn)品的特殊考慮基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險(xiǎn),量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性,或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給yaofang式遞送,長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)...
細(xì)胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學(xué)特性,同時也會帶來新的安全性風(fēng)險(xiǎn),如基因編輯脫靶風(fēng)險(xiǎn)、載體插入突變風(fēng)險(xiǎn)、載體重組風(fēng)險(xiǎn)、表達(dá)的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風(fēng)險(xiǎn)等。在制定非臨床研究計(jì)劃時,除參考《細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品研究與評價技術(shù)指導(dǎo)原則》(試行)中的對細(xì)胞zhilliao產(chǎn)品的一般要求外,還應(yīng)具體問題具體分析,基于產(chǎn)品特點(diǎn)和目前已有的科學(xué)認(rèn)知,結(jié)合擬定適應(yīng)癥、患者人群、給藥途徑和給yaofang案等方面的考慮,科學(xué)合理的設(shè)計(jì)和實(shí)施非臨床研究,充分表征產(chǎn)品的藥理學(xué)、毒理學(xué)和藥代動力學(xué)特征。在進(jìn)行獲益風(fēng)險(xiǎn)評估時,還應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注由非臨床向臨床過渡時非臨床研究的局限性和風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測的不確定性。值得收藏的CRISPR脫靶檢測...
CIRCLE-seq原理。細(xì)胞內(nèi)檢測方法由于提純的基因組已經(jīng)消化去除了組蛋白,結(jié)構(gòu)較細(xì)胞內(nèi)的染色質(zhì)更為松散,理論上容易找到更多的脫靶位點(diǎn)。為捕獲CRISPR在細(xì)胞內(nèi)工作時真實(shí)發(fā)生的脫靶切割,研究者們也設(shè)計(jì)了一些細(xì)胞內(nèi)的脫靶位點(diǎn)檢測方法。1) Guide-seqCRISPR造成DNA雙鏈斷裂后,由于DNA修復(fù)機(jī)制的存在,斷裂處很快就會重新連接,這時候提純基因組DNA很難保留CRISPR造成的DNA斷裂位點(diǎn)。所以為了記錄細(xì)胞內(nèi)真實(shí)的CRISPR脫靶切割,研究者們設(shè)計(jì)了Guide-seq[10],利用NHEJ的DNA修復(fù)機(jī)制,將一段雙鏈短核苷酸序列(dsODN)連接到CRISPR造成的DNA雙鏈斷裂...
CRISPR/Cas系統(tǒng)是細(xì)菌和古細(xì)菌在不斷進(jìn)化的過程中產(chǎn)生的適應(yīng)性免疫防御機(jī)制,它應(yīng)用CRISPR RNA(crRNA)以堿基互補(bǔ)的形式引導(dǎo)相應(yīng)的Cas蛋白識別入侵的外源基因組,并對其DNA進(jìn)行剪切,用以保護(hù)自身的基因組免受外源核酸如噬菌體、病毒等的干擾和破壞。經(jīng)過人為改造后,可在真核細(xì)胞中實(shí)現(xiàn)高度靈活且特異的基因組編輯,通過設(shè)計(jì)特異性向?qū)NA(Single guide RNA, sgRNA)序列與靶序列進(jìn)行堿基配對,從而引導(dǎo)Cas蛋白結(jié)合到靶序列處,行使DNA切割功能,然后利用細(xì)胞的非同源性末端連接(Non-homologous end joining, NHEJ)或同源重組(Homol...
基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風(fēng)險(xiǎn),量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性,或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。在開發(fā)過程中應(yīng)同時關(guān)注基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細(xì)胞中整合位點(diǎn)及表達(dá)。評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,評估插入突變(插入位點(diǎn)、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點(diǎn)。非臨床研究是藥物開發(fā)的重要環(huán)節(jié)之一。種子基因脫靶檢測多少錢?江蘇種子脫靶檢測CROCRISPR/C...
通常不需要進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的遺傳毒性組合試驗(yàn),但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點(diǎn)、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等,評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進(jìn)基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發(fā)生情況,并檢測隨后可能發(fā)生的異常細(xì)胞行為;評估插入突變(插入位點(diǎn)、插入拷貝數(shù)等)引起的遺傳毒性風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時,需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點(diǎn)。如何檢測是否發(fā)生脫靶?北京種子基因脫靶檢測安全性評價不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體...
自基因zhiliao出現(xiàn)之日起,安全性問題就隨之產(chǎn)生了,并成為阻礙基因zhiliao研發(fā)的一大障礙,吳寧博士認(rèn)為:“基因zhiliao產(chǎn)品的研發(fā)和上市,安全性會將是一個非常重要考量。如果一款產(chǎn)品它安全性有問題的話,在市場化道路上就會受到很大影響。尤其是基因zhiliao,目前處于起始階段,一旦出現(xiàn)不良事件,很有可能對整個行業(yè)都會產(chǎn)生致命打擊。具體說來,基因zhiliao的安全性問題主要涉及基因插入突變、脫靶、生物分布和持久性、潛伏再jihuo以及潛在免疫原性等?!比绾螜z測是否發(fā)生脫靶?廣州種子基因脫靶檢測安全性評價Guide-seq原理圖,Discover-seq細(xì)胞內(nèi)的脫靶切割一般無法直接捕...
近幾年,細(xì)胞和基因zhiliao(cell & gene therapy,CGT)領(lǐng)域發(fā)展迅猛,在多個方向取得了重大突破,以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細(xì)胞療法攻克了一部分血液瘤,多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhiliao方案。另一方面,基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進(jìn)展迅速,較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市(CRISPR Therapeutics CTX001),體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯的臨床數(shù)據(jù)(Intellia Therapeutics NTLA-2001),使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細(xì)胞療...