定量蛋白質(zhì)組學分析(QuantitativeProteomics)是對一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進行精確鑒定和定量??捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白,結合生物信息學揭示細胞生理病理等功能,同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質(zhì)組學技術常見標記(Label)和非標記的(LabelFree)定量策略。定量蛋白質(zhì)組學技術常見的幾類主要包括:LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析。蛋白質(zhì)組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質(zhì)的常規(guī)、可靠、有效的技術。北京醫(yī)學蛋白質(zhì)組學費用
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術):應用:1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數(shù)據(jù)。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術特點:1.對質(zhì)譜儀器設備要求較高,色譜和質(zhì)譜需要同時有較好的穩(wěn)定性和重復性。2.需要有特殊的定量分析軟件。3.對樣品中蛋白質(zhì)總量要求較低,實驗周期短,實驗費用低。4.不需要額外并且昂貴的標記試劑,排除了標記過程帶入實驗誤差的風險,同時也不必考慮標記效率的問題。廣東新型修飾蛋白組學質(zhì)譜分析生物質(zhì)譜技術是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術。
蛋白組學樣本要求:常規(guī)組織:(心、肝、脾、肺、腎、腸、腦、肌肉等)PBS洗滌去除殘留血液和污染物,剔除無關的干擾組織(血管、脂肪、結締組織等);沖洗干凈,用組織剪或手術刀將組織分離成1cm3左右的小塊;液氮速凍5min,保存于-80℃。軟骨組織:PBS洗滌去除殘留血液和污染物;用手術刀將軟骨切成1cm3左右的小塊;液氮速凍5min,保存于-80℃。軟體動物(吸蟲等)PBS洗滌去除來自宿主的污染;液氮速凍5min,保存于-80℃。蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術):在非標記策略的定量模型中,主要涉及兩種不同的算法:其一,以肽段的色譜峰積分面積為基礎,通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度;其二,以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎,通過歸一化來表征被檢測蛋白質(zhì)的相對豐度。非標記技術認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率(Counts)與其在混合物中的豐度成正相關,因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度,通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個詞的組合。
定量蛋白質(zhì)組學技術:定量蛋白質(zhì)組學是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容,通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來,隨著非凝膠技術的發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(“Shotgun”proteomics)技術,特別是多維蛋白質(zhì)鑒定(MultidimensionalProteinIdentification,MudPIT)已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質(zhì)表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質(zhì)組學在醫(yī)學的研究應用:蛋白質(zhì)組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。深圳常規(guī)蛋白質(zhì)組學價格
蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。北京醫(yī)學蛋白質(zhì)組學費用
蛋白質(zhì)組學:蛋白質(zhì)組一詞,源于蛋白質(zhì)與基因組兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關于疾病發(fā)生,細胞代謝等過程的整體而全方面的認識。蛋白質(zhì)組的研究不只能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,那些世界范圍內(nèi)銷路*的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子。因此,蛋白質(zhì)組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。北京醫(yī)學蛋白質(zhì)組學費用
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