質譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析;通過質譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。蛋白質修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙?;?、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化。蛋白質乙酰化修飾組學分析方法
蛋白質糖基化修飾組學技術:糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質組學中應用普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結合蛋白質,能專一識別某一特殊結構的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結合,它們與糖鏈可逆非共價結合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質經(jīng)過酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除連接在天冬酰胺殘基(Asn)上的糖鏈。哈爾濱丙?;揎椀鞍踪|組學有哪些類型蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。
蛋白質翻譯后修飾組學:蛋白質翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質的物理、化學性質,進而影響蛋白質的空間構象和活性狀態(tài)、亞細胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質-蛋白質相互作用。蛋白質翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導致多種疾病的發(fā)生。質譜可以分辨蛋白質修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進行鑒定和定量。
蛋白質有哪些翻譯后修飾?作用機制和生物學功能是什么?前體蛋白是沒有活性的,常常要進行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學修飾和剪切。當合成蛋白質時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質。蛋白質的翻譯后蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)會附在蛋白質上從而改變蛋白質的化學性質,或是造成結構的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質的功能。再者,酶可以從蛋白質的N末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。蛋白質磷酸化修飾的免疫印跡技術優(yōu)點:能夠特異鑒定單個磷酸化位點。
蛋白翻譯后修飾檢測:由于PTMs在基礎生物學以及疾病發(fā)病機理中的重要性,因此非常需要對蛋白質的翻譯后修飾進行檢測。對蛋白翻譯后修飾進行研究時通常需要富集步驟,因為這些翻譯后修飾的蛋白質相對含量較低。大多數(shù)PTMs的檢測方法與富集策略結合在一起開發(fā),以提供比較好的機會來識別、驗證和研究蛋白翻譯后修飾的功能。但是,在檢測已有特異性翻譯后修飾抗體的修飾蛋白質時,可能不需要富集步驟。質譜技術,通過測定肽段的分子量可以對該肽段的翻譯后修飾情況進行檢測,并可以對翻譯后修飾蛋白進行定性和定量分析。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的定位。廣東蛋白質翻譯后修飾組學價錢
蛋白質糖基化是一種常見的蛋白質翻譯后修飾。蛋白質乙酰化修飾組學分析方法
蛋白質-蛋白質相互作用是蛋白質發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發(fā)生.在蛋白質的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?;?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這些修飾通常能改變蛋白質的電性,疏水性和空間結構等屬性,為與之結合的蛋白提供結合的錨定或產生位阻效應,像一把開關在時空上精確調控蛋白質-蛋白質相互作用的發(fā)生以及動態(tài)變化.結構研究表明,蛋白質之間的相互作用通常由臨近的幾個氨基酸殘基直接結合,替換該區(qū)域的氨基酸殘基,通常能破壞結合,使其失去部分功能或酶活性,可以針對性地開發(fā)和設計抑制劑,用于疾病的診療。蛋白質乙?;揎椊M學分析方法
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