RNA病毒二代測序分析多少錢

來源: 發(fā)布時間:2021-08-26

探普生物進(jìn)行病毒基因組測序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒基因組測序非常簡單,簡而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項(xiàng)目啟動款,探普生物啟動項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測序報(bào)告;5)客戶支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項(xiàng)目結(jié)題。探普生物對病毒的全基因組進(jìn)行測序是基于探普的專有流程,樣本要求非常低,不要求粒子純化。RNA病毒二代測序分析多少錢

能實(shí)現(xiàn)對病毒的全基因組進(jìn)行測序的技術(shù)手段:早期在高通量測序技術(shù)普及之前,對病毒的全基因組進(jìn)行測序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測序獲得全基因組序列。Sanger測序準(zhǔn)確度高,讀長很長,但與此同時,擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用,該方法對于大量基因組的測序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對于研究者一直是一個困擾。高通量測序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對性的研發(fā)和測試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對病毒的全基因組進(jìn)行測序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評。DNA全基因組病毒測序排行當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測序獲得全基因組序列。

深度測序技術(shù)對經(jīng)濟(jì)市場具有的影響:未來社會的創(chuàng)新驅(qū)動將由信息技術(shù)向心理社會健康方面轉(zhuǎn)移??梢灶A(yù)見,全球老年化社會到來后的經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場將是健康行業(yè),而以基因測序預(yù)測健康和臨床準(zhǔn)確分型的市場將會越來越大。深度測序相關(guān)的經(jīng)濟(jì)市場有兩個方面。一是測序儀器和技術(shù)相關(guān)的市場,二是測序應(yīng)用市場的競爭。一個顯見的例子是,近年來深度測序技術(shù)促進(jìn)了對肺病的進(jìn)一步認(rèn)識和分型,更多的位點(diǎn)突變?nèi)鏏LK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陸續(xù)發(fā)現(xiàn),多基因檢測肺病致病驅(qū)動基因?qū)︶t(yī)生準(zhǔn)確選擇靶向藥物十分重要。以肺病中常見的EGFR突變型為例,對于敏感性基因突變(19Del+L858R),第1代靶向藥物(如易瑞沙等)可以進(jìn)行良好的調(diào)整和控制;但是對于耐藥性基因突變(T790M),則需要第三代靶向藥物(AZD9291)才有較好的臨床效果。不久的將來,病癥患者將獲得更具個性化的藥物,從而達(dá)到準(zhǔn)確醫(yī)療。

病毒全基因組測序定:探普生物對病毒的全基因組進(jìn)行測序的實(shí)驗(yàn)基于二代測序技術(shù)。樣本經(jīng)過核酸純化-文庫構(gòu)建-生物信息學(xué)分析這3大基本流程后轉(zhuǎn)換成了序列數(shù)據(jù)。先,在核酸純化環(huán)節(jié),探普提供專門針對性的核酸純化樣本指南,以提高目的物種的核酸純度和得率,與此同時探普生物也提供核酸純化服務(wù)。第二,文庫構(gòu)建環(huán)節(jié),樣本的核酸具備濃度低,總量少的特點(diǎn)。探普生物專門針對這一點(diǎn)開發(fā)了超微量核酸文庫構(gòu)建,可以將0.01ng/μl甚至更低濃度的核酸構(gòu)建成測序文庫。第三,生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)。生存環(huán)境和狀態(tài)決定了對病毒的全基因組進(jìn)行測序的下機(jī)數(shù)據(jù)一般都伴隨大量的宿主和其他微生物的數(shù)據(jù)。探普生物基于該特點(diǎn),優(yōu)化了自有數(shù)據(jù)庫,搭載了專門用的的生物信息學(xué)分析流程,可處理復(fù)雜背景下的目標(biāo)物種序列。全基因組測序可以檢測個體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。

高通量基因組測序中,測序深度和覆蓋度指的是:測序深度是指測序得到的總堿基數(shù)與待測基因組大小的比值。假設(shè)一個基因大小為2M,測序深度為10X,那么獲得的總數(shù)據(jù)量為20M。覆蓋度是指測序獲得的序列占整個基因組的比例。由于基因組中的高GC、重復(fù)序列等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的存在,測序終拼接組裝獲得的序列往往無法覆蓋有所的區(qū)域,這部分沒有獲得的區(qū)域就稱為。例如一個細(xì)菌基因組測序,覆蓋度是98%,那么還有2%的序列區(qū)域是沒有通過測序獲得的。病毒全基因組測序產(chǎn)品特點(diǎn):基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺,致力于解決臨床的每一個疑問。杭州病毒測序分析診斷

全基因組測序的覆蓋面廣。RNA病毒二代測序分析多少錢

第二代測序技術(shù)的發(fā)展:第二代測序技術(shù)(nextgene-rationsequencing,NGS)發(fā)展迅猛,與Sanger測序技術(shù)相比,NGS是一種能一次對幾十萬到幾百萬的DNA分子進(jìn)行序列測定的高通量的測序技術(shù),這種高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進(jìn)行細(xì)致全貌地分析成為可能,因此又被稱為深度測序(deepsequencing).相比傳統(tǒng)的個體基因組測序,NGS使得測序價(jià)格日益廉價(jià),并且在生物信息學(xué)軟件的輔助下,可以將大量不同基因片段的信息連接起來進(jìn)行基因組組裝,完成生物的基因組測序,這種新的測序技術(shù)革新了植物病毒的診斷方法,對于病毒的流行病學(xué)和生態(tài)學(xué)研究起到了非常重要的推動作用。RNA病毒二代測序分析多少錢