浙江PRM定量蛋白質組學主要技術

來源: 發(fā)布時間:2022-05-28

蛋白質組學植物篇樣品寄樣要求:植物相較于動物,蛋白占比不高,所以送樣在量上面的要求會多一些,推薦送500mg以上的量可以確保實驗能夠提取到充足的蛋白。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的,200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質沖洗干凈,去除掉多余的組織。盡量能夠保證樣本的形態(tài)和純度,不推薦用錫紙包裹,放在EP管中使其形態(tài)完整為比較好。用液氮急速冷凍5min后置于-80℃環(huán)境中保存,送樣時需要添加干冰。蛋白質組學技術在農業(yè)生物科研領域的應用為作物生長發(fā)育、病蟲害防治、遺傳育種、等方面發(fā)揮重要的作用。浙江PRM定量蛋白質組學主要技術

蛋白質組學介紹:蛋白質組學,指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。研究的內容主要包括:組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質的豐度、蛋白質活性、蛋白質的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構。蛋白質組主要通過蛋白質雙向電泳、氨基酸序列測定、質譜、生物信息等方法,研究某個基因組對應的所有蛋白質特征,包括蛋白質含量、亞細胞定位、活性以及蛋白修飾等內容。廣東外泌體蛋白質組學檢測價格蛋白質組研究有助于了解蛋白的結構、細胞的功能、生命的本質及活動規(guī)律。

常用的定量蛋白質組學技術方法有以下幾類:非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術:Label free定量蛋白組學技術是通過液質聯(lián)用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據,比較不同樣品中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。TMT定量蛋白組學技術:這種技術采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質表達水平的差異。

蛋白質組學與基因組學的差異:蛋白質組和基因組(genome)在概念上有相關性,某一個蛋白質組的蛋白質是由其基因組所編碼的,然而蛋白質組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別?;蚪M在所有的細胞中幾乎都是完整的,與之不同,蛋白質組具有很高的細胞和組織特異性,不同的細胞組織表達不同的蛋白質組。蛋白質組的復雜性也遠遠高于基因組,這是因為一個基因≠一個轉錄產物≠一個蛋白質。比如據估計人的基因組由30000個基因組成,經mRNA剪切和蛋白質翻譯后修飾將產生20萬~200萬個蛋白質。由于不同的轉錄起始和mRNA剪切使同一基因產生了不同的轉錄產物。同樣由于不同的翻譯起始,一個mRNA可以翻譯成不同的蛋白質。蛋白質組學的分析主要指蛋白的生信分析,依賴于數據庫的建立。

蛋白質組學定義:蛋白質組學(proteomics),指對某一基因組所表達的所有蛋白質及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究,以期望在蛋白質水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網絡。研究的內容主要包括:組成蛋白質一級結構氨基酸的序列特征、蛋白質的豐度、蛋白質活性、蛋白質的修飾、亞細胞定位和三維結構、蛋白質之間的相互作用以及對蛋白質的高階復合物結構。蛋白質組學的研究方法主要有:蛋白質雙向電泳、氨基酸序列測定(包括N端測序和C端測序)、質譜、生物信息學。iTRAQ定量是目前定量蛋白質組學應用比較普遍的技術。廣州新型修飾蛋白組學服務

蛋白質組研究是對基因組研究的重要補充。浙江PRM定量蛋白質組學主要技術

蛋白質組學技術發(fā)展方面:蛋白質組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術并存,各有優(yōu)勢和局限的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強調各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質的不同特征。另外,蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術新方法的活水之源,特別是,蛋白質組學與其它大規(guī)??茖W如基因組學,生物信息學等領域的交叉,構成組學(omics)生物技術研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(System Biology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。浙江PRM定量蛋白質組學主要技術